RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373433.8

RPRD1B-201, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RPRD1B, Length 3,874 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-201ENST00000373433 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.84□□□□□ -1.31
RPRD1B-201ENST00000373433 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
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RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP10-2P60368 255 aa6.8□□□□□ -1.32
RPRD1B-201ENST00000373433 C9orf92A6NGG3 77 aa6.79□□□□□ -1.32
RPRD1B-201ENST00000373433 HRES1P13985 223 aa6.78□□□□□ -1.32
RPRD1B-201ENST00000373433 PANO1I0J062 215 aa6.78□□□□□ -1.32
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.77□□□□□ -1.33
RPRD1B-201ENST00000373433 PRAC1Q96KF2 57 aa6.77□□□□□ -1.33
RPRD1B-201ENST00000373433 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.76□□□□□ -1.33
RPRD1B-201ENST00000373433 COL7A1Q02388 2944 aa6.76□□□□□ -1.33
RPRD1B-201ENST00000373433 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.76□□□□□ -1.33
RPRD1B-201ENST00000373433 ZNF861PO60384 105 aa6.76□□□□□ -1.33
RPRD1B-201ENST00000373433 J3QL48 77 aa6.75□□□□□ -1.33
RPRD1B-201ENST00000373433 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.75□□□□□ -1.33
RPRD1B-201ENST00000373433 Q96NJ1 140 aa6.74□□□□□ -1.33
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RPRD1B-201ENST00000373433 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.73□□□□□ -1.33
RPRD1B-201ENST00000373433 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.72□□□□□ -1.33
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RPRD1B-201ENST00000373433 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.64□□□□□ -1.35
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAH10Q8IVF4 4471 aa6.63□□□□□ -1.35
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RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1B0GU69 56 aa6.61□□□□□ -1.35
RPRD1B-201ENST00000373433 Q5W150 140 aa6.6□□□□□ -1.35
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC01554Q52M75 96 aa6.6□□□□□ -1.35
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RPRD1B-201ENST00000373433 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.55□□□□□ -1.36
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAH1Q9P2D7 4330 aa6.55□□□□□ -1.36
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RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.54□□□□□ -1.36
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RPRD1B-201ENST00000373433 Q8N1X5 172 aa6.51□□□□□ -1.37
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RPRD1B-201ENST00000373433 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.49□□□□□ -1.37
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RPRD1B-201ENST00000373433 Q6ZSA8 131 aa6.48□□□□□ -1.37
RPRD1B-201ENST00000373433 LINC00483Q53H64 154 aa6.47□□□□□ -1.37
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RPRD1B-201ENST00000373433 K7ERS5 55 aa6.43□□□□□ -1.38
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RPRD1B-201ENST00000373433 STARD9Q9P2P6 4700 aa6.38□□□□□ -1.39
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1B0GVY2 172 aa6.36□□□□□ -1.39
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RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAH7Q8WXX0 4024 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A0D9SG42 100 aa6.29□□□□□ -1.4
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RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.25□□□□□ -1.41
RPRD1B-201ENST00000373433 M0R2T5 61 aa6.23□□□□□ -1.41
RPRD1B-201ENST00000373433 VPS13DQ5THJ4 4388 aa6.23□□□□□ -1.41
RPRD1B-201ENST00000373433 KMT2AQ03164 3969 aa6.23□□□□□ -1.41
RPRD1B-201ENST00000373433 CRIPTQ9P021 101 aa6.21□□□□□ -1.42
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.2□□□□□ -1.42
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.2□□□□□ -1.42
RPRD1B-201ENST00000373433 H0YAA0 97 aa6.19□□□□□ -1.42
RPRD1B-201ENST00000373433 A8MUU9 505 aa6.17□□□□□ -1.42
RPRD1B-201ENST00000373433 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.17□□□□□ -1.42
RPRD1B-201ENST00000373433 ROMO1P60602 79 aa6.17□□□□□ -1.42
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAH17Q9UFH2 4485 aa6.16□□□□□ -1.42
RPRD1B-201ENST00000373433 A0A1B0GU33 70 aa6.14□□□□□ -1.43
RPRD1B-201ENST00000373433 HECTD4Q9Y4D8 3996 aa6.13□□□□□ -1.43
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RPRD1B-201ENST00000373433 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.04□□□□□ -1.44
RPRD1B-201ENST00000373433 HYDINQ4G0P3 5121 aa6.01□□□□□ -1.45
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAH2Q9P225 4427 aa6.01□□□□□ -1.45
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP10-8P60410 259 aa5.99□□□□□ -1.45
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
RPRD1B-201ENST00000373433 P0C880 135 aa5.99□□□□□ -1.45
RPRD1B-201ENST00000373433 DNAH6Q9C0G6 4158 aa5.98□□□□□ -1.45
RPRD1B-201ENST00000373433 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.97□□□□□ -1.45
RPRD1B-201ENST00000373433 LRP1BQ9NZR2 4599 aa5.96□□□□□ -1.46
RPRD1B-201ENST00000373433 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.46
RPRD1B-201ENST00000373433 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RPRD1B-201ENST00000373433 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
RPRD1B-201ENST00000373433 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.95□□□□□ -1.46
RPRD1B-201ENST00000373433 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.94□□□□□ -1.46
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