RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRM-205ENST00000577827 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.54□□□□□ -1.68
PTPRM-205ENST00000577827 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
PTPRM-205ENST00000577827 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-205ENST00000577827 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.51□□□□□ -1.69
PTPRM-205ENST00000577827 DNAH5Q8TE73 4624 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRM-205ENST00000577827 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRM-205ENST00000577827 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.48□□□□□ -1.69
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP10-12P60413 245 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRM-205ENST00000577827 DNAH2Q9P225 4427 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRM-205ENST00000577827 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.42□□□□□ -1.7
PTPRM-205ENST00000577827 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.41□□□□□ -1.7
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP12-3P60328 96 aa4.39□□□□□ -1.71
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PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.35□□□□□ -1.71
PTPRM-205ENST00000577827 CMYA5Q8N3K9 4069 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRM-205ENST00000577827 STARD9Q9P2P6 4700 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-205ENST00000577827 LRP1BQ9NZR2 4599 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-205ENST00000577827 SACSQ9NZJ4 4579 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRM-205ENST00000577827 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-205ENST00000577827 ANK2Q01484 3957 aa4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-205ENST00000577827 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRM-205ENST00000577827 FAT1Q14517 4588 aa4.25□□□□□ -1.73
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PTPRM-205ENST00000577827 FAT2Q9NYQ8 4349 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRM-205ENST00000577827 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.18□□□□□ -1.74
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PTPRM-205ENST00000577827 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.07□□□□□ -1.76
PTPRM-205ENST00000577827 MT2AP02795 61 aa4.06□□□□□ -1.76
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PTPRM-205ENST00000577827 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
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PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.88□□□□□ -1.79
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PTPRM-205ENST00000577827 RYR3Q15413 4870 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRM-205ENST00000577827 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRM-205ENST00000577827 LCE2CQ5TA81 110 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRM-205ENST00000577827 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.69□□□□□ -1.82
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PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.5□□□□□ -1.85
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PTPRM-205ENST00000577827 MT1EP04732 61 aa3.39□□□□□ -1.87
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PTPRM-205ENST00000577827 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRM-205ENST00000577827 HMCN2Q8NDA2 5059 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa3.25□□□□□ -1.89
PTPRM-205ENST00000577827 MT1MQ8N339 61 aa3.23□□□□□ -1.89
PTPRM-205ENST00000577827 SPRR2EP22531 72 aa3.22□□□□□ -1.89
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