RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418331.6

PTPRJ-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type J, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRJ, Length 5,122 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP12-3P60328 96 aa9.15□□□□□ -0.94
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAH1Q9P2D7 4330 aa9.15□□□□□ -0.95
PTPRJ-201ENST00000418331 AKAP9Q99996 3911 aa9.13□□□□□ -0.95
PTPRJ-201ENST00000418331 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP23-1A1A580 65 aa9.1□□□□□ -0.95
PTPRJ-201ENST00000418331 DNHD1Q96M86 4753 aa9.08□□□□□ -0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 LCE3AQ5TA76 89 aa9.07□□□□□ -0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAH10Q8IVF4 4471 aa9.05□□□□□ -0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 CRCT1Q9UGL9 99 aa9.04□□□□□ -0.96
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.97□□□□□ -0.97
PTPRJ-201ENST00000418331 INE1O15225 51 aa8.94□□□□□ -0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 VPS13DQ5THJ4 4388 aa8.93□□□□□ -0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAH17Q9UFH2 4485 aa8.91□□□□□ -0.98
PTPRJ-201ENST00000418331 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP8.88□□□□□ -0.99
PTPRJ-201ENST00000418331 LRP1BQ9NZR2 4599 aa8.78□□□□□ -1
PTPRJ-201ENST00000418331 FAT1Q14517 4588 aa8.78□□□□□ -1
PTPRJ-201ENST00000418331 MT1HP80294 61 aa8.77□□□□□ -1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAH2Q9P225 4427 aa8.75□□□□□ -1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 RYR1P21817 5038 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 STARD9Q9P2P6 4700 aa8.73□□□□□ -1.01
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa8.68□□□□□ -1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 MT2AP02795 61 aa8.66□□□□□ -1.02
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAH8Q96JB1 4490 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.6□□□□□ -1.03
PTPRJ-201ENST00000418331 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.57□□□□□ -1.04
PTPRJ-201ENST00000418331 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAH3Q8TD57 4116 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 MT1FP04733 61 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRJ-201ENST00000418331 APOBP04114 4563 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP10-5P60370 271 aa8.37□□□□□ -1.07
PTPRJ-201ENST00000418331 ANK2Q01484 3957 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRJ-201ENST00000418331 KIAA1109Q2LD37 5005 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRJ-201ENST00000418331 KMT2AQ03164 3969 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRJ-201ENST00000418331 RYR3Q15413 4870 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRJ-201ENST00000418331 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa8.26□□□□□ -1.09
PTPRJ-201ENST00000418331 MYCBP2O75592 4640 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 LYSTQ99698 3801 aa8.21□□□□□ -1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa8.19□□□□□ -1.1
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRR2FQ96RM1 72 aa8.09□□□□□ -1.12
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRJ-201ENST00000418331 RYR2Q92736 4967 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRJ-201ENST00000418331 LCE3CQ5T5A8 94 aa8.03□□□□□ -1.12
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.02□□□□□ -1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAH6Q9C0G6 4158 aa7.98□□□□□ -1.13
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.95□□□□□ -1.14
PTPRJ-201ENST00000418331 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7.91□□□□□ -1.14
PTPRJ-201ENST00000418331 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.89□□□□□ -1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa7.88□□□□□ -1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 FRAS1Q86XX4 4008 aa7.85□□□□□ -1.15
PTPRJ-201ENST00000418331 HERC2O95714 4834 aa7.82□□□□□ -1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 MT1XP80297 61 aa7.81□□□□□ -1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.78□□□□□ -1.16
PTPRJ-201ENST00000418331 MT1BP07438 61 aa7.77□□□□□ -1.17
PTPRJ-201ENST00000418331 LCE2CQ5TA81 110 aa7.7□□□□□ -1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 LRP2P98164 4655 aa7.68□□□□□ -1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.66□□□□□ -1.18
PTPRJ-201ENST00000418331 HSPG2P98160 4391 aa7.62□□□□□ -1.19
PTPRJ-201ENST00000418331 PKD1P98161 4303 aa7.61□□□□□ -1.19
PTPRJ-201ENST00000418331 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRJ-201ENST00000418331 HERC1Q15751 4861 aa7.6□□□□□ -1.19
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.59□□□□□ -1.19
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRR2EP22531 72 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRR2BP35325 72 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRR2AP35326 72 aa7.54□□□□□ -1.2
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.51□□□□□ -1.21
PTPRJ-201ENST00000418331 PKHD1P08F94 4074 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRJ-201ENST00000418331 MT1GP13640 62 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRJ-201ENST00000418331 LCE3BQ5TA77 95 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRJ-201ENST00000418331 LPAP08519 4548 aa7.34□□□□□ -1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 LCE2BO14633 110 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 SPRR2DP22532 72 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRJ-201ENST00000418331 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP12-4P60329 112 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRJ-201ENST00000418331 MUC17Q685J3 4493 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRJ-201ENST00000418331 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRJ-201ENST00000418331 TNXBP22105 4242 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa7.1□□□□□ -1.27
PTPRJ-201ENST00000418331 MT1LQ93083 61 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRJ-201ENST00000418331 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRJ-201ENST00000418331 MT1EP04732 61 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRJ-201ENST00000418331 LCE3DQ9BYE3 92 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRJ-201ENST00000418331 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRJ-201ENST00000418331 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRJ-201ENST00000418331 LCE3EQ5T5B0 92 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRJ-201ENST00000418331 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
PTPRJ-201ENST00000418331 MT1MQ8N339 61 aa6.79□□□□□ -1.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 78.7 ms