RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484547.7

RABGEF1-207, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RABGEF1, Length 1,596 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-207ENST00000484547 PRYO14603 147 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 SPRR1AP35321 89 aa6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 SPRR4Q96PI1 79 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 SNURFQ9Y675 71 aa6.96□□□□□ -1.29
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
RABGEF1-207ENST00000484547 Q8N377 158 aa6.94□□□□□ -1.3
RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF861PO60384 105 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-207ENST00000484547 Q6ZRX8 168 aa6.93□□□□□ -1.3
RABGEF1-207ENST00000484547 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.92□□□□□ -1.3
RABGEF1-207ENST00000484547 Q8NBF4 154 aa6.92□□□□□ -1.3
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RABGEF1-207ENST00000484547 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.89□□□□□ -1.31
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RABGEF1-207ENST00000484547 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.88□□□□□ -1.31
RABGEF1-207ENST00000484547 A0A1W2PNM2 257 aa6.87□□□□□ -1.31
RABGEF1-207ENST00000484547 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.87□□□□□ -1.31
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RABGEF1-207ENST00000484547 Q1T7F1 81 aa6.84□□□□□ -1.31
RABGEF1-207ENST00000484547 Q9BRP9 147 aa6.84□□□□□ -1.31
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RABGEF1-207ENST00000484547 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
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RABGEF1-207ENST00000484547 SMIM29Q86T20 159 aa6.82□□□□□ -1.32
RABGEF1-207ENST00000484547 Q8N9L7 120 aa6.82□□□□□ -1.32
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RABGEF1-207ENST00000484547 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.81□□□□□ -1.32
RABGEF1-207ENST00000484547 V9GYY9 64 aa6.81□□□□□ -1.32
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RABGEF1-207ENST00000484547 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.79□□□□□ -1.32
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RABGEF1-207ENST00000484547 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.78□□□□□ -1.32
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RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.76□□□□□ -1.33
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RABGEF1-207ENST00000484547 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 K7EQZ3 153 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 MP68P56378 58 aa6.74□□□□□ -1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 BRK1Q8WUW1 75 aa6.73□□□□□ -1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 PRLHP81277 87 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 C1orf195Q5TG92 126 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 IGFL1Q6UW32 110 aa6.72□□□□□ -1.33
RABGEF1-207ENST00000484547 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.72□□□□□ -1.33
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RABGEF1-207ENST00000484547 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.66□□□□□ -1.34
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RABGEF1-207ENST00000484547 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.65□□□□□ -1.35
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RABGEF1-207ENST00000484547 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.58□□□□□ -1.36
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.58□□□□□ -1.36
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RABGEF1-207ENST00000484547 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.57□□□□□ -1.36
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RABGEF1-207ENST00000484547 XP32Q5T750 250 aa6.5□□□□□ -1.37
RABGEF1-207ENST00000484547 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.49□□□□□ -1.37
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RABGEF1-207ENST00000484547 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.48□□□□□ -1.37
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RABGEF1-207ENST00000484547 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-207ENST00000484547 MT1HP80294 61 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-207ENST00000484547 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.47□□□□□ -1.37
RABGEF1-207ENST00000484547 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.46□□□□□ -1.38
RABGEF1-207ENST00000484547 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.45□□□□□ -1.38
RABGEF1-207ENST00000484547 CD164Q04900 197 aa6.44□□□□□ -1.38
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