RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561408.1

TMOD3-210, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 493 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-210ENST00000561408 A0A087WVE0 104 aa1.48□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1B0GV72 72 aa1.48□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 H3BMG7 143 aa1.48□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 P0C880 135 aa1.48□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa1.48□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP1.48□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 MT1LQ93083 61 aa1.48□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 TTTY13Q9BZ97 58 aa1.48□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 MT-ND4LP03901 98 aa1.47□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 C7orf65Q6ZTY9 151 aa1.47□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 PPDPFLQ8WWR9 84 aa1.47□□□□□ -2.17
TMOD3-210ENST00000561408 TIMM17BO60830 172 aa1.46□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 LINC01554Q52M75 96 aa1.46□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 C2orf91Q6ZV80 131 aa1.46□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 TCTE3Q8IZS6 198 aa1.46□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa1.45□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 K7EQZ3 153 aa1.45□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 PEA15Q15121 130 aa1.45□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 MUSTN1Q8IVN3 82 aa1.45□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 SEC11CQ9BY50 192 aa1.45□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 DPM2O94777 84 aa1.44□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 IGKCP01834 107 aa1.43□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 PLNP26678 52 aa1.43□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 SCGB1D4Q6XE38 83 aa1.43□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 C12orf57Q99622 126 aa1.43□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 TRGC2P03986 189 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 FABP2P12104 132 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 ANKRD29Q8N6D5 301 aa1.42□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 M0QZ58 72 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 NDUFB1O75438 58 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 TRACP01848 142 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 CCKP06307 115 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP12-3P60328 96 aa1.41□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP1.41□□□□□ -2.18
TMOD3-210ENST00000561408 VPS25Q9BRG1 176 aa1.4□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa1.38□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 hDV103S1A0JD37 113 aa1.38□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 J3KT08 172 aa1.38□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 LEPROTL1O95214 131 aa1.38□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 IFITM1P13164 125 aa1.38□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 FABP4P15090 132 aa1.38□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 CHCHD1Q96BP2 118 aaKnown RBP1.38□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 S100PP25815 95 aa1.37□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 RGS21Q2M5E4 152 aa1.37□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa1.37□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM254Q8TBM7 123 aa1.37□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 COPS9Q8WXC6 57 aa1.36□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 A0A0D9SG42 100 aa1.34□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1W2PPM0 123 aa1.34□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 H3BPC8 53 aa1.34□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 Q6ZQT0 140 aa1.34□□□□□ -2.19
TMOD3-210ENST00000561408 HCG22E2RYF7 251 aa1.33□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 BATFQ16520 125 aa1.33□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP6-2Q3LI66 62 aa1.33□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 NDUFC1O43677 76 aa1.32□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 C10orf95Q9H7T3 257 aa1.31□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 SNCGO76070 127 aa1.3□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 K7EP34 96 aa1.29□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa1.29□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1B0GW54 56 aa1.28□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 H0YGX0 51 aa1.28□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa1.28□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 MT-ATP8P03928 68 aa1.28□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 PMAIP1Q13794 54 aa1.28□□□□□ -2.2
TMOD3-210ENST00000561408 PHGR1C9JFL3 82 aa1.26□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 S100A6P06703 90 aa1.26□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 LINC01545Q5VT33 79 aa1.26□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 ORMDL1Q9P0S3 153 aa1.26□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP12-1P59990 96 aa1.25□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 ATOH7Q8N100 152 aa1.25□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 A0A1B0GX51 115 aa1.24□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM218A2RU14 115 aa1.24□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa1.24□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa1.24□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 C20orf197Q8N268 126 aa1.24□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 H3BT86 120 aa1.23□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 CASC2Q6XLA1 102 aa1.23□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 C9JAW5 83 aa1.22□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 DNAL4O96015 105 aa1.22□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 MT1AP04731 61 aa1.22□□□□□ -2.21
TMOD3-210ENST00000561408 TRAV7A0A075B6U4 112 aa1.21□□□□□ -2.22
TMOD3-210ENST00000561408 NREPQ16612 68 aa1.21□□□□□ -2.22
TMOD3-210ENST00000561408 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa1.2□□□□□ -2.22
TMOD3-210ENST00000561408 KRTDAPP60985 99 aa1.18□□□□□ -2.22
TMOD3-210ENST00000561408 TMEM258P61165 79 aa1.18□□□□□ -2.22
TMOD3-210ENST00000561408 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP1.17□□□□□ -2.22
TMOD3-210ENST00000561408 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa1.17□□□□□ -2.22
TMOD3-210ENST00000561408 ACYP1P07311 99 aa1.16□□□□□ -2.22
TMOD3-210ENST00000561408 HIST1H2BOP23527 126 aa1.15□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 HIST1H2BBP33778 126 aa1.15□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 FXYD2P54710 66 aa1.15□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 HIST1H2BDP58876 126 aa1.15□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 HIST1H2BCP62807 126 aa1.15□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 HIST2H2BEQ16778 126 aa1.15□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP1.15□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 HIST1H2BHQ93079 126 aa1.15□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 HIST1H2BNQ99877 126 aa1.15□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 HIST1H2BMQ99879 126 aa1.15□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 COA5Q86WW8 74 aa1.14□□□□□ -2.23
TMOD3-210ENST00000561408 BAALC-AS2P0C853 105 aa1.13□□□□□ -2.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.7 ms