RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621941.1

5S_rRNA.18-201, humanhuman

BASIC

Gene 5S_rRNA, Length 110 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ITPR3Q14573 2671 aa-0.22□□□□□ -2.44
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HIVEP1P15822 2718 aa-0.22□□□□□ -2.44
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NDUFA1O15239 70 aa-0.22□□□□□ -2.44
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.22□□□□□ -2.44
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-0.22□□□□□ -2.44
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SACSQ9NZJ4 4579 aa-0.22□□□□□ -2.44
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.22□□□□□ -2.44
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 GPR98Q8WXG9 6306 aa-0.22□□□□□ -2.44
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CLTCL1P53675 1640 aa-0.23□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.23□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT1HP80294 61 aa-0.23□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TOMM5Q8N4H5 51 aa-0.23□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAH11Q96DT5 4516 aa-0.23□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NFAT5O94916 1531 aa-0.23□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TACC2O95359 2948 aa-0.24□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LAMA1P25391 3075 aa-0.24□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-0.24□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.24□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 KALRNO60229 2985 aa-0.24□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT4P47944 62 aa-0.24□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.25□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 STARD9Q9P2P6 4700 aa-0.25□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RELNP78509 3460 aa-0.25□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 COL12A1Q99715 3063 aa-0.27□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NBEAQ8NFP9 2946 aa-0.27□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 IQGAP2Q13576 1575 aa-0.27□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HERC1Q15751 4861 aa-0.27□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.27□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 A0A0C4DFX4 3053 aa-0.27□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.27□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-0.28□□□□□ -2.45
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MUC17Q685J3 4493 aa-0.29□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.29□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LEAP2Q969E1 77 aa-0.3□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 UBR4Q5T4S7 5183 aa-0.31□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.31□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LAMA3Q16787 3333 aa-0.31□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa-0.32□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.32□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAH8Q96JB1 4490 aa-0.33□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 USH2AO75445 5202 aa-0.33□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT1EP04732 61 aa-0.33□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT1XP80297 61 aa-0.33□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TOMM7Q9P0U1 55 aa-0.33□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.33□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 HERC2O95714 4834 aa-0.34□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TEX15Q9BXT5 2789 aa-0.34□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SRCAPQ6ZRS2 3230 aa-0.34□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RYR1P21817 5038 aa-0.35□□□□□ -2.46
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 FRYQ5TBA9 3013 aa-0.35□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT1LQ93083 61 aa-0.35□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DEFB136Q30KP8 78 aa-0.36□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.37□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ATP7AQ04656 1500 aa-0.37□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CHD7Q9P2D1 2997 aa-0.37□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CMYA5Q8N3K9 4069 aa-0.37□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MYO9AB2RTY4 2548 aa-0.37□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DEFB4AO15263 64 aa-0.38□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-0.39□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa-0.39□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 C5orf42Q9H799 3197 aa-0.39□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-0.39□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MGAQ8IWI9 3026 aa-0.39□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-0.4□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LINC01590Q5TEZ4 76 aa-0.4□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNHD1Q96M86 4753 aa-0.4□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-0.4□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-0.41□□□□□ -2.47
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.41□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CEP295Q9C0D2 2601 aa-0.42□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT1HL1P0DM35 61 aa-0.42□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT1GP13640 62 aa-0.42□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-0.43□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CFAP46Q8IYW2 2715 aa-0.44□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 ITPR1Q14643 2758 aa-0.44□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 LRBAP50851 2863 aa-0.44□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa-0.44□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 DUOX1Q9NRD9 1551 aa-0.45□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.45□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 EYSQ5T1H1 3165 aa-0.45□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-0.46□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CSMD2Q7Z408 3487 aa-0.47□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT2AP02795 61 aa-0.47□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 RNF213Q63HN8 5207 aa-0.47□□□□□ -2.48
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-0.48□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MROH2BQ7Z745 1585 aa-0.48□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 MT1MQ8N339 61 aa-0.48□□□□□ -2.49
5S_rRNA.18-201ENST00000621941 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa-0.48□□□□□ -2.49
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms