RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463372.5

C9orf3-211, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 3

Gene C9orf3, Length 919 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0B4J2C4 111 aa4.93□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa4.93□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 PP632Q6XCG6 107 aa4.93□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 HIGD1BQ9P298 99 aa4.93□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 MT1GP13640 62 aa4.92□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 PRO1854Q9UHT4 67 aa4.92□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 hDV103S1A0JD37 113 aa4.91□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 CEND1Q8N111 149 aa4.91□□□□□ -1.62
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1B0GX51 115 aa4.89□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 DNAL4O96015 105 aa4.89□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 PSMB2P49721 201 aa4.89□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 FXYD2P54710 66 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 TRIAP1O43715 76 aa4.87□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 ADM2Q7Z4H4 148 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 K7ERJ3 54 aa4.84□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 COX6CP09669 75 aa4.84□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 Q6ZQT0 140 aa4.84□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 R4GN34 69 aa4.84□□□□□ -1.63
C9orf3-211ENST00000463372 H3BQ85 93 aa4.83□□□□□ -1.64
C9orf3-211ENST00000463372 HSD52Q0P140 79 aa4.83□□□□□ -1.64
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0A0MQY5 61 aa4.82□□□□□ -1.64
C9orf3-211ENST00000463372 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.82□□□□□ -1.64
C9orf3-211ENST00000463372 SCGB1C2P0DMR2 95 aa4.81□□□□□ -1.64
C9orf3-211ENST00000463372 MT1MQ8N339 61 aa4.8□□□□□ -1.64
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP4-11Q9BYQ6 195 aa4.8□□□□□ -1.64
C9orf3-211ENST00000463372 PYY3Q5JQD4 70 aa4.78□□□□□ -1.64
C9orf3-211ENST00000463372 UBE2V1Q13404 147 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 UQCR10Q9UDW1 63 aa4.77□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 LINC01554Q52M75 96 aa4.76□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 A0A087WVE0 104 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 HCG22E2RYF7 251 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 M0QZ58 72 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP5-8O75690 187 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 SEC61GP60059 68 aa4.74□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 PCP4L1A6NKN8 68 aa4.73□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 C9JAW5 83 aa4.73□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.72□□□□□ -1.65
C9orf3-211ENST00000463372 NDUFC1O43677 76 aa4.7□□□□□ -1.66
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP12-4P60329 112 aa4.69□□□□□ -1.66
C9orf3-211ENST00000463372 CXCL6P80162 114 aa4.68□□□□□ -1.66
C9orf3-211ENST00000463372 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
C9orf3-211ENST00000463372 ATXN8Q156A1 80 aa4.67□□□□□ -1.66
C9orf3-211ENST00000463372 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf3-211ENST00000463372 M0R143 59 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa4.66□□□□□ -1.66
C9orf3-211ENST00000463372 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa4.62□□□□□ -1.67
C9orf3-211ENST00000463372 NREPQ16612 68 aa4.62□□□□□ -1.67
C9orf3-211ENST00000463372 C14orf132Q9NPU4 83 aa4.62□□□□□ -1.67
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1B0GW54 56 aa4.61□□□□□ -1.67
C9orf3-211ENST00000463372 BATFQ16520 125 aa4.6□□□□□ -1.67
C9orf3-211ENST00000463372 C20orf197Q8N268 126 aa4.6□□□□□ -1.67
C9orf3-211ENST00000463372 C9orf118A6NHY6 69 aa4.58□□□□□ -1.68
C9orf3-211ENST00000463372 CASC2Q6XLA1 102 aa4.58□□□□□ -1.68
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.57□□□□□ -1.68
C9orf3-211ENST00000463372 P0C880 135 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf3-211ENST00000463372 MT1LQ93083 61 aa4.56□□□□□ -1.68
C9orf3-211ENST00000463372 TSTD3H0UI37 97 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.54□□□□□ -1.68
C9orf3-211ENST00000463372 SMIM6P0DI80 62 aa4.53□□□□□ -1.68
C9orf3-211ENST00000463372 BPY2O14599 106 aa4.52□□□□□ -1.69
C9orf3-211ENST00000463372 H3BT86 120 aa4.51□□□□□ -1.69
C9orf3-211ENST00000463372 A0A1W2PPM0 123 aa4.48□□□□□ -1.69
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP5-5Q701N2 237 aaPredicted RBP4.47□□□□□ -1.69
C9orf3-211ENST00000463372 Q8N9L7 120 aa4.47□□□□□ -1.69
C9orf3-211ENST00000463372 TAX1BP3O14907 124 aa4.46□□□□□ -1.7
C9orf3-211ENST00000463372 MT-ATP8P03928 68 aa4.45□□□□□ -1.7
C9orf3-211ENST00000463372 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP5-2Q701N4 177 aa4.44□□□□□ -1.7
C9orf3-211ENST00000463372 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.43□□□□□ -1.7
C9orf3-211ENST00000463372 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.41□□□□□ -1.7
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf3-211ENST00000463372 UBL5Q9BZL1 73 aa4.4□□□□□ -1.71
C9orf3-211ENST00000463372 K7EP34 96 aa4.39□□□□□ -1.71
C9orf3-211ENST00000463372 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.38□□□□□ -1.71
C9orf3-211ENST00000463372 V9GYY9 64 aa4.37□□□□□ -1.71
C9orf3-211ENST00000463372 A0A0D9SG42 100 aa4.36□□□□□ -1.71
C9orf3-211ENST00000463372 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.35□□□□□ -1.71
C9orf3-211ENST00000463372 ACYP1P07311 99 aa4.34□□□□□ -1.71
C9orf3-211ENST00000463372 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa4.34□□□□□ -1.71
C9orf3-211ENST00000463372 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.31□□□□□ -1.72
C9orf3-211ENST00000463372 PRO0461Q9UI25 63 aa4.31□□□□□ -1.72
C9orf3-211ENST00000463372 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.3□□□□□ -1.72
C9orf3-211ENST00000463372 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.27□□□□□ -1.73
C9orf3-211ENST00000463372 F8W1H4 67 aa4.24□□□□□ -1.73
C9orf3-211ENST00000463372 ETDBQ3ZM63 59 aa4.24□□□□□ -1.73
C9orf3-211ENST00000463372 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.22□□□□□ -1.73
C9orf3-211ENST00000463372 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.19□□□□□ -1.74
C9orf3-211ENST00000463372 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
C9orf3-211ENST00000463372 H0Y9P7 68 aa4.15□□□□□ -1.75
C9orf3-211ENST00000463372 UQCRQO14949 82 aa4.14□□□□□ -1.75
C9orf3-211ENST00000463372 ATOX1O00244 68 aa4.13□□□□□ -1.75
C9orf3-211ENST00000463372 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.12□□□□□ -1.75
C9orf3-211ENST00000463372 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.11□□□□□ -1.75
C9orf3-211ENST00000463372 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa4.08□□□□□ -1.76
C9orf3-211ENST00000463372 KRTAP5-1Q6L8H4 278 aa4.08□□□□□ -1.76
C9orf3-211ENST00000463372 LINC00208Q96KT6 92 aa4.08□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms