RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000636483.1

SPTAN1-232, Transcript of spectrin alpha, non-erythrocytic 1, humanhuman

TSL 5

Gene SPTAN1, Length 100 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1-232ENST00000636483 TRIOO75962 3097 aa-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 KIF1AQ12756 1690 aa-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAH2Q9P225 4427 aa-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 MTORP42345 2549 aa-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 LRRK2Q5S007 2527 aa-0.66□□□□□ -2.51
SPTAN1-232ENST00000636483 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
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SPTAN1-232ENST00000636483 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAH1Q9P2D7 4330 aa-0.66□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 H3BVH4 76 aa-0.67□□□□□ -2.52
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SPTAN1-232ENST00000636483 ENHOQ6UWT2 76 aa-0.67□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 CRIP1P50238 77 aa-0.68□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 C18orf32Q8TCD1 76 aa-0.68□□□□□ -2.52
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SPTAN1-232ENST00000636483 MGAM2Q2M2H8 2515 aa-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa-0.69□□□□□ -2.52
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SPTAN1-232ENST00000636483 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 RELNP78509 3460 aa-0.69□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 C3P01024 1663 aa-0.69□□□□□ -2.52
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SPTAN1-232ENST00000636483 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.7□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 ABCA9Q8IUA7 1624 aa-0.71□□□□□ -2.52
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SPTAN1-232ENST00000636483 HYDINQ4G0P3 5121 aa-0.71□□□□□ -2.52
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SPTAN1-232ENST00000636483 MROH1Q8NDA8 1641 aa-0.71□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 BIRC6Q9NR09 4857 aa-0.71□□□□□ -2.52
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SPTAN1-232ENST00000636483 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 NCBP2-AS2Q69YL0 99 aa-0.72□□□□□ -2.52
SPTAN1-232ENST00000636483 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-0.72□□□□□ -2.52
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SPTAN1-232ENST00000636483 BPTFQ12830 3046 aa-0.73□□□□□ -2.53
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SPTAN1-232ENST00000636483 LY75O60449 1722 aa-0.73□□□□□ -2.53
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SPTAN1-232ENST00000636483 ASXL1Q8IXJ9 1541 aa-0.77□□□□□ -2.53
SPTAN1-232ENST00000636483 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
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SPTAN1-232ENST00000636483 DEFB114Q30KQ6 69 aa-0.81□□□□□ -2.54
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SPTAN1-232ENST00000636483 CROCC2H7BZ55 1655 aa-0.82□□□□□ -2.54
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SPTAN1-232ENST00000636483 NEBP20929 6669 aa-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1-232ENST00000636483 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-0.83□□□□□ -2.54
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SPTAN1-232ENST00000636483 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1-232ENST00000636483 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
SPTAN1-232ENST00000636483 TNP1P09430 55 aa-0.84□□□□□ -2.54
SPTAN1-232ENST00000636483 A0A1B0GUL6 1792 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 H3BUA1 57 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-0.85□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 TIAM1Q13009 1591 aa-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 ITPR1Q14643 2758 aa-0.86□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 MAST1Q9Y2H9 1570 aa-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-0.87□□□□□ -2.55
SPTAN1-232ENST00000636483 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-0.87□□□□□ -2.55
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