RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486539.1

CACNA2D1-211, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit alpha2delta 1, humanhuman

TSL 5

Gene CACNA2D1, Length 526 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC58Q4VC31 144 aa-1.9□□□□□ -2.71
CACNA2D1-211ENST00000486539 MORN2Q502X0 79 aa-1.91□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 C20orf78Q9BR46 151 aa-1.91□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM191AQ9H0A3 160 aa-1.91□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BQ15 152 aa-1.92□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 APOC3P02656 99 aa-1.92□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 IL5P05113 134 aa-1.92□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLC1P0CG04 106 aa-1.92□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNCAP37840 140 aa-1.92□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL39P5Q59GN2 51 aa-1.92□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SKA2Q8WVK7 121 aaPredicted RBP-1.92□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa-1.92□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPANXCQ9NY87 97 aa-1.92□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa-1.92□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A087WXM4 84 aa-1.93□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 ATOX1O00244 68 aa-1.93□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 NDUFB6O95139 128 aa-1.93□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 ARMS2P0C7Q2 107 aa-1.93□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP-1.93□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 ACBD7Q8N6N7 88 aa-1.93□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 C2orf88Q9BSF0 95 aa-1.93□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GU69 56 aa-1.94□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 A0A1B0GV72 72 aa-1.94□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM218A2RU14 115 aa-1.94□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BVH4 76 aa-1.94□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 FABP1P07148 127 aa-1.94□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL38P63173 70 aaKnown RBP-1.94□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMCO1Q147U7 214 aa-1.94□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPTSSAQ969W0 71 aa-1.94□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa-1.94□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 H0Y9P7 68 aa-1.95□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP-1.95□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEC11CQ9BY50 192 aa-1.95□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM13P0DJ93 91 aa-1.96□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100GP29377 79 aa-1.96□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SEC11AP67812 179 aa-1.96□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SFTA2Q6UW10 78 aa-1.96□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPANXDQ9BXN6 97 aa-1.96□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SPANXA1Q9NS26 97 aa-1.96□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 F6UZH7 168 aa-1.97□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 M0R129 80 aa-1.97□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 DBIP07108 87 aaKnown RBP-1.97□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAPPC2P0DI81 140 aa-1.97□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 TRAPPC2BP0DI82 140 aa-1.97□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP-1.97□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 CACFD1Q9UGQ2 172 aa-1.97□□□□□ -2.72
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNCGO76070 127 aa-1.98□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 CYB5AP00167 134 aa-1.98□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLC2P0DOY2 106 aa-1.98□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 G0S2P27469 103 aa-1.98□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 CCDC153Q494R4 210 aa-1.98□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 C12orf57Q99622 126 aa-1.98□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSPB11Q9Y547 144 aa-1.98□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNRPGP15A8MWD9 76 aa-1.99□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 CORTO00230 105 aa-1.99□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP-1.99□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL39P62891 51 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00308Q8TCZ7 52 aa-1.99□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP-1.99□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP-2□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 GSKIPQ9P0R6 139 aa-2□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 PVALEFA0A1B0GWK0 134 aa-2.01□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 SFT2D2O95562 160 aa-2.01□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 SELENOWP63302 87 aa-2.01□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 NREPQ16612 68 aa-2.01□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 MEIG1Q5JSS6 88 aa-2.01□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 TMEM167BQ9NRX6 74 aa-2.01□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa-2.02□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 PIGBOS1A0A0B4J2F0 54 aa-2.03□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00587B1AMM8 73 aa-2.03□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 NBEAP1P0C6P0 100 aa-2.03□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 RBP2P50120 134 aa-2.03□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 HSD52Q0P140 79 aa-2.03□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 HMGN3Q15651 99 aa-2.03□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 ST20Q9HBF5 79 aa-2.03□□□□□ -2.73
CACNA2D1-211ENST00000486539 C12orf73Q69YU5 71 aa-2.04□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 SNRPGP62308 76 aaKnown RBP-2.05□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 AIF1LQ9BQI0 150 aa-2.05□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 PDCD10Q9BUL8 212 aa-2.05□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 AP4S1Q9Y587 144 aa-2.05□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 H3BQF6 201 aa-2.06□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 RPL13AP3Q6NVV1 102 aa-2.06□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGIPA6NJ69 53 aa-2.07□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 MPC2O95563 127 aa-2.07□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 UBL5Q9BZL1 73 aa-2.07□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 IGLC3P0DOY3 106 aa-2.08□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 S100ZQ8WXG8 99 aa-2.08□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 TSC22D3Q99576 134 aa-2.08□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 RERGLQ9H628 205 aa-2.08□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa-2.09□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 NAP1L6A6NFF2 107 aa-2.09□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 J3QR89 54 aa-2.09□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 LINC00032P0C843 101 aa-2.09□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 GNGT1P63211 74 aa-2.09□□□□□ -2.74
CACNA2D1-211ENST00000486539 SMIM15Q7Z3B0 74 aa-2.1□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 COPZ1P61923 177 aa-2.11□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 DEFB107AQ8IZN7 70 aa-2.11□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 V9GYS6 101 aa-2.11□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP-2.12□□□□□ -2.75
CACNA2D1-211ENST00000486539 UMAD1C9J7I0 102 aa-2.12□□□□□ -2.75
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