RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637530.1

CACNB4-255, Transcript of calcium voltage-gated channel auxiliary subunit beta 4, human

TSL 5

Gene CACNB4, Length 3,104 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CACNB4-255	ENST00000637530	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	CHTF8	P0CG12	524 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530		A8MUU9	505 aa		5.01	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		5	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		5	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	5	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.99	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	CRIPT	Q9P021	101 aa		4.99	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	TENM3	Q9P273	2699 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		4.98	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	TENM4	Q6N022	2769 aa		4.97	□□□□□ -1.61
CACNB4-255	ENST00000637530	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	INAFM1	C9JVW0	142 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	LINC00483	Q53H64	154 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		4.96	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	ANK2	Q01484	3957 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530		H0YAA0	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	IGKV2-30	P06310	120 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	DNHD1	Q96M86	4753 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530		Q6ZSA8	131 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		4.9	□□□□□ -1.62
CACNB4-255	ENST00000637530	FAM229A	H3BQW9	127 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	SPINK1	P00995	79 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	RYR3	Q15413	4870 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	ITPR2	Q14571	2701 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	LY6G6C	O95867	125 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	DNAH9	Q9NYC9	4486 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	PANO1	I0J062	215 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	NDUFAF8	A1L188	74 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	C14orf177	Q52M58	125 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		4.84	□□□□□ -1.63
CACNB4-255	ENST00000637530	DNAH3	Q8TD57	4116 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530		A0A087WTM6	91 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	ATR	Q13535	2644 aa		4.82	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	SMR3A	Q99954	134 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530		A0A1B0GU33	70 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	PCLO	Q9Y6V0	5065 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530		Q8N1X5	172 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	NUPR2	A6NF83	97 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CACNB4-255	ENST00000637530	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530	TG	P01266	2768 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	4.74	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530	NSD1	Q96L73	2696 aa	Predicted RBP	4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530		K7ERS5	55 aa		4.73	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		4.71	□□□□□ -1.65
CACNB4-255	ENST00000637530	HERC2	O95714	4834 aa		4.71	□□□□□ -1.66
CACNB4-255	ENST00000637530	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CACNB4-255	ENST00000637530	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CACNB4-255	ENST00000637530	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CACNB4-255	ENST00000637530	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.67	□□□□□ -1.66
CACNB4-255	ENST00000637530	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CACNB4-255	ENST00000637530	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CACNB4-255	ENST00000637530	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CACNB4-255	ENST00000637530	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CACNB4-255	ENST00000637530	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		4.65	□□□□□ -1.66
CACNB4-255	ENST00000637530	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CACNB4-255	ENST00000637530		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CACNB4-255	ENST00000637530	SEC61B	P60468	96 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CACNB4-255	ENST00000637530	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CACNB4-255	ENST00000637530	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-255	ENST00000637530	LUZP6	Q538Z0	58 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-255	ENST00000637530	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		4.59	□□□□□ -1.68
CACNB4-255	ENST00000637530	APLN	Q9ULZ1	77 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CACNB4-255	ENST00000637530		A0A0D9SG42	100 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CACNB4-255	ENST00000637530	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CACNB4-255	ENST00000637530	DNAH2	Q9P225	4427 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CACNB4-255	ENST00000637530	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.49	□□□□□ -1.69
CACNB4-255	ENST00000637530	RYR2	Q92736	4967 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CACNB4-255	ENST00000637530	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CACNB4-255	ENST00000637530	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		4.47	□□□□□ -1.69

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