RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436289.6

NELFE-204, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

TSL 5

Gene NELFE, Length 906 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-204ENST00000436289 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.99□□□□□ -1.29
NELFE-204ENST00000436289 COX8AP10176 69 aa6.98□□□□□ -1.29
NELFE-204ENST00000436289 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
NELFE-204ENST00000436289 TAX1BP3O14907 124 aa6.96□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 H3BMG7 143 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 PCP4P48539 62 aa6.95□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 C8orf87E5RJ46 101 aa6.94□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PNM2 257 aa6.93□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 K7ERU9 68 aa6.93□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 HSD52Q0P140 79 aa6.93□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.93□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.93□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.91□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 RAB37Q96AX2 223 aa6.91□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 C9orf118A6NHY6 69 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 HIGD1BQ9P298 99 aa6.9□□□□□ -1.3
NELFE-204ENST00000436289 H0YGX0 51 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-204ENST00000436289 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.88□□□□□ -1.31
NELFE-204ENST00000436289 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.86□□□□□ -1.31
NELFE-204ENST00000436289 Q5VV11 94 aa6.86□□□□□ -1.31
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GVX0 72 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-204ENST00000436289 K7EP34 96 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP10-5P60370 271 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-204ENST00000436289 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-204ENST00000436289 VPS25Q9BRG1 176 aa6.85□□□□□ -1.31
NELFE-204ENST00000436289 FABP2P12104 132 aa6.84□□□□□ -1.31
NELFE-204ENST00000436289 A0A1W2PPM0 123 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 MT1BP07438 61 aa6.82□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GX51 115 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 DSCR8Q96T75 97 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 HIST1H4GQ99525 98 aa6.81□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.8□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa6.8□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa6.8□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.79□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.79□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 J3QR89 54 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 CEND1Q8N111 149 aa6.78□□□□□ -1.32
NELFE-204ENST00000436289 F8W1H4 67 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 TRACP01848 142 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.77□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 H3BQ85 93 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 SCGB1A1P11684 91 aa6.76□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 J3KT08 172 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 CCKP06307 115 aa6.75□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 A0A0B4J2C4 111 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 A6NJY4 79 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 FXYD2P54710 66 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.73□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 NDUFB1O75438 58 aa6.72□□□□□ -1.33
NELFE-204ENST00000436289 SPRR2EP22531 72 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-204ENST00000436289 SPRR2BP35325 72 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-204ENST00000436289 SPRR2AP35326 72 aa6.71□□□□□ -1.34
NELFE-204ENST00000436289 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
NELFE-204ENST00000436289 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-204ENST00000436289 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-204ENST00000436289 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.67□□□□□ -1.34
NELFE-204ENST00000436289 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.66□□□□□ -1.34
NELFE-204ENST00000436289 K7ERJ3 54 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-204ENST00000436289 DNAL4O96015 105 aa6.65□□□□□ -1.34
NELFE-204ENST00000436289 TRIAP1O43715 76 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-204ENST00000436289 IMUPQ9GZP8 106 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-204ENST00000436289 PRO0461Q9UI25 63 aa6.64□□□□□ -1.35
NELFE-204ENST00000436289 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.63□□□□□ -1.35
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GV72 72 aa6.62□□□□□ -1.35
NELFE-204ENST00000436289 ETDBQ3ZM63 59 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-204ENST00000436289 Q6ZVQ6 151 aa6.6□□□□□ -1.35
NELFE-204ENST00000436289 PSMB2P49721 201 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-204ENST00000436289 C5orf47Q569G3 176 aa6.57□□□□□ -1.36
NELFE-204ENST00000436289 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
NELFE-204ENST00000436289 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.55□□□□□ -1.36
NELFE-204ENST00000436289 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
NELFE-204ENST00000436289 CSAG1Q6PB30 78 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-204ENST00000436289 Q6ZQT0 140 aa6.54□□□□□ -1.36
NELFE-204ENST00000436289 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-204ENST00000436289 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.53□□□□□ -1.36
NELFE-204ENST00000436289 KLKP1Q107X0 134 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 ATXN8Q156A1 80 aa6.52□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 SPRR2DP22532 72 aa6.51□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.51□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 IGKV2-30P06310 120 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 COX6CP09669 75 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.5□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 GPR98Q8WXG9 6306 aa6.49□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 A0A1B0GW54 56 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 C9JAW5 83 aa6.48□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 H3BT86 120 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 PRR15Q8IV56 129 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 CRIPTQ9P021 101 aa6.47□□□□□ -1.37
NELFE-204ENST00000436289 C4orf26Q17RF5 130 aa6.46□□□□□ -1.38
NELFE-204ENST00000436289 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.44□□□□□ -1.38
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