RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249501.4

HOXD10-201, Transcript of homeobox D10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HOXD10, Length 1,989 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10-201ENST00000249501 NDUFB1O75438 58 aa10.92□□□□□ -0.66
HOXD10-201ENST00000249501 SPINK1P00995 79 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXD10-201ENST00000249501 WFDC13Q8IUB5 93 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXD10-201ENST00000249501 Q8N1X5 172 aa10.91□□□□□ -0.66
HOXD10-201ENST00000249501 LIMD2Q9BT23 127 aa10.9□□□□□ -0.66
HOXD10-201ENST00000249501 C1orf195Q5TG92 126 aa10.9□□□□□ -0.66
HOXD10-201ENST00000249501 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.88□□□□□ -0.67
HOXD10-201ENST00000249501 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa10.88□□□□□ -0.67
HOXD10-201ENST00000249501 A0A1B0GVX0 72 aa10.88□□□□□ -0.67
HOXD10-201ENST00000249501 SPAG11AQ6PDA7 123 aa10.86□□□□□ -0.67
HOXD10-201ENST00000249501 FAT3Q8TDW7 4589 aa10.86□□□□□ -0.67
HOXD10-201ENST00000249501 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.86□□□□□ -0.67
HOXD10-201ENST00000249501 TNXBP22105 4242 aa10.86□□□□□ -0.67
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
HOXD10-201ENST00000249501 CASC2Q6XLA1 102 aa10.84□□□□□ -0.67
HOXD10-201ENST00000249501 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa10.84□□□□□ -0.67
HOXD10-201ENST00000249501 C20orf197Q8N268 126 aa10.83□□□□□ -0.68
HOXD10-201ENST00000249501 C8orf17Q9NRJ1 99 aa10.83□□□□□ -0.68
HOXD10-201ENST00000249501 RPS29P62273 56 aaKnown RBP10.81□□□□□ -0.68
HOXD10-201ENST00000249501 OCR1Q9BZK8 76 aa10.81□□□□□ -0.68
HOXD10-201ENST00000249501 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP10-8P60410 259 aa10.79□□□□□ -0.68
HOXD10-201ENST00000249501 hDV103S1A0JD37 113 aa10.79□□□□□ -0.68
HOXD10-201ENST00000249501 KLKP1Q107X0 134 aa10.77□□□□□ -0.69
HOXD10-201ENST00000249501 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa10.74□□□□□ -0.69
HOXD10-201ENST00000249501 FAM236CP0DP71 79 aa10.74□□□□□ -0.69
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa10.74□□□□□ -0.69
HOXD10-201ENST00000249501 MYCBP2O75592 4640 aa10.74□□□□□ -0.69
HOXD10-201ENST00000249501 H7BZZ5 65 aa10.72□□□□□ -0.69
HOXD10-201ENST00000249501 BIRC6Q9NR09 4857 aa10.71□□□□□ -0.69
HOXD10-201ENST00000249501 C8orf87E5RJ46 101 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 NDUFC1O43677 76 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 OXTP01178 125 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 LINC00313P59037 77 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 RETNLBQ9BQ08 111 aa10.69□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP10.69□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 TMEM254Q8TBM7 123 aa10.68□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 MT1HL1P0DM35 61 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 SNURFQ9Y675 71 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 SERP1Q9Y6X1 66 aa10.66□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 C5orf47Q569G3 176 aa10.65□□□□□ -0.7
HOXD10-201ENST00000249501 NDUFS5O43920 106 aa10.64□□□□□ -0.71
HOXD10-201ENST00000249501 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP10.61□□□□□ -0.71
HOXD10-201ENST00000249501 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.6□□□□□ -0.71
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa10.6□□□□□ -0.71
HOXD10-201ENST00000249501 HERC2O95714 4834 aa10.59□□□□□ -0.71
HOXD10-201ENST00000249501 LCE2BO14633 110 aa10.59□□□□□ -0.71
HOXD10-201ENST00000249501 ABCA13Q86UQ4 5058 aa10.58□□□□□ -0.72
HOXD10-201ENST00000249501 A0A0U1RQV1 116 aa10.57□□□□□ -0.72
HOXD10-201ENST00000249501 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa10.56□□□□□ -0.72
HOXD10-201ENST00000249501 H0Y9P7 68 aa10.54□□□□□ -0.72
HOXD10-201ENST00000249501 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.54□□□□□ -0.72
HOXD10-201ENST00000249501 C9orf92A6NGG3 77 aa10.53□□□□□ -0.72
HOXD10-201ENST00000249501 C4orf26Q17RF5 130 aa10.53□□□□□ -0.72
HOXD10-201ENST00000249501 TRAV22A0A0B4J277 110 aa10.52□□□□□ -0.73
HOXD10-201ENST00000249501 MP68P56378 58 aa10.51□□□□□ -0.73
HOXD10-201ENST00000249501 LINC00208Q96KT6 92 aa10.5□□□□□ -0.73
HOXD10-201ENST00000249501 SMIM26A0A096LP01 95 aa10.49□□□□□ -0.73
HOXD10-201ENST00000249501 Q5W150 140 aa10.49□□□□□ -0.73
HOXD10-201ENST00000249501 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.48□□□□□ -0.73
HOXD10-201ENST00000249501 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa10.43□□□□□ -0.74
HOXD10-201ENST00000249501 C1orf64Q8NEQ6 169 aa10.43□□□□□ -0.74
HOXD10-201ENST00000249501 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.42□□□□□ -0.74
HOXD10-201ENST00000249501 H3BPC8 53 aa10.41□□□□□ -0.74
HOXD10-201ENST00000249501 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.39□□□□□ -0.75
HOXD10-201ENST00000249501 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa10.35□□□□□ -0.75
HOXD10-201ENST00000249501 A8MUU9 505 aa10.35□□□□□ -0.75
HOXD10-201ENST00000249501 PRR4Q16378 134 aa10.34□□□□□ -0.75
HOXD10-201ENST00000249501 J3QL48 77 aa10.31□□□□□ -0.76
HOXD10-201ENST00000249501 PCOTHQ58A44 107 aa10.3□□□□□ -0.76
HOXD10-201ENST00000249501 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa10.28□□□□□ -0.76
HOXD10-201ENST00000249501 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.26□□□□□ -0.77
HOXD10-201ENST00000249501 Q75L30 129 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXD10-201ENST00000249501 IGKV2-30P06310 120 aa10.25□□□□□ -0.77
HOXD10-201ENST00000249501 XP32Q5T750 250 aa10.23□□□□□ -0.77
HOXD10-201ENST00000249501 PRO0628Q9UI54 55 aa10.23□□□□□ -0.77
HOXD10-201ENST00000249501 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa10.21□□□□□ -0.77
HOXD10-201ENST00000249501 PCLOQ9Y6V0 5065 aa10.19□□□□□ -0.78
HOXD10-201ENST00000249501 MPLKIPQ8TAP9 179 aa10.19□□□□□ -0.78
HOXD10-201ENST00000249501 LPAP08519 4548 aa10.18□□□□□ -0.78
HOXD10-201ENST00000249501 RPL37P61927 97 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
HOXD10-201ENST00000249501 TPRXLQ17RH7 258 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXD10-201ENST00000249501 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.15□□□□□ -0.78
HOXD10-201ENST00000249501 HRES1P13985 223 aa10.12□□□□□ -0.79
HOXD10-201ENST00000249501 C7orf65Q6ZTY9 151 aa10.12□□□□□ -0.79
HOXD10-201ENST00000249501 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa10.11□□□□□ -0.79
HOXD10-201ENST00000249501 Q1T7F1 81 aa10.1□□□□□ -0.79
HOXD10-201ENST00000249501 LRP2P98164 4655 aa10.1□□□□□ -0.79
HOXD10-201ENST00000249501 BRK1Q8WUW1 75 aa10.08□□□□□ -0.8
HOXD10-201ENST00000249501 SPINK7P58062 85 aa10.05□□□□□ -0.8
HOXD10-201ENST00000249501 V9GYY9 64 aa10.01□□□□□ -0.81
HOXD10-201ENST00000249501 HERC1Q15751 4861 aa9.98□□□□□ -0.81
HOXD10-201ENST00000249501 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
HOXD10-201ENST00000249501 DMAC1Q96GE9 116 aa9.93□□□□□ -0.82
HOXD10-201ENST00000249501 COA5Q86WW8 74 aa9.91□□□□□ -0.82
HOXD10-201ENST00000249501 PSPHP1O15172 72 aa9.9□□□□□ -0.83
HOXD10-201ENST00000249501 ACYP2P14621 99 aa9.87□□□□□ -0.83
HOXD10-201ENST00000249501 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.84□□□□□ -0.83
HOXD10-201ENST00000249501 A8MUN3 132 aa9.83□□□□□ -0.84
HOXD10-201ENST00000249501 LCE2CQ5TA81 110 aa9.83□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 75.2 ms