RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264244.7

TIMMDC1-201, Transcript of translocase of inner mitochondrial membrane domain containing 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TIMMDC1, Length 1,271 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMMDC1-201ENST00000264244 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.69□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.69□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 DNAL4O96015 105 aa6.69□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM236CP0DP71 79 aa6.69□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 COX17Q14061 63 aa6.69□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa6.67□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPRR1AP35321 89 aa6.67□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC00308Q8TCZ7 52 aa6.67□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.67□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.67□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRYO14603 147 aa6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC00158P58513 81 aa6.66□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 C9orf92A6NGG3 77 aa6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 H0YGX0 51 aa6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 V9GYY9 64 aa6.65□□□□□ -1.34
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.64□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 ERC2-IT1O76042 136 aa6.64□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.64□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.63□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A0U1RRA0 63 aa6.63□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 SEC61GP60059 68 aa6.63□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 MIR7-3HGQ8N6C7 128 aa6.63□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa6.62□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.61□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 NDUFC1O43677 76 aa6.61□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 CCKP06307 115 aa6.61□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 C1orf195Q5TG92 126 aa6.61□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC00846Q9NV44 126 aa6.61□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 NCR3O14931 201 aa6.59□□□□□ -1.35
TIMMDC1-201ENST00000264244 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.58□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 KLKP1Q107X0 134 aa6.58□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa6.58□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.58□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q9BRP9 147 aa6.58□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A087WVE0 104 aa6.57□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 IGLV6-57P01721 117 aa6.57□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.57□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.57□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 H7BZZ5 65 aa6.56□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 C20orf197Q8N268 126 aa6.56□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.55□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 LCE5AQ5TCM9 118 aa6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 LIMD2Q9BT23 127 aa6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.54□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.53□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q6ZRX8 168 aa6.53□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 UBL5Q9BZL1 73 aa6.53□□□□□ -1.36
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.52□□□□□ -1.37
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-201ENST00000264244 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.51□□□□□ -1.37
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-201ENST00000264244 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-201ENST00000264244 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-201ENST00000264244 BRK1Q8WUW1 75 aa6.49□□□□□ -1.37
TIMMDC1-201ENST00000264244 F8WEM9 126 aa6.48□□□□□ -1.37
TIMMDC1-201ENST00000264244 H3BQ85 93 aa6.47□□□□□ -1.37
TIMMDC1-201ENST00000264244 CXCL6P80162 114 aa6.46□□□□□ -1.38
TIMMDC1-201ENST00000264244 PDE6GP18545 87 aa6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-201ENST00000264244 PRR15Q8IV56 129 aa6.45□□□□□ -1.38
TIMMDC1-201ENST00000264244 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.44□□□□□ -1.38
TIMMDC1-201ENST00000264244 SPRR1BP22528 89 aa6.42□□□□□ -1.38
TIMMDC1-201ENST00000264244 PMAIP1Q13794 54 aa6.42□□□□□ -1.38
TIMMDC1-201ENST00000264244 CD164Q04900 197 aa6.41□□□□□ -1.38
TIMMDC1-201ENST00000264244 SNURFQ9Y675 71 aa6.4□□□□□ -1.38
TIMMDC1-201ENST00000264244 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 C6orf99Q4VX62 202 aa6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q6ZQT0 140 aa6.39□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 MT2AP02795 61 aa6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.38□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 H3BS24 57 aa6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q6ZVQ6 151 aa6.37□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 COX7BP24311 80 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 NREPQ16612 68 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 SMIM29Q86T20 159 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.36□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q1T7F1 81 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 LINC00575Q6W349 94 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.34□□□□□ -1.39
TIMMDC1-201ENST00000264244 MT1FP04733 61 aa6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.32□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 A0A0G2JQZ4 141 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.31□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 BPY2O14599 106 aa6.3□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 hDV103S1A0JD37 113 aa6.29□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 DEFB105AQ8NG35 78 aa6.29□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.28□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 Q75L30 129 aa6.28□□□□□ -1.4
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP10-10P60014 251 aa6.27□□□□□ -1.41
TIMMDC1-201ENST00000264244 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.27□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.8 ms