RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDP1-208ENST00000613122 VPS13CQ709C8 3753 aa8.51□□□□□ -1.05
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH9Q9NYC9 4486 aa8.4□□□□□ -1.06
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH5Q8TE73 4624 aa8.36□□□□□ -1.07
CTDP1-208ENST00000613122 MT1HP80294 61 aa8.3□□□□□ -1.08
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.27□□□□□ -1.09
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH1Q9P2D7 4330 aa8.26□□□□□ -1.09
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH11Q96DT5 4516 aa8.18□□□□□ -1.1
CTDP1-208ENST00000613122 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP10-5P60370 271 aa8.17□□□□□ -1.1
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH10Q8IVF4 4471 aa8.16□□□□□ -1.1
CTDP1-208ENST00000613122 MT2AP02795 61 aa8.14□□□□□ -1.11
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH2Q9P225 4427 aa8.11□□□□□ -1.11
CTDP1-208ENST00000613122 DNHD1Q96M86 4753 aa8.04□□□□□ -1.12
CTDP1-208ENST00000613122 AKAP9Q99996 3911 aa8.03□□□□□ -1.12
CTDP1-208ENST00000613122 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.01□□□□□ -1.13
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CTDP1-208ENST00000613122 MT1FP04733 61 aa7.94□□□□□ -1.14
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH17Q9UFH2 4485 aa7.93□□□□□ -1.14
CTDP1-208ENST00000613122 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.93□□□□□ -1.14
CTDP1-208ENST00000613122 VPS13DQ5THJ4 4388 aa7.92□□□□□ -1.14
CTDP1-208ENST00000613122 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
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CTDP1-208ENST00000613122 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.83□□□□□ -1.16
CTDP1-208ENST00000613122 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.79□□□□□ -1.16
CTDP1-208ENST00000613122 FAT1Q14517 4588 aa7.77□□□□□ -1.17
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.76□□□□□ -1.17
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CTDP1-208ENST00000613122 SACSQ9NZJ4 4579 aa7.71□□□□□ -1.18
CTDP1-208ENST00000613122 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH3Q8TD57 4116 aa7.65□□□□□ -1.19
CTDP1-208ENST00000613122 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.62□□□□□ -1.19
CTDP1-208ENST00000613122 LCE3CQ5T5A8 94 aa7.58□□□□□ -1.2
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.51□□□□□ -1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SPRR2EP22531 72 aa7.5□□□□□ -1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SPRR2BP35325 72 aa7.5□□□□□ -1.21
CTDP1-208ENST00000613122 SPRR2AP35326 72 aa7.5□□□□□ -1.21
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.5□□□□□ -1.21
CTDP1-208ENST00000613122 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
CTDP1-208ENST00000613122 RYR3Q15413 4870 aa7.45□□□□□ -1.22
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.43□□□□□ -1.22
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CTDP1-208ENST00000613122 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa7.36□□□□□ -1.23
CTDP1-208ENST00000613122 ANK2Q01484 3957 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.35□□□□□ -1.23
CTDP1-208ENST00000613122 FAT3Q8TDW7 4589 aa7.32□□□□□ -1.24
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.3□□□□□ -1.24
CTDP1-208ENST00000613122 SPRR2DP22532 72 aa7.27□□□□□ -1.25
CTDP1-208ENST00000613122 KMT2AQ03164 3969 aa7.25□□□□□ -1.25
CTDP1-208ENST00000613122 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.24□□□□□ -1.25
CTDP1-208ENST00000613122 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
CTDP1-208ENST00000613122 MT1XP80297 61 aa7.22□□□□□ -1.25
CTDP1-208ENST00000613122 KIAA1109Q2LD37 5005 aa7.2□□□□□ -1.26
CTDP1-208ENST00000613122 LCE2BO14633 110 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDP1-208ENST00000613122 HERC1Q15751 4861 aa7.19□□□□□ -1.26
CTDP1-208ENST00000613122 RYR2Q92736 4967 aa7.16□□□□□ -1.26
CTDP1-208ENST00000613122 MT1BP07438 61 aa7.16□□□□□ -1.26
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CTDP1-208ENST00000613122 LYSTQ99698 3801 aa7.09□□□□□ -1.27
CTDP1-208ENST00000613122 MT1GP13640 62 aa7.08□□□□□ -1.28
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP12-4P60329 112 aa7.06□□□□□ -1.28
CTDP1-208ENST00000613122 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.05□□□□□ -1.28
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.03□□□□□ -1.28
CTDP1-208ENST00000613122 MYCBP2O75592 4640 aa6.99□□□□□ -1.29
CTDP1-208ENST00000613122 LCE2CQ5TA81 110 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDP1-208ENST00000613122 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.98□□□□□ -1.29
CTDP1-208ENST00000613122 HSPG2P98160 4391 aa6.97□□□□□ -1.29
CTDP1-208ENST00000613122 HERC2O95714 4834 aa6.94□□□□□ -1.3
CTDP1-208ENST00000613122 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDP1-208ENST00000613122 PKD1P98161 4303 aa6.88□□□□□ -1.31
CTDP1-208ENST00000613122 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.84□□□□□ -1.31
CTDP1-208ENST00000613122 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.77□□□□□ -1.33
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.73□□□□□ -1.33
CTDP1-208ENST00000613122 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.68□□□□□ -1.34
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CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.56□□□□□ -1.36
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDP1-208ENST00000613122 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDP1-208ENST00000613122 MT1EP04732 61 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDP1-208ENST00000613122 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.55□□□□□ -1.36
CTDP1-208ENST00000613122 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CTDP1-208ENST00000613122 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa6.51□□□□□ -1.37
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CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.5□□□□□ -1.37
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.46□□□□□ -1.37
CTDP1-208ENST00000613122 PKHD1P08F94 4074 aa6.46□□□□□ -1.38
CTDP1-208ENST00000613122 MT4P47944 62 aa6.41□□□□□ -1.38
CTDP1-208ENST00000613122 MT1MQ8N339 61 aa6.38□□□□□ -1.39
CTDP1-208ENST00000613122 MT3P25713 68 aa6.33□□□□□ -1.4
CTDP1-208ENST00000613122 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa6.31□□□□□ -1.4
CTDP1-208ENST00000613122 TNXBP22105 4242 aa6.3□□□□□ -1.4
CTDP1-208ENST00000613122 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
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