RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409093.1

LRRTM4-202, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,247 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1W2PNM2 257 aa6.13□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 Q8NBF4 154 aa6.13□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 SPRR1BP22528 89 aa6.12□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1B0GW54 56 aa6.11□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 IGFL1Q6UW32 110 aa6.1□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 CASC2Q6XLA1 102 aa6.1□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00208Q96KT6 92 aa6.1□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.1□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.1□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.09□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A0G2JQZ4 141 aa6.09□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 SPRR4Q96PI1 79 aa6.09□□□□□ -1.43
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.08□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.08□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAH8Q96JB1 4490 aa6.08□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.07□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 ZNF861PO60384 105 aa6.07□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.07□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 SPINK7P58062 85 aa6.07□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP10-1P60331 282 aa6.07□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 PKD1P98161 4303 aa6.06□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 NDUFB1O75438 58 aa6.06□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 Q6ZSA8 131 aa6.06□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 IGLV7-43P04211 117 aa6.05□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.04□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00483Q53H64 154 aa6.04□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A087WSZ3 146 aa6.03□□□□□ -1.44
LRRTM4-202ENST00000409093 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.02□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 SACSQ9NZJ4 4579 aa6.01□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 CSAG1Q6PB30 78 aa6□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.99□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.98□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 COA5Q86WW8 74 aa5.97□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 DSCR10P59022 87 aa5.97□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 DEFB116Q30KQ4 102 aa5.97□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 SPAG11AQ6PDA7 123 aa5.97□□□□□ -1.45
LRRTM4-202ENST00000409093 PKHD1P08F94 4074 aa5.96□□□□□ -1.46
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A087X002 238 aa5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-202ENST00000409093 K7EQZ3 153 aa5.95□□□□□ -1.46
LRRTM4-202ENST00000409093 ROMO1P60602 79 aa5.94□□□□□ -1.46
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1B0GVY2 172 aa5.93□□□□□ -1.46
LRRTM4-202ENST00000409093 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.92□□□□□ -1.46
LRRTM4-202ENST00000409093 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa5.9□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 A8MWP4 228 aa5.89□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa5.88□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 Q96NJ1 140 aa5.87□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 RYR2Q92736 4967 aa5.87□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 WFDC13Q8IUB5 93 aa5.86□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.85□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 H0Y9P7 68 aa5.84□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 P0C880 135 aa5.84□□□□□ -1.47
LRRTM4-202ENST00000409093 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.83□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 SPINK6Q6UWN8 80 aa5.83□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa5.82□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 CDK2AP2O75956 126 aa5.82□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa5.8□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa5.8□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 H3BPC8 53 aa5.8□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1B0GVX0 72 aa5.79□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.78□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 TYMSOSQ8TAI1 123 aa5.78□□□□□ -1.48
LRRTM4-202ENST00000409093 C8orf17Q9NRJ1 99 aa5.77□□□□□ -1.49
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.75□□□□□ -1.49
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
LRRTM4-202ENST00000409093 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.75□□□□□ -1.49
LRRTM4-202ENST00000409093 FAT1Q14517 4588 aa5.73□□□□□ -1.49
LRRTM4-202ENST00000409093 HRES1P13985 223 aa5.72□□□□□ -1.49
LRRTM4-202ENST00000409093 SPINK1P00995 79 aa5.72□□□□□ -1.49
LRRTM4-202ENST00000409093 LINC00304Q8N9R0 145 aa5.71□□□□□ -1.49
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.71□□□□□ -1.5
LRRTM4-202ENST00000409093 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
LRRTM4-202ENST00000409093 RYR3Q15413 4870 aa5.7□□□□□ -1.5
LRRTM4-202ENST00000409093 FAM229AH3BQW9 127 aa5.7□□□□□ -1.5
LRRTM4-202ENST00000409093 PCOTHQ58A44 107 aa5.7□□□□□ -1.5
LRRTM4-202ENST00000409093 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa5.69□□□□□ -1.5
LRRTM4-202ENST00000409093 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.67□□□□□ -1.5
LRRTM4-202ENST00000409093 Q5VSD8 79 aa5.66□□□□□ -1.5
LRRTM4-202ENST00000409093 HSPG2P98160 4391 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-202ENST00000409093 A8MUU9 505 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-202ENST00000409093 NDUFAF8A1L188 74 aa5.62□□□□□ -1.51
LRRTM4-202ENST00000409093 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.61□□□□□ -1.51
LRRTM4-202ENST00000409093 UQCR11O14957 56 aa5.6□□□□□ -1.51
LRRTM4-202ENST00000409093 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.6□□□□□ -1.51
LRRTM4-202ENST00000409093 A0A1B0GU69 56 aa5.59□□□□□ -1.51
LRRTM4-202ENST00000409093 Q5W150 140 aa5.58□□□□□ -1.52
LRRTM4-202ENST00000409093 RYR1P21817 5038 aa5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-202ENST00000409093 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.55□□□□□ -1.52
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.55□□□□□ -1.52
LRRTM4-202ENST00000409093 Q8N1X5 172 aa5.54□□□□□ -1.52
LRRTM4-202ENST00000409093 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.53□□□□□ -1.52
LRRTM4-202ENST00000409093 KRTAP10-8P60410 259 aa5.53□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 129.8 ms