RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000587860.1

CTIF-205, Transcript of cap binding complex dependent translation initiation factor, humanhuman

TSL 2

Gene CTIF, Length 2,940 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIF-205ENST00000587860 A0A087WTM6 91 aa9.2□□□□□ -0.94
CTIF-205ENST00000587860 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa9.2□□□□□ -0.94
CTIF-205ENST00000587860 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa9.19□□□□□ -0.94
CTIF-205ENST00000587860 LY6G6CO95867 125 aa9.18□□□□□ -0.94
CTIF-205ENST00000587860 RTL8CO15255 209 aa9.17□□□□□ -0.94
CTIF-205ENST00000587860 PCOTHQ58A44 107 aa9.16□□□□□ -0.94
CTIF-205ENST00000587860 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa9.16□□□□□ -0.94
CTIF-205ENST00000587860 DNAH6Q9C0G6 4158 aa9.16□□□□□ -0.94
CTIF-205ENST00000587860 CASC2Q6XLA1 102 aa9.16□□□□□ -0.94
CTIF-205ENST00000587860 SPACA4Q8TDM5 124 aa9.15□□□□□ -0.95
CTIF-205ENST00000587860 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa9.14□□□□□ -0.95
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CTIF-205ENST00000587860 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.08□□□□□ -0.96
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CTIF-205ENST00000587860 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa9.08□□□□□ -0.96
CTIF-205ENST00000587860 DNAH11Q96DT5 4516 aa9.06□□□□□ -0.96
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CTIF-205ENST00000587860 HYDINQ4G0P3 5121 aa9.04□□□□□ -0.96
CTIF-205ENST00000587860 LINC00472Q9H8W2 130 aa9.04□□□□□ -0.96
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CTIF-205ENST00000587860 KRTAP10-2P60368 255 aa9.04□□□□□ -0.96
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CTIF-205ENST00000587860 SPINK6Q6UWN8 80 aa9.03□□□□□ -0.96
CTIF-205ENST00000587860 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa9.02□□□□□ -0.96
CTIF-205ENST00000587860 CDK2AP2O75956 126 aa9.02□□□□□ -0.96
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CTIF-205ENST00000587860 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP8.99□□□□□ -0.97
CTIF-205ENST00000587860 A8MWP4 228 aa8.98□□□□□ -0.97
CTIF-205ENST00000587860 A0A087X002 238 aa8.98□□□□□ -0.97
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CTIF-205ENST00000587860 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.98□□□□□ -0.97
CTIF-205ENST00000587860 H3BPC8 53 aa8.98□□□□□ -0.97
CTIF-205ENST00000587860 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa8.98□□□□□ -0.97
CTIF-205ENST00000587860 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa8.97□□□□□ -0.97
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CTIF-205ENST00000587860 HRES1P13985 223 aa8.95□□□□□ -0.98
CTIF-205ENST00000587860 Q96NJ1 140 aa8.95□□□□□ -0.98
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CTIF-205ENST00000587860 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.93□□□□□ -0.98
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CTIF-205ENST00000587860 IGLV7-43P04211 117 aa8.89□□□□□ -0.99
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CTIF-205ENST00000587860 KRTAP10-1P60331 282 aa8.87□□□□□ -0.99
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CTIF-205ENST00000587860 PKHD1P08F94 4074 aa8.83□□□□□ -1
CTIF-205ENST00000587860 FAT2Q9NYQ8 4349 aa8.82□□□□□ -1
CTIF-205ENST00000587860 A0A1B0GVX0 72 aa8.8□□□□□ -1
CTIF-205ENST00000587860 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa8.78□□□□□ -1
CTIF-205ENST00000587860 PKD1P98161 4303 aa8.78□□□□□ -1
CTIF-205ENST00000587860 FAM229AH3BQW9 127 aa8.74□□□□□ -1.01
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.74□□□□□ -1.01
CTIF-205ENST00000587860 Q5W150 140 aa8.74□□□□□ -1.01
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CTIF-205ENST00000587860 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.7□□□□□ -1.02
CTIF-205ENST00000587860 ROMO1P60602 79 aa8.65□□□□□ -1.02
CTIF-205ENST00000587860 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
CTIF-205ENST00000587860 FAT1Q14517 4588 aa8.64□□□□□ -1.03
CTIF-205ENST00000587860 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.64□□□□□ -1.03
CTIF-205ENST00000587860 UQCR11O14957 56 aa8.62□□□□□ -1.03
CTIF-205ENST00000587860 Q6ZSA8 131 aa8.62□□□□□ -1.03
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.6□□□□□ -1.03
CTIF-205ENST00000587860 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa8.6□□□□□ -1.03
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CTIF-205ENST00000587860 SACSQ9NZJ4 4579 aa8.59□□□□□ -1.03
CTIF-205ENST00000587860 TYMSOSQ8TAI1 123 aa8.54□□□□□ -1.04
CTIF-205ENST00000587860 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP8.53□□□□□ -1.04
CTIF-205ENST00000587860 CRIPTQ9P021 101 aa8.53□□□□□ -1.04
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CTIF-205ENST00000587860 IGKV2-30P06310 120 aa8.5□□□□□ -1.05
CTIF-205ENST00000587860 P0C880 135 aa8.49□□□□□ -1.05
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CTIF-205ENST00000587860 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.48□□□□□ -1.05
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CTIF-205ENST00000587860 DMAC1Q96GE9 116 aa8.44□□□□□ -1.06
CTIF-205ENST00000587860 C9orf92A6NGG3 77 aa8.43□□□□□ -1.06
CTIF-205ENST00000587860 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
CTIF-205ENST00000587860 A8MUU9 505 aa8.4□□□□□ -1.06
CTIF-205ENST00000587860 LINC00304Q8N9R0 145 aa8.38□□□□□ -1.07
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CTIF-205ENST00000587860 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CTIF-205ENST00000587860 SPINK1P00995 79 aa8.35□□□□□ -1.07
CTIF-205ENST00000587860 Q8N1X5 172 aa8.33□□□□□ -1.08
CTIF-205ENST00000587860 RYR2Q92736 4967 aa8.32□□□□□ -1.08
CTIF-205ENST00000587860 A0A1B0GVY2 172 aa8.27□□□□□ -1.09
CTIF-205ENST00000587860 NDUFAF8A1L188 74 aa8.26□□□□□ -1.09
CTIF-205ENST00000587860 MYCBP2O75592 4640 aa8.26□□□□□ -1.09
CTIF-205ENST00000587860 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.23□□□□□ -1.09
CTIF-205ENST00000587860 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
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