RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264896.7

SCARB2-201, Transcript of scavenger receptor class B member 2, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene SCARB2, Length 4,792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARB2-201ENST00000264896 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.81□□□□□ -1.16
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SCARB2-201ENST00000264896 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.7□□□□□ -1.18
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SCARB2-201ENST00000264896 LCE2CQ5TA81 110 aa6.44□□□□□ -1.38
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SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.28□□□□□ -1.4
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SCARB2-201ENST00000264896 MUC17Q685J3 4493 aa6.17□□□□□ -1.42
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SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP12-4P60329 112 aa5.91□□□□□ -1.46
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SCARB2-201ENST00000264896 SPRR2BP35325 72 aa5.91□□□□□ -1.46
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SCARB2-201ENST00000264896 MT1EP04732 61 aa5.8□□□□□ -1.48
SCARB2-201ENST00000264896 UBR4Q5T4S7 5183 aa5.8□□□□□ -1.48
SCARB2-201ENST00000264896 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP5.8□□□□□ -1.48
SCARB2-201ENST00000264896 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.79□□□□□ -1.48
SCARB2-201ENST00000264896 FAT4Q6V0I7 4981 aa5.76□□□□□ -1.49
SCARB2-201ENST00000264896 RNF213Q63HN8 5207 aa5.71□□□□□ -1.49
SCARB2-201ENST00000264896 SPRR2DP22532 72 aa5.7□□□□□ -1.5
SCARB2-201ENST00000264896 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.69□□□□□ -1.5
SCARB2-201ENST00000264896 LCE3DQ9BYE3 92 aa5.67□□□□□ -1.5
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