RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246024.6

TMX4-201, Transcript of thioredoxin related transmembrane protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMX4, Length 6,169 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP10-5P60370 271 aa5.86□□□□□ -1.47
TMX4-201ENST00000246024 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.84□□□□□ -1.48
TMX4-201ENST00000246024 LCE3AQ5TA76 89 aa5.81□□□□□ -1.48
TMX4-201ENST00000246024 DNAH5Q8TE73 4624 aa5.8□□□□□ -1.48
TMX4-201ENST00000246024 DNHD1Q96M86 4753 aa5.8□□□□□ -1.48
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.79□□□□□ -1.48
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.76□□□□□ -1.49
TMX4-201ENST00000246024 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.75□□□□□ -1.49
TMX4-201ENST00000246024 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
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TMX4-201ENST00000246024 MT1HP80294 61 aa5.55□□□□□ -1.52
TMX4-201ENST00000246024 FAT1Q14517 4588 aa5.54□□□□□ -1.52
TMX4-201ENST00000246024 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.53□□□□□ -1.52
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.53□□□□□ -1.52
TMX4-201ENST00000246024 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.52□□□□□ -1.53
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TMX4-201ENST00000246024 DNAH2Q9P225 4427 aa5.49□□□□□ -1.53
TMX4-201ENST00000246024 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.46□□□□□ -1.54
TMX4-201ENST00000246024 VPS13DQ5THJ4 4388 aa5.44□□□□□ -1.54
TMX4-201ENST00000246024 LYSTQ99698 3801 aa5.44□□□□□ -1.54
TMX4-201ENST00000246024 FAT2Q9NYQ8 4349 aa5.44□□□□□ -1.54
TMX4-201ENST00000246024 ANK2Q01484 3957 aa5.43□□□□□ -1.54
TMX4-201ENST00000246024 DNAH8Q96JB1 4490 aa5.42□□□□□ -1.54
TMX4-201ENST00000246024 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.42□□□□□ -1.54
TMX4-201ENST00000246024 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.4□□□□□ -1.55
TMX4-201ENST00000246024 MT2AP02795 61 aa5.4□□□□□ -1.55
TMX4-201ENST00000246024 DNAH17Q9UFH2 4485 aa5.39□□□□□ -1.55
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.39□□□□□ -1.55
TMX4-201ENST00000246024 MT1FP04733 61 aa5.34□□□□□ -1.55
TMX4-201ENST00000246024 DNAH3Q8TD57 4116 aa5.33□□□□□ -1.56
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.31□□□□□ -1.56
TMX4-201ENST00000246024 FRAS1Q86XX4 4008 aa5.28□□□□□ -1.56
TMX4-201ENST00000246024 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP5.27□□□□□ -1.57
TMX4-201ENST00000246024 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.22□□□□□ -1.57
TMX4-201ENST00000246024 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.21□□□□□ -1.58
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa5.18□□□□□ -1.58
TMX4-201ENST00000246024 RYR3Q15413 4870 aa5.17□□□□□ -1.58
TMX4-201ENST00000246024 MYCBP2O75592 4640 aa5.17□□□□□ -1.58
TMX4-201ENST00000246024 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.17□□□□□ -1.58
TMX4-201ENST00000246024 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.16□□□□□ -1.58
TMX4-201ENST00000246024 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.1□□□□□ -1.59
TMX4-201ENST00000246024 SPRR2EP22531 72 aa5.1□□□□□ -1.59
TMX4-201ENST00000246024 SPRR2BP35325 72 aa5.1□□□□□ -1.59
TMX4-201ENST00000246024 SPRR2AP35326 72 aa5.1□□□□□ -1.59
TMX4-201ENST00000246024 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
TMX4-201ENST00000246024 LCE3CQ5T5A8 94 aa5.06□□□□□ -1.6
TMX4-201ENST00000246024 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.05□□□□□ -1.6
TMX4-201ENST00000246024 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.04□□□□□ -1.6
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TMX4-201ENST00000246024 LCE3BQ5TA77 95 aa4.97□□□□□ -1.61
TMX4-201ENST00000246024 SPRR2DP22532 72 aa4.93□□□□□ -1.62
TMX4-201ENST00000246024 HYDINQ4G0P3 5121 aa4.93□□□□□ -1.62
TMX4-201ENST00000246024 HSPG2P98160 4391 aa4.93□□□□□ -1.62
TMX4-201ENST00000246024 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa4.91□□□□□ -1.62
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TMX4-201ENST00000246024 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa4.87□□□□□ -1.63
TMX4-201ENST00000246024 PKHD1P08F94 4074 aa4.85□□□□□ -1.63
TMX4-201ENST00000246024 HERC2O95714 4834 aa4.84□□□□□ -1.63
TMX4-201ENST00000246024 LCE2BO14633 110 aa4.84□□□□□ -1.63
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.83□□□□□ -1.64
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP12-4P60329 112 aa4.83□□□□□ -1.64
TMX4-201ENST00000246024 MT1GP13640 62 aa4.82□□□□□ -1.64
TMX4-201ENST00000246024 LRP2P98164 4655 aa4.81□□□□□ -1.64
TMX4-201ENST00000246024 RYR2Q92736 4967 aa4.8□□□□□ -1.64
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.77□□□□□ -1.65
TMX4-201ENST00000246024 MT1XP80297 61 aa4.76□□□□□ -1.65
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa4.75□□□□□ -1.65
TMX4-201ENST00000246024 BIRC6Q9NR09 4857 aa4.73□□□□□ -1.65
TMX4-201ENST00000246024 MT1BP07438 61 aa4.72□□□□□ -1.65
TMX4-201ENST00000246024 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.71□□□□□ -1.66
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.69□□□□□ -1.66
TMX4-201ENST00000246024 LCE2CQ5TA81 110 aa4.67□□□□□ -1.66
TMX4-201ENST00000246024 PKD1P98161 4303 aa4.67□□□□□ -1.66
TMX4-201ENST00000246024 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.67□□□□□ -1.66
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.65□□□□□ -1.67
TMX4-201ENST00000246024 LCE3DQ9BYE3 92 aa4.61□□□□□ -1.67
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TMX4-201ENST00000246024 HERC1Q15751 4861 aa4.58□□□□□ -1.68
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.57□□□□□ -1.68
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa4.57□□□□□ -1.68
TMX4-201ENST00000246024 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.56□□□□□ -1.68
TMX4-201ENST00000246024 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP4.55□□□□□ -1.68
TMX4-201ENST00000246024 MT4P47944 62 aa4.52□□□□□ -1.69
TMX4-201ENST00000246024 TNXBP22105 4242 aa4.51□□□□□ -1.69
TMX4-201ENST00000246024 LCE3EQ5T5B0 92 aa4.51□□□□□ -1.69
TMX4-201ENST00000246024 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.51□□□□□ -1.69
TMX4-201ENST00000246024 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP4.47□□□□□ -1.69
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.37□□□□□ -1.71
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.35□□□□□ -1.71
TMX4-201ENST00000246024 LCE1BQ5T7P3 118 aa4.35□□□□□ -1.71
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.34□□□□□ -1.71
TMX4-201ENST00000246024 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.34□□□□□ -1.71
TMX4-201ENST00000246024 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.31□□□□□ -1.72
TMX4-201ENST00000246024 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.3□□□□□ -1.72
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