RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000621218.4

PLP1-223, Transcript of proteolipid protein 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PLP1, Length 3,001 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PLP1-223	ENST00000621218	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		5.48	□□□□□ -1.53
PLP1-223	ENST00000621218	MDFI	Q99750	246 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PLP1-223	ENST00000621218	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		5.47	□□□□□ -1.53
PLP1-223	ENST00000621218	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PLP1-223	ENST00000621218	CDK2AP2	O75956	126 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PLP1-223	ENST00000621218	LINC00483	Q53H64	154 aa		5.44	□□□□□ -1.54
PLP1-223	ENST00000621218	AFDN-AS1	Q9Y6Z5	254 aa	Predicted RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PLP1-223	ENST00000621218	PLA2G1B	P04054	148 aa	Known RBP	5.42	□□□□□ -1.54
PLP1-223	ENST00000621218	ACYP2	P14621	99 aa		5.42	□□□□□ -1.54
PLP1-223	ENST00000621218	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PLP1-223	ENST00000621218	C14orf177	Q52M58	125 aa		5.41	□□□□□ -1.54
PLP1-223	ENST00000621218	PLEC	Q15149	4684 aa	Known RBP	5.4	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP24-1	Q3LI83	254 aa		5.4	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	RTL8C	O15255	209 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	DMAC1	Q96GE9	116 aa		5.39	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218		A0A1B0GU69	56 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		5.38	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	SPACA4	Q8TDM5	124 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	LINC01554	Q52M75	96 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		5.37	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	APLN	Q9ULZ1	77 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		5.36	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	DYNC2H1	Q8NCM8	4307 aa	Known RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		5.35	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	5.35	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		5.34	□□□□□ -1.55
PLP1-223	ENST00000621218	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		5.34	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.33	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	5.33	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	ZNF861P	O60384	105 aa		5.32	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	FBN3	Q75N90	2809 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	UQCR11	O14957	56 aa		5.31	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	KMT2A	Q03164	3969 aa		5.3	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	CSAG1	Q6PB30	78 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	DNAH2	Q9P225	4427 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	IGKV2-30	P06310	120 aa		5.29	□□□□□ -1.56
PLP1-223	ENST00000621218	TG	P01266	2768 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PLP1-223	ENST00000621218	FAM229A	H3BQW9	127 aa		5.27	□□□□□ -1.57
PLP1-223	ENST00000621218	STARD9	Q9P2P6	4700 aa		5.26	□□□□□ -1.57
PLP1-223	ENST00000621218		A0A087WTM6	91 aa		5.25	□□□□□ -1.57
PLP1-223	ENST00000621218	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		5.24	□□□□□ -1.57
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		5.23	□□□□□ -1.57
PLP1-223	ENST00000621218	IGKV2D-30	A0A075B6S6	120 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PLP1-223	ENST00000621218	IGLV7-43	P04211	117 aa		5.22	□□□□□ -1.57
PLP1-223	ENST00000621218	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		5.21	□□□□□ -1.58
PLP1-223	ENST00000621218	PRKDC	P78527	4128 aa	Known RBP	5.2	□□□□□ -1.58
PLP1-223	ENST00000621218	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		5.19	□□□□□ -1.58
PLP1-223	ENST00000621218	SPINK1	P00995	79 aa		5.18	□□□□□ -1.58
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		5.16	□□□□□ -1.58
PLP1-223	ENST00000621218		Q8N1X5	172 aa		5.15	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218		H0YAA0	97 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218		Q6ZSA8	131 aa		5.14	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		5.13	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218		A8MUU9	505 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218	NUPR2	A6NF83	97 aa		5.12	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218	LINC00304	Q8N9R0	145 aa		5.11	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218	FLG2	Q5D862	2391 aa	Predicted RBP	5.1	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218	TYMSOS	Q8TAI1	123 aa		5.1	□□□□□ -1.59
PLP1-223	ENST00000621218	LY6G6C	O95867	125 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP25-1	Q3LHN0	102 aa		5.09	□□□□□ -1.6
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PLP1-223	ENST00000621218	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		5.08	□□□□□ -1.6
PLP1-223	ENST00000621218	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		5.06	□□□□□ -1.6
PLP1-223	ENST00000621218	ROMO1	P60602	79 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		5.05	□□□□□ -1.6
PLP1-223	ENST00000621218	CRIPT	Q9P021	101 aa		5.04	□□□□□ -1.6
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP10-2	P60368	255 aa		5.03	□□□□□ -1.6
PLP1-223	ENST00000621218		A0A1B0GU33	70 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PLP1-223	ENST00000621218	PKD1	P98161	4303 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		5.02	□□□□□ -1.61
PLP1-223	ENST00000621218	DNHD1	Q96M86	4753 aa		5	□□□□□ -1.61
PLP1-223	ENST00000621218	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		4.99	□□□□□ -1.61
PLP1-223	ENST00000621218		A0A0A0MQY5	61 aa		4.97	□□□□□ -1.61
PLP1-223	ENST00000621218		P0C880	135 aa		4.96	□□□□□ -1.62
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PLP1-223	ENST00000621218	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PLP1-223	ENST00000621218	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PLP1-223	ENST00000621218	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PLP1-223	ENST00000621218	PKHD1	P08F94	4074 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PLP1-223	ENST00000621218	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PLP1-223	ENST00000621218		K7ERS5	55 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PLP1-223	ENST00000621218	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
PLP1-223	ENST00000621218	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PLP1-223	ENST00000621218	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PLP1-223	ENST00000621218	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PLP1-223	ENST00000621218	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PLP1-223	ENST00000621218	PKHD1L1	Q86WI1	4243 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PLP1-223	ENST00000621218	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64
PLP1-223	ENST00000621218	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PLP1-223	ENST00000621218		A0A0D9SG42	100 aa		4.79	□□□□□ -1.64

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