RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517072.1

RNU6-334P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 334, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-334P, Length 102 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-334P-201ENST00000517072 HMGA1P17096 107 aaKnown RBP-2.67□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 PPLO60437 1756 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT1HL1P0DM35 61 aa-2.68□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP-2.69□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP-2.7□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 NREPQ16612 68 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 CSMD1Q96PZ7 3565 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 C5orf42Q9H799 3197 aa-2.71□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 DEFB1P60022 68 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa-2.72□□□□□ -2.84
RNU6-334P-201ENST00000517072 TTC37Q6PGP7 1564 aa-2.73□□□□□ -2.85
RNU6-334P-201ENST00000517072 ITSN1Q15811 1721 aa-2.74□□□□□ -2.85
RNU6-334P-201ENST00000517072 MYO9AB2RTY4 2548 aa-2.75□□□□□ -2.85
RNU6-334P-201ENST00000517072 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP-2.76□□□□□ -2.85
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNAH8Q96JB1 4490 aa-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT1XP80297 61 aa-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-334P-201ENST00000517072 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP-2.77□□□□□ -2.85
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNAH5Q8TE73 4624 aa-2.78□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 LRBAP50851 2863 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 TDRG1Q3Y452 100 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 UACAQ9BZF9 1416 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa-2.8□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-2.81□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 A0A087WXM4 84 aa-2.81□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa-2.81□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 TLN2Q9Y4G6 2542 aa-2.82□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP-2.82□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNAH17Q9UFH2 4485 aa-2.83□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 DEFB121Q5J5C9 76 aa-2.83□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP-2.83□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa-2.84□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 RICTORQ6R327 1708 aa-2.85□□□□□ -2.86
RNU6-334P-201ENST00000517072 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMIM13P0DJ93 91 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 ATMQ13315 3056 aa-2.87□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 WT1-ASQ06250 92 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 TJP1Q07157 1748 aa-2.88□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 HFM1A2PYH4 1435 aa-2.89□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 UBL5Q9BZL1 73 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP-2.9□□□□□ -2.87
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT1BP07438 61 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-2.91□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 ITSN2Q9NZM3 1697 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 KDM5DQ9BY66 1539 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 ST20Q9HBF5 79 aa-2.92□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 BPTFQ12830 3046 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP-2.93□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 RALGAPBQ86X10 1494 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 CRIP1P50238 77 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 ADIRFQ15847 76 aa-2.94□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 CLPSL2Q6UWE3 100 aa-2.95□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 TNP1P09430 55 aa-2.96□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa-2.97□□□□□ -2.88
RNU6-334P-201ENST00000517072 DNAH10Q8IVF4 4471 aa-2.98□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa-2.99□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP-3□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT1MQ8N339 61 aa-3□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 KIF1AQ12756 1690 aa-3.01□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 NRAPQ86VF7 1730 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT1GP13640 62 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPS27P42677 84 aaKnown RBP-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 RPS27LQ71UM5 84 aaKnown RBP-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 S100A13Q99584 98 aa-3.02□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 H3BUT2 72 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 MINOS1Q5TGZ0 78 aa-3.03□□□□□ -2.89
RNU6-334P-201ENST00000517072 ABCC1P33527 1531 aa-3.03□□□□□ -2.9
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT2AP02795 61 aa-3.04□□□□□ -2.9
RNU6-334P-201ENST00000517072 ZFHX4Q86UP3 3567 aa-3.05□□□□□ -2.9
RNU6-334P-201ENST00000517072 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-334P-201ENST00000517072 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa-3.06□□□□□ -2.9
RNU6-334P-201ENST00000517072 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP-3.08□□□□□ -2.9
RNU6-334P-201ENST00000517072 CD163L1Q9NR16 1453 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-334P-201ENST00000517072 H3BUA1 57 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-334P-201ENST00000517072 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa-3.09□□□□□ -2.9
RNU6-334P-201ENST00000517072 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-3.1□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT1EP04732 61 aa-3.11□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 ENHOQ6UWT2 76 aa-3.12□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 MT1LQ93083 61 aa-3.13□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 NOP10Q9NPE3 64 aaKnown RBP-3.14□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 LY75O60449 1722 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 GNG2P59768 71 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 NHSQ6T4R5 1651 aa-3.15□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa-3.16□□□□□ -2.91
RNU6-334P-201ENST00000517072 FREM2Q5SZK8 3169 aa-3.16□□□□□ -2.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms