RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574026.2

ITGAE-209, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 3

Gene ITGAE, Length 416 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-209ENST00000574026 C4orf26Q17RF5 130 aa2.71□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 LINC00472Q9H8W2 130 aa2.71□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP2.71□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 DNAH17Q9UFH2 4485 aa2.7□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.7□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP2.7□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 FAM229BQ4G0N7 80 aa2.7□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.7□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 TGP01266 2768 aa2.7□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa2.69□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 SPINK6Q6UWN8 80 aa2.69□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.69□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 ANAPC11Q9NYG5 84 aa2.69□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 A8MWP4 228 aa2.68□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP2.68□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 CD164Q04900 197 aa2.68□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 C5orf47Q569G3 176 aa2.68□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 CASC2Q6XLA1 102 aa2.68□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 PRR15Q8IV56 129 aa2.68□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 Q96NJ1 140 aa2.68□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 SMIM26A0A096LP01 95 aa2.67□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 MOBPQ13875 183 aa2.67□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 LCE1AQ5T7P2 110 aa2.67□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.66□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa2.66□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 CDK2AP2O75956 126 aa2.66□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 PRR4Q16378 134 aa2.66□□□□□ -1.98
ITGAE-209ENST00000574026 hDV103S1A0JD37 113 aa2.65□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 H0Y9P7 68 aa2.65□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 NDUFB1O75438 58 aa2.65□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 LINC00208Q96KT6 92 aa2.65□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 LIMD2Q9BT23 127 aa2.65□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.65□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 ALMS1Q8TCU4 4167 aa2.64□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 DNAH8Q96JB1 4490 aa2.64□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 A0A087X002 238 aa2.64□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 TRAV22A0A0B4J277 110 aa2.64□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 MP68P56378 58 aa2.64□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa2.64□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 SPAG11AQ6PDA7 123 aa2.64□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa2.64□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 C1orf64Q8NEQ6 169 aa2.64□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 C8orf17Q9NRJ1 99 aa2.64□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 DNAH2Q9P225 4427 aa2.63□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa2.63□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 RPS29P62273 56 aaKnown RBP2.63□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 TYMSOSQ8TAI1 123 aa2.63□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa2.63□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa2.62□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 A0A1B0GVX0 72 aa2.62□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 SPINK1P00995 79 aa2.62□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP2.62□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 H3BPC8 53 aa2.61□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa2.61□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 LYSTQ99698 3801 aa2.61□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 DNAH6Q9C0G6 4158 aa2.6□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP2.6□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 PCOTHQ58A44 107 aa2.6□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP2.6□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 DNAH11Q96DT5 4516 aa2.59□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 C8orf87E5RJ46 101 aa2.59□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 NDUFS5O43920 106 aa2.59□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 Q5VSD8 79 aa2.59□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 LINC00304Q8N9R0 145 aa2.59□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa2.59□□□□□ -1.99
ITGAE-209ENST00000574026 SEC61GP60059 68 aa2.58□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 Q1T7F1 81 aa2.58□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 Q5W150 140 aa2.58□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa2.58□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 KMT2AQ03164 3969 aa2.58□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 HYDINQ4G0P3 5121 aa2.57□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa2.57□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 RYR2Q92736 4967 aa2.57□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa2.57□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 DNAH5Q8TE73 4624 aa2.56□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 A8MUN3 132 aa2.56□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 PSPHP1O15172 72 aa2.56□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa2.56□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 C1orf195Q5TG92 126 aa2.56□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 COA5Q86WW8 74 aa2.56□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 BRK1Q8WUW1 75 aa2.56□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 RETNLBQ9BQ08 111 aa2.56□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 LINC00313P59037 77 aa2.55□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 PRO0628Q9UI54 55 aa2.55□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 HRES1P13985 223 aa2.54□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 V9GYY9 64 aa2.54□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 LRP1BQ9NZR2 4599 aa2.53□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa2.53□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa2.53□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 KRTAP10-8P60410 259 aa2.53□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 Q5VV11 94 aa2.53□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 PRAC1Q96KF2 57 aa2.53□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 PKD1P98161 4303 aa2.53□□□□□ -2
ITGAE-209ENST00000574026 A8MU10 97 aa2.52□□□□□ -2.01
ITGAE-209ENST00000574026 PRR15LQ9BU68 103 aa2.52□□□□□ -2.01
ITGAE-209ENST00000574026 SACSQ9NZJ4 4579 aa2.52□□□□□ -2.01
ITGAE-209ENST00000574026 FRAS1Q86XX4 4008 aa2.52□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.8 ms