RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497230.2

PRRX1-207, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PRRX1, Length 3,501 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-207ENST00000497230 MIR22HGQ0VDD5 57 aa7.27□□□□□ -1.25
PRRX1-207ENST00000497230 LINC01554Q52M75 96 aa7.26□□□□□ -1.25
PRRX1-207ENST00000497230 DNAH1Q9P2D7 4330 aa7.25□□□□□ -1.25
PRRX1-207ENST00000497230 PANO1I0J062 215 aa7.24□□□□□ -1.25
PRRX1-207ENST00000497230 ANK2Q01484 3957 aa7.24□□□□□ -1.25
PRRX1-207ENST00000497230 CSAG1Q6PB30 78 aa7.23□□□□□ -1.25
PRRX1-207ENST00000497230 Q5W150 140 aa7.22□□□□□ -1.25
PRRX1-207ENST00000497230 UQCR11O14957 56 aa7.22□□□□□ -1.25
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PRRX1-207ENST00000497230 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP24-1Q3LI83 254 aa7.18□□□□□ -1.26
PRRX1-207ENST00000497230 CRIPTQ9P021 101 aa7.18□□□□□ -1.26
PRRX1-207ENST00000497230 SPACA4Q8TDM5 124 aa7.17□□□□□ -1.26
PRRX1-207ENST00000497230 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.16□□□□□ -1.26
PRRX1-207ENST00000497230 TGP01266 2768 aa7.15□□□□□ -1.26
PRRX1-207ENST00000497230 Q8N1X5 172 aa7.14□□□□□ -1.27
PRRX1-207ENST00000497230 SPRR1BP22528 89 aa7.13□□□□□ -1.27
PRRX1-207ENST00000497230 Q6ZR54 194 aa7.13□□□□□ -1.27
PRRX1-207ENST00000497230 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
PRRX1-207ENST00000497230 Q96NJ1 140 aa7.1□□□□□ -1.27
PRRX1-207ENST00000497230 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.09□□□□□ -1.27
PRRX1-207ENST00000497230 FAM229AH3BQW9 127 aa7.08□□□□□ -1.28
PRRX1-207ENST00000497230 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa7.07□□□□□ -1.28
PRRX1-207ENST00000497230 ZNF861PO60384 105 aa7.07□□□□□ -1.28
PRRX1-207ENST00000497230 C1orf134Q5TEV5 83 aa7.06□□□□□ -1.28
PRRX1-207ENST00000497230 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa7.06□□□□□ -1.28
PRRX1-207ENST00000497230 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.04□□□□□ -1.28
PRRX1-207ENST00000497230 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP7.03□□□□□ -1.28
PRRX1-207ENST00000497230 FBN3Q75N90 2809 aa7.02□□□□□ -1.29
PRRX1-207ENST00000497230 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PRRX1-207ENST00000497230 PLAC8Q9NZF1 115 aa7.01□□□□□ -1.29
PRRX1-207ENST00000497230 LY6G6CO95867 125 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-207ENST00000497230 DMAC1Q96GE9 116 aa6.99□□□□□ -1.29
PRRX1-207ENST00000497230 APLNQ9ULZ1 77 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-207ENST00000497230 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-207ENST00000497230 A0A087WTM6 91 aa6.98□□□□□ -1.29
PRRX1-207ENST00000497230 K7ERS5 55 aa6.97□□□□□ -1.29
PRRX1-207ENST00000497230 IGLV7-43P04211 117 aa6.94□□□□□ -1.3
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.92□□□□□ -1.3
PRRX1-207ENST00000497230 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.91□□□□□ -1.3
PRRX1-207ENST00000497230 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.9□□□□□ -1.3
PRRX1-207ENST00000497230 C9orf92A6NGG3 77 aa6.9□□□□□ -1.31
PRRX1-207ENST00000497230 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.9□□□□□ -1.31
PRRX1-207ENST00000497230 NUPR2A6NF83 97 aa6.89□□□□□ -1.31
PRRX1-207ENST00000497230 A0A0D9SG42 100 aa6.88□□□□□ -1.31
PRRX1-207ENST00000497230 LINC00483Q53H64 154 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRX1-207ENST00000497230 LYSTQ99698 3801 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRX1-207ENST00000497230 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.87□□□□□ -1.31
PRRX1-207ENST00000497230 A0A1B0GU33 70 aa6.85□□□□□ -1.31
PRRX1-207ENST00000497230 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.84□□□□□ -1.31
PRRX1-207ENST00000497230 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.84□□□□□ -1.32
PRRX1-207ENST00000497230 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PRRX1-207ENST00000497230 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.8□□□□□ -1.32
PRRX1-207ENST00000497230 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.76□□□□□ -1.33
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.75□□□□□ -1.33
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.75□□□□□ -1.33
PRRX1-207ENST00000497230 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.75□□□□□ -1.33
PRRX1-207ENST00000497230 ROMO1P60602 79 aa6.74□□□□□ -1.33
PRRX1-207ENST00000497230 DNAH6Q9C0G6 4158 aa6.74□□□□□ -1.33
PRRX1-207ENST00000497230 Q6ZSA8 131 aa6.72□□□□□ -1.33
PRRX1-207ENST00000497230 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.72□□□□□ -1.33
PRRX1-207ENST00000497230 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.33
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.71□□□□□ -1.34
PRRX1-207ENST00000497230 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-207ENST00000497230 A8MUU9 505 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-207ENST00000497230 H0YAA0 97 aa6.7□□□□□ -1.34
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP10-2P60368 255 aa6.69□□□□□ -1.34
PRRX1-207ENST00000497230 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-207ENST00000497230 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-207ENST00000497230 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-207ENST00000497230 DNAH2Q9P225 4427 aa6.62□□□□□ -1.35
PRRX1-207ENST00000497230 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.61□□□□□ -1.35
PRRX1-207ENST00000497230 FRAS1Q86XX4 4008 aa6.59□□□□□ -1.35
PRRX1-207ENST00000497230 NDUFAF8A1L188 74 aa6.59□□□□□ -1.35
PRRX1-207ENST00000497230 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.59□□□□□ -1.35
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP10-1P60331 282 aa6.58□□□□□ -1.36
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.57□□□□□ -1.36
PRRX1-207ENST00000497230 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.54□□□□□ -1.36
PRRX1-207ENST00000497230 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.53□□□□□ -1.36
PRRX1-207ENST00000497230 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
PRRX1-207ENST00000497230 KMT2AQ03164 3969 aa6.51□□□□□ -1.37
PRRX1-207ENST00000497230 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.49□□□□□ -1.37
PRRX1-207ENST00000497230 ALMS1Q8TCU4 4167 aa6.47□□□□□ -1.37
PRRX1-207ENST00000497230 P0C880 135 aa6.47□□□□□ -1.37
PRRX1-207ENST00000497230 PKD1P98161 4303 aa6.46□□□□□ -1.38
PRRX1-207ENST00000497230 DNHD1Q96M86 4753 aa6.44□□□□□ -1.38
PRRX1-207ENST00000497230 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.43□□□□□ -1.38
PRRX1-207ENST00000497230 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.43□□□□□ -1.38
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.42□□□□□ -1.38
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.37□□□□□ -1.39
PRRX1-207ENST00000497230 TPRXLQ17RH7 258 aa6.34□□□□□ -1.39
PRRX1-207ENST00000497230 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.34□□□□□ -1.39
PRRX1-207ENST00000497230 S4R3F8 94 aa6.29□□□□□ -1.4
PRRX1-207ENST00000497230 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.28□□□□□ -1.4
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.26□□□□□ -1.41
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.25□□□□□ -1.41
PRRX1-207ENST00000497230 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.23□□□□□ -1.41
PRRX1-207ENST00000497230 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.2□□□□□ -1.42
PRRX1-207ENST00000497230 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.19□□□□□ -1.42
PRRX1-207ENST00000497230 KRTAP12-2P59991 146 aa6.16□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 145.1 ms