RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.64□□□□□ -1.67
SH3BP2-201ENST00000356331 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.63□□□□□ -1.67
SH3BP2-201ENST00000356331 FRAS1Q86XX4 4008 aa4.61□□□□□ -1.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH3Q8TD57 4116 aa4.61□□□□□ -1.67
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH7Q8WXX0 4024 aa4.56□□□□□ -1.68
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH2Q9P225 4427 aa4.54□□□□□ -1.68
SH3BP2-201ENST00000356331 LCE3AQ5TA76 89 aa4.54□□□□□ -1.68
SH3BP2-201ENST00000356331 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
SH3BP2-201ENST00000356331 ANK2Q01484 3957 aa4.51□□□□□ -1.69
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa4.44□□□□□ -1.7
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP10-5P60370 271 aa4.43□□□□□ -1.7
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH6Q9C0G6 4158 aa4.41□□□□□ -1.7
SH3BP2-201ENST00000356331 KMT2AQ03164 3969 aa4.39□□□□□ -1.71
SH3BP2-201ENST00000356331 MT1HL1P0DM35 61 aa4.36□□□□□ -1.71
SH3BP2-201ENST00000356331 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH10Q8IVF4 4471 aa4.35□□□□□ -1.71
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.34□□□□□ -1.72
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.23□□□□□ -1.73
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.2□□□□□ -1.74
SH3BP2-201ENST00000356331 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.2□□□□□ -1.74
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.16□□□□□ -1.74
SH3BP2-201ENST00000356331 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP4.14□□□□□ -1.75
SH3BP2-201ENST00000356331 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.14□□□□□ -1.75
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.11□□□□□ -1.75
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH11Q96DT5 4516 aa4.09□□□□□ -1.75
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
SH3BP2-201ENST00000356331 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
SH3BP2-201ENST00000356331 MT3P25713 68 aa4.05□□□□□ -1.76
SH3BP2-201ENST00000356331 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.04□□□□□ -1.76
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH17Q9UFH2 4485 aa4.03□□□□□ -1.76
SH3BP2-201ENST00000356331 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
SH3BP2-201ENST00000356331 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP2-201ENST00000356331 VPS13DQ5THJ4 4388 aa4.01□□□□□ -1.77
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.98□□□□□ -1.77
SH3BP2-201ENST00000356331 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.98□□□□□ -1.77
SH3BP2-201ENST00000356331 FAT2Q9NYQ8 4349 aa3.98□□□□□ -1.77
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.92□□□□□ -1.78
SH3BP2-201ENST00000356331 MT1HP80294 61 aa3.88□□□□□ -1.79
SH3BP2-201ENST00000356331 DNAH5Q8TE73 4624 aa3.87□□□□□ -1.79
SH3BP2-201ENST00000356331 PKHD1P08F94 4074 aa3.81□□□□□ -1.8
SH3BP2-201ENST00000356331 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.81□□□□□ -1.8
SH3BP2-201ENST00000356331 LCE3BQ5TA77 95 aa3.8□□□□□ -1.8
SH3BP2-201ENST00000356331 MT2AP02795 61 aa3.8□□□□□ -1.8
SH3BP2-201ENST00000356331 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.78□□□□□ -1.8
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP12-4P60329 112 aa3.78□□□□□ -1.8
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.78□□□□□ -1.8
SH3BP2-201ENST00000356331 APOBP04114 4563 aaKnown RBP3.75□□□□□ -1.81
SH3BP2-201ENST00000356331 MT1FP04733 61 aa3.75□□□□□ -1.81
SH3BP2-201ENST00000356331 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.73□□□□□ -1.81
SH3BP2-201ENST00000356331 PKD1P98161 4303 aa3.71□□□□□ -1.82
SH3BP2-201ENST00000356331 LCE3DQ9BYE3 92 aa3.66□□□□□ -1.82
SH3BP2-201ENST00000356331 FAT1Q14517 4588 aa3.66□□□□□ -1.82
SH3BP2-201ENST00000356331 LCE3EQ5T5B0 92 aa3.66□□□□□ -1.82
SH3BP2-201ENST00000356331 MT1GP13640 62 aa3.65□□□□□ -1.83
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.63□□□□□ -1.83
SH3BP2-201ENST00000356331 SACSQ9NZJ4 4579 aa3.62□□□□□ -1.83
SH3BP2-201ENST00000356331 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP3.62□□□□□ -1.83
SH3BP2-201ENST00000356331 MT1XP80297 61 aa3.61□□□□□ -1.83
SH3BP2-201ENST00000356331 MYCBP2O75592 4640 aa3.6□□□□□ -1.83
SH3BP2-201ENST00000356331 TNXBP22105 4242 aa3.59□□□□□ -1.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SPRR2EP22531 72 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SPRR2BP35325 72 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP2-201ENST00000356331 SPRR2AP35326 72 aa3.58□□□□□ -1.84
SH3BP2-201ENST00000356331 LCE2BO14633 110 aa3.57□□□□□ -1.84
SH3BP2-201ENST00000356331 MT1LQ93083 61 aa3.55□□□□□ -1.84
SH3BP2-201ENST00000356331 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.54□□□□□ -1.84
SH3BP2-201ENST00000356331 HSPG2P98160 4391 aa3.5□□□□□ -1.85
SH3BP2-201ENST00000356331 SPRR2DP22532 72 aa3.5□□□□□ -1.85
SH3BP2-201ENST00000356331 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.45□□□□□ -1.86
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.44□□□□□ -1.86
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.44□□□□□ -1.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MT1EP04732 61 aa3.43□□□□□ -1.86
SH3BP2-201ENST00000356331 MT1BP07438 61 aa3.42□□□□□ -1.86
SH3BP2-201ENST00000356331 PRM1P04553 51 aa3.38□□□□□ -1.87
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.37□□□□□ -1.87
SH3BP2-201ENST00000356331 LPAP08519 4548 aa3.37□□□□□ -1.87
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.35□□□□□ -1.87
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.33□□□□□ -1.88
SH3BP2-201ENST00000356331 LRP2P98164 4655 aa3.32□□□□□ -1.88
SH3BP2-201ENST00000356331 LCE2CQ5TA81 110 aa3.29□□□□□ -1.88
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.26□□□□□ -1.89
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.26□□□□□ -1.89
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.26□□□□□ -1.89
SH3BP2-201ENST00000356331 MT1AP04731 61 aa3.25□□□□□ -1.89
SH3BP2-201ENST00000356331 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.24□□□□□ -1.89
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.24□□□□□ -1.89
SH3BP2-201ENST00000356331 MT1MQ8N339 61 aa3.23□□□□□ -1.89
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.22□□□□□ -1.89
SH3BP2-201ENST00000356331 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP3.18□□□□□ -1.9
SH3BP2-201ENST00000356331 RYR1P21817 5038 aa3.17□□□□□ -1.9
SH3BP2-201ENST00000356331 MUC17Q685J3 4493 aa3.16□□□□□ -1.9
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.13□□□□□ -1.91
SH3BP2-201ENST00000356331 MT4P47944 62 aa3.13□□□□□ -1.91
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa3.13□□□□□ -1.91
SH3BP2-201ENST00000356331 DNHD1Q96M86 4753 aa3.12□□□□□ -1.91
SH3BP2-201ENST00000356331 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa3.11□□□□□ -1.91
SH3BP2-201ENST00000356331 RYR3Q15413 4870 aa3.1□□□□□ -1.91
SH3BP2-201ENST00000356331 LCE1BQ5T7P3 118 aa3.1□□□□□ -1.91
SH3BP2-201ENST00000356331 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.08□□□□□ -1.92
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 93 ms