RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491302.1

PTPRC-212, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRC, Length 648 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-212ENST00000491302 CFDP00746 253 aaPredicted RBP0.33□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa0.33□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV30A0A087WSZ9 112 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 PPP3R1P63098 170 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 SVBPQ8N300 66 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00472Q9H8W2 130 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 GNG8Q9UK08 70 aa0.32□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 MT1AP04731 61 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 IGLC1P0CG04 106 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 Q6JHZ5 121 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 UQCR10Q9UDW1 63 aa0.31□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 H3BQF6 201 aa0.3□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP0.3□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 LINC01590Q5TEZ4 76 aa0.3□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 S100A13Q99584 98 aa0.3□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa0.29□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 SFT2D2O95562 160 aa0.29□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 SNCAP37840 140 aa0.29□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf201Q7Z4U5 140 aa0.29□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 Q8IZM0 81 aa0.29□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa0.28□□□□□ -2.36
PTPRC-212ENST00000491302 S100A1P23297 94 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 CRIPTQ9P021 101 aa0.27□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 NDUFA1O15239 70 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 S100A10P60903 97 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 C6orf48Q9UBA6 75 aa0.26□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 SNRPGP15A8MWD9 76 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00587B1AMM8 73 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 GNG11P61952 73 aa0.25□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 MGPP08493 103 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa0.23□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa0.22□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP0.22□□□□□ -2.37
PTPRC-212ENST00000491302 F8WEM9 126 aa0.21□□□□□ -2.38
PTPRC-212ENST00000491302 SPRR1BP22528 89 aa0.21□□□□□ -2.38
PTPRC-212ENST00000491302 WHAMMP3Q1A5X7 153 aa0.21□□□□□ -2.38
PTPRC-212ENST00000491302 CMC2Q9NRP2 79 aa0.21□□□□□ -2.38
PTPRC-212ENST00000491302 TRAV21A0A0B4J279 112 aa0.18□□□□□ -2.38
PTPRC-212ENST00000491302 NAP1L6A6NFF2 107 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRC-212ENST00000491302 H3BQ15 152 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRC-212ENST00000491302 TRGV9Q99603 122 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRC-212ENST00000491302 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa0.17□□□□□ -2.38
PTPRC-212ENST00000491302 MANBALQ9NQG1 85 aa0.16□□□□□ -2.38
PTPRC-212ENST00000491302 IGLC2P0DOY2 106 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 PRO1933Q9H354 126 aa0.15□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa0.14□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 CEBPZOSA8MTT3 80 aa0.14□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 H3BVH4 76 aa0.14□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 S4R3F8 94 aa0.14□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 COX6CP09669 75 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM11AP58511 58 aa0.13□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 ARMS2P0C7Q2 107 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 NMSQ5H8A3 153 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 ALKAL2Q6UX46 152 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 A0A0G2JND7 137 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 TOMM7Q9P0U1 55 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 NMES1Q9C002 83 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 PRO1854Q9UHT4 67 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRC-212ENST00000491302 M0QZ58 72 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 IAPPP10997 89 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 C10orf113Q5VZT2 155 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 M0QY20 66 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 SPRR1AP35321 89 aa0.08□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 D6R8Y8 96 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 KRTDAPP60985 99 aa0.07□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 K7EQZ3 153 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 DEFB105AQ8NG35 78 aa0.05□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 CRIP1P50238 77 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 HSD52Q0P140 79 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 C12orf57Q99622 126 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 FXYD6Q9H0Q3 95 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 KCNQ1DNQ9H478 68 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 AP4S1Q9Y587 144 aa0.04□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 A0A087WVE0 104 aa0.03□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 GNG2P59768 71 aa0.03□□□□□ -2.4
PTPRC-212ENST00000491302 ACBD7Q8N6N7 88 aa0.03□□□□□ -2.4
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PTPRC-212ENST00000491302 LINC01546A6NGU7 62 aa0.02□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 C3orf79P0CE67 100 aa0.02□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 I3L3M4 83 aa0.01□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 K7EP34 96 aa0.01□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 MT-ATP8P03928 68 aa0.01□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP0.01□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 PDCD5O14737 125 aa0□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 SFTA2Q6UW10 78 aa0□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 SMIM2Q9BVW6 85 aa0□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 CACFD1Q9UGQ2 172 aa0□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 S100PP25815 95 aa-0.01□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-0.02□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa-0.03□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 FCER1GP30273 86 aa-0.03□□□□□ -2.41
PTPRC-212ENST00000491302 GNGT2O14610 69 aa-0.04□□□□□ -2.42
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