RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000503687.2

RABGEF1-211, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 2

Gene RABGEF1, Length 4,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-211ENST00000503687 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.66□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP10-2P60368 255 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 Q1T7F1 81 aa7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.65□□□□□ -1.18
RABGEF1-211ENST00000503687 FAM229AH3BQW9 127 aa7.65□□□□□ -1.19
RABGEF1-211ENST00000503687 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.63□□□□□ -1.19
RABGEF1-211ENST00000503687 FBN3Q75N90 2809 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-211ENST00000503687 C9orf92A6NGG3 77 aa7.62□□□□□ -1.19
RABGEF1-211ENST00000503687 C8orf87E5RJ46 101 aa7.61□□□□□ -1.19
RABGEF1-211ENST00000503687 Q8N1X5 172 aa7.57□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 Q5VV11 94 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 HRES1P13985 223 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP10-1P60331 282 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZR54 194 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 A8MU10 97 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 Q5W150 140 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 LCE6AA0A183 80 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.53□□□□□ -1.2
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC00483Q53H64 154 aa7.52□□□□□ -1.21
RABGEF1-211ENST00000503687 SPINK7P58062 85 aa7.47□□□□□ -1.21
RABGEF1-211ENST00000503687 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.45□□□□□ -1.22
RABGEF1-211ENST00000503687 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-211ENST00000503687 Q75L30 129 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-211ENST00000503687 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-211ENST00000503687 UQCR11O14957 56 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-211ENST00000503687 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa7.42□□□□□ -1.22
RABGEF1-211ENST00000503687 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.4□□□□□ -1.22
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-211ENST00000503687 LCA10Q71F78 164 aa7.38□□□□□ -1.23
RABGEF1-211ENST00000503687 K7ERS5 55 aa7.37□□□□□ -1.23
RABGEF1-211ENST00000503687 ANK2Q01484 3957 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-211ENST00000503687 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa7.36□□□□□ -1.23
RABGEF1-211ENST00000503687 PRAC1Q96KF2 57 aa7.31□□□□□ -1.24
RABGEF1-211ENST00000503687 DMAC1Q96GE9 116 aa7.27□□□□□ -1.25
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAH10Q8IVF4 4471 aa7.24□□□□□ -1.25
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAH9Q9NYC9 4486 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-211ENST00000503687 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.23□□□□□ -1.25
RABGEF1-211ENST00000503687 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A0D9SG42 100 aa7.2□□□□□ -1.26
RABGEF1-211ENST00000503687 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.15□□□□□ -1.26
RABGEF1-211ENST00000503687 DNHD1Q96M86 4753 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-211ENST00000503687 A0A1B0GU33 70 aa7.14□□□□□ -1.27
RABGEF1-211ENST00000503687 LYSTQ99698 3801 aa7.13□□□□□ -1.27
RABGEF1-211ENST00000503687 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-211ENST00000503687 CRIPTQ9P021 101 aa7.12□□□□□ -1.27
RABGEF1-211ENST00000503687 Q6ZSA8 131 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-211ENST00000503687 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.11□□□□□ -1.27
RABGEF1-211ENST00000503687 CMYA5Q8N3K9 4069 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-211ENST00000503687 A6NN06 94 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.08□□□□□ -1.28
RABGEF1-211ENST00000503687 Q5VSD8 79 aa7.07□□□□□ -1.28
RABGEF1-211ENST00000503687 SPATA8Q6RVD6 105 aa7.06□□□□□ -1.28
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RABGEF1-211ENST00000503687 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.05□□□□□ -1.28
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RABGEF1-211ENST00000503687 LINC01554Q52M75 96 aa7.01□□□□□ -1.29
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7□□□□□ -1.29
RABGEF1-211ENST00000503687 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.99□□□□□ -1.29
RABGEF1-211ENST00000503687 KMT2AQ03164 3969 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-211ENST00000503687 J3QL48 77 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAH3Q8TD57 4116 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-211ENST00000503687 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-211ENST00000503687 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-211ENST00000503687 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.91□□□□□ -1.3
RABGEF1-211ENST00000503687 S4R3F8 94 aa6.89□□□□□ -1.31
RABGEF1-211ENST00000503687 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-211ENST00000503687 A8MUU9 505 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-211ENST00000503687 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGEF1-211ENST00000503687 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.7□□□□□ -1.34
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RABGEF1-211ENST00000503687 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.69□□□□□ -1.34
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RABGEF1-211ENST00000503687 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.64□□□□□ -1.35
RABGEF1-211ENST00000503687 M0QZ58 72 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-211ENST00000503687 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.63□□□□□ -1.35
RABGEF1-211ENST00000503687 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.6□□□□□ -1.35
RABGEF1-211ENST00000503687 P0C880 135 aa6.59□□□□□ -1.35
RABGEF1-211ENST00000503687 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.36
RABGEF1-211ENST00000503687 H3BS24 57 aa6.57□□□□□ -1.36
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