RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 H0Y9P7 68 aa6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.65□□□□□ -1.34
PRRX1-201ENST00000239461 SPINT4Q6UDR6 99 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-201ENST00000239461 FAT2Q9NYQ8 4349 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-201ENST00000239461 Q5VV11 94 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-201ENST00000239461 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-201ENST00000239461 IGFL1Q6UW32 110 aa6.64□□□□□ -1.35
PRRX1-201ENST00000239461 PKD1P98161 4303 aa6.63□□□□□ -1.35
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1W2PNM2 257 aa6.63□□□□□ -1.35
PRRX1-201ENST00000239461 DNAH11Q96DT5 4516 aa6.63□□□□□ -1.35
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PRRX1-201ENST00000239461 MIR22HGQ0VDD5 57 aa6.5□□□□□ -1.37
PRRX1-201ENST00000239461 A8MWP4 228 aa6.5□□□□□ -1.37
PRRX1-201ENST00000239461 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.5□□□□□ -1.37
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PRRX1-201ENST00000239461 A0A1B0GVX0 72 aa6.38□□□□□ -1.39
PRRX1-201ENST00000239461 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.38□□□□□ -1.39
PRRX1-201ENST00000239461 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.38□□□□□ -1.39
PRRX1-201ENST00000239461 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.38□□□□□ -1.39
PRRX1-201ENST00000239461 ACYP2P14621 99 aa6.36□□□□□ -1.39
PRRX1-201ENST00000239461 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.35□□□□□ -1.39
PRRX1-201ENST00000239461 Q6ZSA8 131 aa6.35□□□□□ -1.39
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PRRX1-201ENST00000239461 LUZP6Q538Z0 58 aa6.34□□□□□ -1.39
PRRX1-201ENST00000239461 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.4
PRRX1-201ENST00000239461 PKHD1P08F94 4074 aa6.32□□□□□ -1.4
PRRX1-201ENST00000239461 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.3□□□□□ -1.4
PRRX1-201ENST00000239461 RYR3Q15413 4870 aa6.27□□□□□ -1.4
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PRRX1-201ENST00000239461 Q8N1X5 172 aa6.22□□□□□ -1.41
PRRX1-201ENST00000239461 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.22□□□□□ -1.41
PRRX1-201ENST00000239461 A0A087X002 238 aa6.22□□□□□ -1.41
PRRX1-201ENST00000239461 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.21□□□□□ -1.42
PRRX1-201ENST00000239461 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.16□□□□□ -1.42
PRRX1-201ENST00000239461 DMAC1Q96GE9 116 aa6.16□□□□□ -1.42
PRRX1-201ENST00000239461 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.43
PRRX1-201ENST00000239461 HRES1P13985 223 aa6.13□□□□□ -1.43
PRRX1-201ENST00000239461 HSPG2P98160 4391 aa6.1□□□□□ -1.43
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.09□□□□□ -1.43
PRRX1-201ENST00000239461 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.09□□□□□ -1.43
PRRX1-201ENST00000239461 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.09□□□□□ -1.43
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.09□□□□□ -1.43
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
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