RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000610404.4

TTR-204, Transcript of transthyretin, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene TTR, Length 1,040 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTR-204ENST00000610404 HIST1H2BDP58876 126 aa4.19□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 LINC00313P59037 77 aa4.19□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 KRTDAPP60985 99 aa4.19□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 HIST1H2BCP62807 126 aa4.19□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 HIST2H2BEQ16778 126 aa4.19□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4.19□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 HIST1H2BHQ93079 126 aa4.19□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 HIST1H2BNQ99877 126 aa4.19□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 HIST1H2BMQ99879 126 aa4.19□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.18□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 LCE3CQ5T5A8 94 aa4.18□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 MUC12Q9UKN1 5478 aa4.16□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 A8MWP4 228 aa4.16□□□□□ -1.74
TTR-204ENST00000610404 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP4.15□□□□□ -1.75
TTR-204ENST00000610404 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa4.15□□□□□ -1.75
TTR-204ENST00000610404 C12orf57Q99622 126 aa4.15□□□□□ -1.75
TTR-204ENST00000610404 A0A1W2PNM2 257 aa4.14□□□□□ -1.75
TTR-204ENST00000610404 IGKV4-1P06312 121 aa4.14□□□□□ -1.75
TTR-204ENST00000610404 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa4.14□□□□□ -1.75
TTR-204ENST00000610404 MTURNQ8N3F0 131 aa4.14□□□□□ -1.75
TTR-204ENST00000610404 H3BMG7 143 aa4.12□□□□□ -1.75
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TTR-204ENST00000610404 FAM218AQ96MZ4 157 aa4.12□□□□□ -1.75
TTR-204ENST00000610404 SPINK7P58062 85 aa4.11□□□□□ -1.75
TTR-204ENST00000610404 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP4.11□□□□□ -1.75
TTR-204ENST00000610404 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa4.1□□□□□ -1.75
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TTR-204ENST00000610404 LINC00472Q9H8W2 130 aa4.09□□□□□ -1.75
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TTR-204ENST00000610404 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.07□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa4.06□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 HIST1H4GQ99525 98 aa4.06□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 KRTAP4-3Q9BYR4 195 aa4.06□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 A0A1B0GV72 72 aa4.05□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 A0A1B0GVX0 72 aa4.05□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 H0YGX0 51 aa4.05□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 A6NN06 94 aa4.04□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 C8orf87E5RJ46 101 aa4.04□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 SNCGO76070 127 aa4.04□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.04□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 RAB37Q96AX2 223 aa4.04□□□□□ -1.76
TTR-204ENST00000610404 MDN1Q9NU22 5596 aa4.03□□□□□ -1.77
TTR-204ENST00000610404 KMT2DO14686 5537 aa4.02□□□□□ -1.77
TTR-204ENST00000610404 A0A1B0GX51 115 aa4.01□□□□□ -1.77
TTR-204ENST00000610404 HSBP1L1C9JCN9 74 aa4.01□□□□□ -1.77
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TTR-204ENST00000610404 A0A0B4J2C4 111 aa4□□□□□ -1.77
TTR-204ENST00000610404 CCKP06307 115 aa4□□□□□ -1.77
TTR-204ENST00000610404 MT1BP07438 61 aa4□□□□□ -1.77
TTR-204ENST00000610404 COX8AP10176 69 aa3.98□□□□□ -1.77
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TTR-204ENST00000610404 HIST1H2BLQ99880 126 aa3.98□□□□□ -1.77
TTR-204ENST00000610404 HIST3H2BBQ8N257 126 aa3.96□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 VPS25Q9BRG1 176 aa3.96□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.96□□□□□ -1.78
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TTR-204ENST00000610404 Q5VV11 94 aa3.94□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.94□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 C8orf17Q9NRJ1 99 aa3.94□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.94□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.93□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 J3KT08 172 aa3.93□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa3.93□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.93□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 C2orf91Q6ZV80 131 aa3.93□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 C14orf144Q96I85 54 aa3.93□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 H3BQ85 93 aa3.92□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 S100A2P29034 98 aa3.92□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 HIGD1BQ9P298 99 aa3.92□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 FXYD2P54710 66 aa3.91□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 CEND1Q8N111 149 aa3.91□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 DSCR8Q96T75 97 aa3.91□□□□□ -1.78
TTR-204ENST00000610404 NDUFB1O75438 58 aa3.9□□□□□ -1.79
TTR-204ENST00000610404 Q6ZVQ6 151 aa3.9□□□□□ -1.79
TTR-204ENST00000610404 LCE3AQ5TA76 89 aa3.89□□□□□ -1.79
TTR-204ENST00000610404 Q6ZQT0 140 aa3.89□□□□□ -1.79
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TTR-204ENST00000610404 PSMB2P49721 201 aa3.87□□□□□ -1.79
TTR-204ENST00000610404 C5orf47Q569G3 176 aa3.87□□□□□ -1.79
TTR-204ENST00000610404 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.85□□□□□ -1.79
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TTR-204ENST00000610404 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP3.85□□□□□ -1.79
TTR-204ENST00000610404 C9JAW5 83 aa3.84□□□□□ -1.79
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TTR-204ENST00000610404 SPRR2BP35325 72 aa3.84□□□□□ -1.79
TTR-204ENST00000610404 SPRR2AP35326 72 aa3.84□□□□□ -1.79
TTR-204ENST00000610404 PRR15Q8IV56 129 aa3.84□□□□□ -1.79
TTR-204ENST00000610404 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.84□□□□□ -1.79
TTR-204ENST00000610404 COX6CP09669 75 aa3.83□□□□□ -1.8
TTR-204ENST00000610404 C4orf26Q17RF5 130 aa3.83□□□□□ -1.8
TTR-204ENST00000610404 C7orf65Q6ZTY9 151 aa3.83□□□□□ -1.8
TTR-204ENST00000610404 Q5W150 140 aa3.82□□□□□ -1.8
TTR-204ENST00000610404 SPRR2FQ96RM1 72 aa3.82□□□□□ -1.8
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