RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 SPRR2AP35326 72 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-227ENST00000551441 KLKP1Q107X0 134 aa7.02□□□□□ -1.29
CS-227ENST00000551441 SPRR2FQ96RM1 72 aa7.01□□□□□ -1.29
CS-227ENST00000551441 BPY2O14599 106 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-227ENST00000551441 CASC2Q6XLA1 102 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-227ENST00000551441 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.99□□□□□ -1.29
CS-227ENST00000551441 CXCL6P80162 114 aa6.92□□□□□ -1.3
CS-227ENST00000551441 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-227ENST00000551441 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.88□□□□□ -1.31
CS-227ENST00000551441 A0A087WVE0 104 aa6.85□□□□□ -1.31
CS-227ENST00000551441 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.83□□□□□ -1.32
CS-227ENST00000551441 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.82□□□□□ -1.32
CS-227ENST00000551441 M0R143 59 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-227ENST00000551441 CRIPTQ9P021 101 aa6.81□□□□□ -1.32
CS-227ENST00000551441 TSTD3H0UI37 97 aa6.8□□□□□ -1.32
CS-227ENST00000551441 SPRR2DP22532 72 aa6.78□□□□□ -1.32
CS-227ENST00000551441 MT1XP80297 61 aa6.77□□□□□ -1.33
CS-227ENST00000551441 H3BT86 120 aa6.75□□□□□ -1.33
CS-227ENST00000551441 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
CS-227ENST00000551441 BATFQ16520 125 aa6.73□□□□□ -1.33
CS-227ENST00000551441 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.72□□□□□ -1.33
CS-227ENST00000551441 A8MUN3 132 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-227ENST00000551441 K7EP34 96 aa6.67□□□□□ -1.34
CS-227ENST00000551441 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-227ENST00000551441 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.65□□□□□ -1.34
CS-227ENST00000551441 PLAC4Q8WY50 150 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-227ENST00000551441 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.64□□□□□ -1.35
CS-227ENST00000551441 UBL5Q9BZL1 73 aa6.63□□□□□ -1.35
CS-227ENST00000551441 C9orf118A6NHY6 69 aa6.62□□□□□ -1.35
CS-227ENST00000551441 A0A1W2PPM0 123 aa6.61□□□□□ -1.35
CS-227ENST00000551441 KRTAP12-2P59991 146 aa6.6□□□□□ -1.35
CS-227ENST00000551441 NDUFC1O43677 76 aa6.59□□□□□ -1.35
CS-227ENST00000551441 H0YAA0 97 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-227ENST00000551441 TAX1BP3O14907 124 aa6.58□□□□□ -1.36
CS-227ENST00000551441 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.5□□□□□ -1.37
CS-227ENST00000551441 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.49□□□□□ -1.37
CS-227ENST00000551441 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
CS-227ENST00000551441 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-227ENST00000551441 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.48□□□□□ -1.37
CS-227ENST00000551441 R4GN34 69 aa6.46□□□□□ -1.38
CS-227ENST00000551441 P0C880 135 aa6.45□□□□□ -1.38
CS-227ENST00000551441 M0QZ58 72 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-227ENST00000551441 LINC01554Q52M75 96 aa6.43□□□□□ -1.38
CS-227ENST00000551441 ACYP1P07311 99 aa6.42□□□□□ -1.38
CS-227ENST00000551441 PRO0461Q9UI25 63 aa6.41□□□□□ -1.38
CS-227ENST00000551441 SMIM6P0DI80 62 aa6.39□□□□□ -1.39
CS-227ENST00000551441 H0Y9P7 68 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-227ENST00000551441 KRTAP10-12P60413 245 aa6.38□□□□□ -1.39
CS-227ENST00000551441 UQCRQO14949 82 aa6.3□□□□□ -1.4
CS-227ENST00000551441 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CS-227ENST00000551441 C20orf197Q8N268 126 aa6.28□□□□□ -1.4
CS-227ENST00000551441 ATOX1O00244 68 aa6.27□□□□□ -1.41
CS-227ENST00000551441 LINC00208Q96KT6 92 aa6.24□□□□□ -1.41
CS-227ENST00000551441 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
CS-227ENST00000551441 ETDBQ3ZM63 59 aa6.22□□□□□ -1.41
CS-227ENST00000551441 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.16□□□□□ -1.42
CS-227ENST00000551441 MT-ATP8P03928 68 aa6.15□□□□□ -1.42
CS-227ENST00000551441 F8W1H4 67 aa6.1□□□□□ -1.43
CS-227ENST00000551441 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.08□□□□□ -1.44
CS-227ENST00000551441 MP68P56378 58 aa6.07□□□□□ -1.44
CS-227ENST00000551441 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-227ENST00000551441 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-227ENST00000551441 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-227ENST00000551441 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.05□□□□□ -1.44
CS-227ENST00000551441 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-227ENST00000551441 DMAC1Q96GE9 116 aa6.04□□□□□ -1.44
CS-227ENST00000551441 MT1EP04732 61 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-227ENST00000551441 MT4P47944 62 aa6.02□□□□□ -1.45
CS-227ENST00000551441 OCR1Q9BZK8 76 aa6.01□□□□□ -1.45
CS-227ENST00000551441 HMCN1Q96RW7 5635 aa6□□□□□ -1.45
CS-227ENST00000551441 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.96□□□□□ -1.46
CS-227ENST00000551441 AHNAK2Q8IVF2 5795 aa5.95□□□□□ -1.46
CS-227ENST00000551441 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa5.92□□□□□ -1.46
CS-227ENST00000551441 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.9□□□□□ -1.46
CS-227ENST00000551441 LINC00643Q86TS7 51 aa5.88□□□□□ -1.47
CS-227ENST00000551441 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.87□□□□□ -1.47
CS-227ENST00000551441 H3BPC8 53 aa5.86□□□□□ -1.47
CS-227ENST00000551441 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.85□□□□□ -1.47
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa5.84□□□□□ -1.47
CS-227ENST00000551441 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.83□□□□□ -1.48
CS-227ENST00000551441 MT1GP13640 62 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-227ENST00000551441 ACYP2P14621 99 aa5.82□□□□□ -1.48
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
CS-227ENST00000551441 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.8□□□□□ -1.48
CS-227ENST00000551441 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.79□□□□□ -1.48
CS-227ENST00000551441 A0A0D9SG42 100 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-227ENST00000551441 PCP4L1A6NKN8 68 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-227ENST00000551441 MT1MQ8N339 61 aa5.77□□□□□ -1.49
CS-227ENST00000551441 PP632Q6XCG6 107 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-227ENST00000551441 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa5.76□□□□□ -1.49
CS-227ENST00000551441 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.75□□□□□ -1.49
CS-227ENST00000551441 SCGB1A1P11684 91 aa5.73□□□□□ -1.49
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-4Q6L8H1 288 aa5.7□□□□□ -1.5
CS-227ENST00000551441 MT1LQ93083 61 aa5.68□□□□□ -1.5
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa5.65□□□□□ -1.5
CS-227ENST00000551441 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.59□□□□□ -1.51
CS-227ENST00000551441 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa5.58□□□□□ -1.52
CS-227ENST00000551441 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-227ENST00000551441 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.53□□□□□ -1.52
CS-227ENST00000551441 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.5□□□□□ -1.53
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