RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489450.1

RABGGTB-211, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 586 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BMG7 143 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 TAX1BP3O14907 124 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 ERC2-IT1O76042 136 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 DNAL4O96015 105 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 MT1BP07438 61 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 Q5XG85 94 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6JHZ5 121 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00575Q6W349 94 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRR4Q96PI1 79 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 PRO1933Q9H354 126 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 ORMDL1Q9P0S3 153 aa1.04□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 J3QR89 54 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 K7EP34 96 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 ACYP1P07311 99 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 COX7BP24311 80 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 RPL37P61927 97 aaKnown RBP1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 ANKRD29Q8N6D5 301 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM11BQ8TCY0 68 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 SMCR5Q8TEV8 140 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 CLEC2BQ92478 149 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 TTTY13Q9BZ97 58 aa1.03□□□□□ -2.24
RABGGTB-211ENST00000489450 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 H3BUT2 72 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SPAG11AQ6PDA7 123 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 TEN1Q86WV5 123 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 OR13C6PQ8NH95 151 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SS18L2Q9UHA2 77 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SPCS1Q9Y6A9 102 aa1.02□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 F8WEM9 126 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 K7ERU9 68 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 NCR3O14931 201 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 TCL1BO95988 128 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SPINK1P00995 79 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 RBM3P98179 157 aaKnown RBP1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZQY7 126 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 DSCR8Q96T75 97 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 IMUPQ9GZP8 106 aa1.01□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 C9JAW5 83 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 J3KT08 172 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 K7ERJ3 54 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 CCKP06307 115 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 BAALC-AS2P0C853 105 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 NPC2P61916 151 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 BATFQ16520 125 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 COX6B2Q6YFQ2 88 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 COA5Q86WW8 74 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 LIMD2Q9BT23 127 aa1□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 A8MUN3 132 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRR2EP22531 72 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRR2BP35325 72 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRR2AP35326 72 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 C1orf195Q5TG92 126 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 Q6ZQT0 140 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 UBL5Q9BZL1 73 aa0.99□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A1B0GV90 55 aa0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 H7C2G1 150 aa0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 ETDBQ3ZM63 59 aa0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00643Q86TS7 51 aa0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SIGMAR1Q99720 223 aa0.98□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SCGB1A1P11684 91 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM258P61165 79 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 HRCT1Q6UXD1 115 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 SMIM20Q8N5G0 67 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00472Q9H8W2 130 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 LINC00846Q9NV44 126 aa0.97□□□□□ -2.25
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFB1O75438 58 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 NREPQ16612 68 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 C9orf153Q5TBE3 101 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRR2FQ96RM1 72 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 C14orf132Q9NPU4 83 aa0.96□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 A0A087WSZ3 146 aa0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 FAM236CP0DP71 79 aa0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 SPRR2DP22532 72 aa0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 PRR15Q8IV56 129 aa0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 DEFB105AQ8NG35 78 aa0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 Q96NJ1 140 aa0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP0.95□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 A6NN06 94 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 HCG22E2RYF7 251 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 ATOX1O00244 68 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 TMEM254Q8TBM7 123 aa0.94□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 hDV103S1A0JD37 113 aa0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 UQCRQO14949 82 aa0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 NDUFC1O43677 76 aa0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP0.93□□□□□ -2.26
RABGGTB-211ENST00000489450 VPS25Q9BRG1 176 aa0.93□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16 ms