RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487939.1

PTEN-204, Transcript of phosphatase and tensin homolog, humanhuman

TSL 3

Gene PTEN, Length 477 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTEN-204ENST00000487939 C3P01024 1663 aa-1.81□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 RALGAPBQ86X10 1494 aa-1.82□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-1.82□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 TDRG1Q3Y452 100 aa-1.82□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 UBL5Q9BZL1 73 aa-1.82□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 KDM5DQ9BY66 1539 aa-1.82□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 DMDP11532 3685 aa-1.82□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 SMIM13P0DJ93 91 aa-1.83□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 CRIP1P50238 77 aa-1.83□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-1.83□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 C6orf48Q9UBA6 75 aa-1.83□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 PREX2Q70Z35 1606 aa-1.84□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 SPEGQ15772 3267 aa-1.84□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 A8MTW9 85 aa-1.84□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 SFTA3P0C7M3 94 aa-1.84□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 SPART-AS1P0CW21 52 aa-1.84□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa-1.84□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 MED14O60244 1454 aa-1.84□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 KIF21BO75037 1637 aa-1.84□□□□□ -2.7
PTEN-204ENST00000487939 FCER1GP30273 86 aa-1.85□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 UACAQ9BZF9 1416 aa-1.85□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 DIP2AQ14689 1571 aa-1.86□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 CLASP1Q7Z460 1538 aa-1.87□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 MADDQ8WXG6 1647 aa-1.88□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 FRYLO94915 3013 aa-1.88□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 RPS29P62273 56 aaKnown RBP-1.88□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-1.88□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 MT1FP04733 61 aa-1.89□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 CROCC2H7BZ55 1655 aa-1.9□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-1.9□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 DEFB121Q5J5C9 76 aa-1.9□□□□□ -2.71
PTEN-204ENST00000487939 PCNTO95613 3336 aa-1.91□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-1.91□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 DEFB136Q30KP8 78 aa-1.92□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 LEAP2Q969E1 77 aa-1.92□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 ST20Q9HBF5 79 aa-1.92□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 H3BUT2 72 aa-1.93□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 CEP350Q5VT06 3117 aa-1.94□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 ABCC6O95255 1503 aa-1.94□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-1.94□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 ADIRFQ15847 76 aa-1.94□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-1.95□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 TIAM1Q13009 1591 aa-1.95□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 DEFB114Q30KQ6 69 aa-1.96□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 ENHOQ6UWT2 76 aa-1.96□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 CENPEQ02224 2701 aa-1.96□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 CEP250Q9BV73 2442 aa-1.96□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 ALS2Q96Q42 1657 aa-1.96□□□□□ -2.72
PTEN-204ENST00000487939 ABCC1P33527 1531 aa-1.98□□□□□ -2.73
PTEN-204ENST00000487939 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-1.98□□□□□ -2.73
PTEN-204ENST00000487939 GLI2P10070 1586 aa-1.99□□□□□ -2.73
PTEN-204ENST00000487939 S100A13Q99584 98 aa-2□□□□□ -2.73
PTEN-204ENST00000487939 ABRACLQ9P1F3 81 aa-2□□□□□ -2.73
PTEN-204ENST00000487939 KAAG1Q9UBP8 84 aa-2.01□□□□□ -2.73
PTEN-204ENST00000487939 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-2.01□□□□□ -2.73
PTEN-204ENST00000487939 SZT2Q5T011 3432 aa-2.01□□□□□ -2.73
PTEN-204ENST00000487939 MROH2AA6NES4 1674 aa-2.02□□□□□ -2.73
PTEN-204ENST00000487939 H3BVH4 76 aa-2.04□□□□□ -2.74
PTEN-204ENST00000487939 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-2.07□□□□□ -2.74
PTEN-204ENST00000487939 DCHS1Q96JQ0 3298 aa-2.09□□□□□ -2.74
PTEN-204ENST00000487939 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa-2.09□□□□□ -2.74
PTEN-204ENST00000487939 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-2.1□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa-2.1□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 GNG2P59768 71 aa-2.1□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 ABCA8O94911 1581 aa-2.1□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 MUC3AQ02505 3323 aa-2.11□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 WDFY4Q6ZS81 3184 aa-2.11□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP-2.11□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 C18orf32Q8TCD1 76 aa-2.11□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 EP400Q96L91 3159 aa-2.11□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 LMO7Q8WWI1 1683 aa-2.12□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-2.12□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 EEA1Q15075 1411 aa-2.12□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-2.13□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 WFDC10BQ8IUB3 73 aa-2.13□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 K7EMI3 77 aa-2.14□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-2.14□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 USP34Q70CQ2 3546 aa-2.14□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 DNAH14Q0VDD8 3507 aa-2.16□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 EFCAB6Q5THR3 1501 aa-2.16□□□□□ -2.75
PTEN-204ENST00000487939 ATXN8Q156A1 80 aa-2.16□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-2.16□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 ABCA6Q8N139 1617 aa-2.17□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP-2.18□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 IQGAP3Q86VI3 1631 aa-2.18□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 DEFB131AP59861 70 aa-2.19□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa-2.19□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 NMES1Q9C002 83 aa-2.21□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-2.21□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 M0R1W7 72 aa-2.22□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa-2.22□□□□□ -2.76
PTEN-204ENST00000487939 DNAH12Q6ZR08 3092 aa-2.23□□□□□ -2.77
PTEN-204ENST00000487939 DUOX2Q9NRD8 1548 aa-2.23□□□□□ -2.77
PTEN-204ENST00000487939 SERF2P84101 59 aa-2.24□□□□□ -2.77
PTEN-204ENST00000487939 GNG13Q9P2W3 67 aa-2.24□□□□□ -2.77
PTEN-204ENST00000487939 SYCP2Q9BX26 1530 aa-2.24□□□□□ -2.77
PTEN-204ENST00000487939 UGGT1Q9NYU2 1555 aa-2.24□□□□□ -2.77
PTEN-204ENST00000487939 UNC80Q8N2C7 3258 aa-2.26□□□□□ -2.77
PTEN-204ENST00000487939 XIRP2A4UGR9 3374 aa-2.26□□□□□ -2.77
PTEN-204ENST00000487939 SCRIBQ14160 1630 aa-2.27□□□□□ -2.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms