RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481875.1

GARNL3-217, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 639 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-217ENST00000481875 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-217ENST00000481875 PDE6GP18545 87 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-217ENST00000481875 Q6Q795 121 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-217ENST00000481875 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-217ENST00000481875 Q6ZQT0 140 aa6.38□□□□□ -1.39
GARNL3-217ENST00000481875 A0A087WSZ3 146 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-217ENST00000481875 Q5XG85 94 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.37□□□□□ -1.39
GARNL3-217ENST00000481875 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.36□□□□□ -1.39
GARNL3-217ENST00000481875 ETDBQ3ZM63 59 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.35□□□□□ -1.39
GARNL3-217ENST00000481875 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.34□□□□□ -1.39
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-217ENST00000481875 C1orf195Q5TG92 126 aa6.33□□□□□ -1.4
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1B0GW54 56 aa6.32□□□□□ -1.4
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.31□□□□□ -1.4
GARNL3-217ENST00000481875 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.31□□□□□ -1.4
GARNL3-217ENST00000481875 MT1HP80294 61 aa6.27□□□□□ -1.41
GARNL3-217ENST00000481875 NREPQ16612 68 aa6.27□□□□□ -1.41
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV4-1P06312 121 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-217ENST00000481875 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.26□□□□□ -1.41
GARNL3-217ENST00000481875 Q96NJ1 140 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-217ENST00000481875 SIGMAR1Q99720 223 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.25□□□□□ -1.41
GARNL3-217ENST00000481875 PCOTHQ58A44 107 aa6.24□□□□□ -1.41
GARNL3-217ENST00000481875 J3KT08 172 aa6.22□□□□□ -1.41
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00846Q9NV44 126 aa6.22□□□□□ -1.41
GARNL3-217ENST00000481875 UBL5Q9BZL1 73 aa6.21□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 C9orf92A6NGG3 77 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 Q6ZVQ6 151 aa6.2□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 NDUFB1O75438 58 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 ACYP1P07311 99 aa6.19□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 J3QR89 54 aa6.18□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 BPY2O14599 106 aa6.18□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.17□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.16□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 A0A1B0GVX0 72 aa6.15□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 A8MWP4 228 aa6.15□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00313P59037 77 aa6.15□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 LCE3BQ5TA77 95 aa6.15□□□□□ -1.42
GARNL3-217ENST00000481875 DSCR10P59022 87 aa6.14□□□□□ -1.43
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.13□□□□□ -1.43
GARNL3-217ENST00000481875 C8orf87E5RJ46 101 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-217ENST00000481875 PRR15Q8IV56 129 aa6.12□□□□□ -1.43
GARNL3-217ENST00000481875 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.1□□□□□ -1.43
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.09□□□□□ -1.43
GARNL3-217ENST00000481875 K7EQZ3 153 aa6.09□□□□□ -1.43
GARNL3-217ENST00000481875 K7ERU9 68 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 CXCL6P80162 114 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 LCE4AQ5TA78 99 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 Q8N9L7 120 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.08□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 LINC00643Q86TS7 51 aa6.07□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 M0R2T5 61 aa6.06□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.05□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.05□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.04□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 Q75L30 129 aa6.04□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 A0A0A0MQY5 61 aa6.03□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.03□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 hDV103S1A0JD37 113 aa6.03□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.03□□□□□ -1.44
GARNL3-217ENST00000481875 A8MUU9 505 aa6.02□□□□□ -1.45
GARNL3-217ENST00000481875 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.02□□□□□ -1.45
GARNL3-217ENST00000481875 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.02□□□□□ -1.45
GARNL3-217ENST00000481875 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
GARNL3-217ENST00000481875 CASC2Q6XLA1 102 aa6.01□□□□□ -1.45
GARNL3-217ENST00000481875 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.01□□□□□ -1.45
GARNL3-217ENST00000481875 HCG22E2RYF7 251 aa6□□□□□ -1.45
GARNL3-217ENST00000481875 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6□□□□□ -1.45
GARNL3-217ENST00000481875 NDUFS5O43920 106 aa5.98□□□□□ -1.45
GARNL3-217ENST00000481875 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
GARNL3-217ENST00000481875 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.96□□□□□ -1.46
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa5.93□□□□□ -1.46
GARNL3-217ENST00000481875 A0A087WVE0 104 aa5.92□□□□□ -1.46
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.92□□□□□ -1.46
GARNL3-217ENST00000481875 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
GARNL3-217ENST00000481875 MT-ATP8P03928 68 aa5.91□□□□□ -1.46
GARNL3-217ENST00000481875 IMUPQ9GZP8 106 aa5.89□□□□□ -1.47
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa5.88□□□□□ -1.47
GARNL3-217ENST00000481875 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.87□□□□□ -1.47
GARNL3-217ENST00000481875 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa5.86□□□□□ -1.47
GARNL3-217ENST00000481875 SCGB1A1P11684 91 aa5.85□□□□□ -1.47
GARNL3-217ENST00000481875 Q5W150 140 aa5.84□□□□□ -1.47
GARNL3-217ENST00000481875 USH2AO75445 5202 aa5.82□□□□□ -1.48
GARNL3-217ENST00000481875 UQCRQO14949 82 aa5.81□□□□□ -1.48
GARNL3-217ENST00000481875 SPINK7P58062 85 aa5.81□□□□□ -1.48
GARNL3-217ENST00000481875 SSPOA2VEC9 5147 aa5.81□□□□□ -1.48
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.79□□□□□ -1.48
GARNL3-217ENST00000481875 IGKV2-30P06310 120 aa5.79□□□□□ -1.48
GARNL3-217ENST00000481875 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.78□□□□□ -1.48
GARNL3-217ENST00000481875 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.78□□□□□ -1.48
GARNL3-217ENST00000481875 MT2AP02795 61 aa5.78□□□□□ -1.48
GARNL3-217ENST00000481875 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP5.77□□□□□ -1.49
GARNL3-217ENST00000481875 TRAV22A0A0B4J277 110 aa5.76□□□□□ -1.49
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