RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468576.1

PTPRG-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type G, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRG, Length 854 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Dendrite, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRG-202ENST00000468576 C20orf78Q9BR46 151 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 NMES1Q9C002 83 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 TMEM167BQ9NRX6 74 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 PSENENQ9NZ42 101 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 RABAC1Q9UI14 185 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 KMT2AQ03164 3969 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DCHS2Q6V1P9 2916 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 PKHD1P08F94 4074 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 LRBAP50851 2863 aa0.12□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 TRAV21A0A0B4J279 112 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 C9orf92A6NGG3 77 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 LINC01546A6NGU7 62 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 CPSF4LA6NMK7 179 aaKnown RBP0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 H0YAA0 97 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 H0YGX0 51 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 NDUFA1O15239 70 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 NDUFB1O75438 58 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 STATHP02808 62 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 MT-ATP8P03928 68 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 IGLC2P0DOY2 106 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 HTN1P15515 57 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 HTN3P15516 51 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 PLNP26678 52 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 IFI27P40305 119 aaPredicted RBP0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 GNG2P59768 71 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB131AP59861 70 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB114Q30KQ6 69 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB112Q30KQ8 113 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 ETDBQ3ZM63 59 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 WFDC13Q8IUB5 93 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 C9orf62Q8N4C0 152 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 TOMM5Q8N4H5 51 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 LEAP2Q969E1 77 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 GAFA1Q96PS6 74 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 SMIM2Q9BVW6 85 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 KCNQ1DNQ9H478 68 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DNHD1Q96M86 4753 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 CMYA5Q8N3K9 4069 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH1Q9P2D7 4330 aa0.11□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH7Q8WXX0 4024 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH6Q9C0G6 4158 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 A0A096LPF7 62 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 A0A1B0GUT8 65 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 KANTRA0A1W2PQU2 76 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 IGIPA6NJ69 53 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 CEBPZOSA8MTT3 80 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 D6R8Y8 96 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 M0QY20 66 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 M0QZ58 72 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 LEPROTL1O95214 131 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 ACYP1P07311 99 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 IGLC3P0DOY3 106 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 CRIP1P50238 77 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 WT1-ASQ06250 92 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 PEA15Q15121 130 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB110Q30KQ9 67 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 MUSTN1Q8IVN3 82 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB107AQ8IZN7 70 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 ST20Q9HBF5 79 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 HIGD1BQ9P298 99 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 APLNQ9ULZ1 77 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 HILPDAQ9Y5L2 63 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DNAH3Q8TD57 4116 aa0.1□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 ALMS1Q8TCU4 4167 aa0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 STARD9Q9P2P6 4700 aa0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 VPS13DQ5THJ4 4388 aa0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 FAT2Q9NYQ8 4349 aa0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 TNXBP22105 4242 aa0.09□□□□□ -2.39
PTPRG-202ENST00000468576 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 H3BVH4 76 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 CCL22O00626 93 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 MT1HL1P0DM35 61 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 COX7BP24311 80 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 FCER1GP30273 86 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 ATXN8Q156A1 80 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB136Q30KP8 78 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 DEFB135Q30KP9 77 aa0.09□□□□□ -2.4
PTPRG-202ENST00000468576 KRTAP6-1Q3LI64 71 aa0.09□□□□□ -2.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.3 ms