RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000216268.5

ZBED4-201, Transcript of zinc finger BED-type containing 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZBED4, Length 6,893 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED4-201ENST00000216268 LCE6AA0A183 80 aa7.03□□□□□ -1.28
ZBED4-201ENST00000216268 A8MU10 97 aa7.03□□□□□ -1.28
ZBED4-201ENST00000216268 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.03□□□□□ -1.28
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP10-11P60412 298 aa7.02□□□□□ -1.29
ZBED4-201ENST00000216268 C9orf92A6NGG3 77 aa7.02□□□□□ -1.29
ZBED4-201ENST00000216268 RPL37P61927 97 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
ZBED4-201ENST00000216268 Q6ZR54 194 aa7.02□□□□□ -1.29
ZBED4-201ENST00000216268 NDUFAF8A1L188 74 aa7.01□□□□□ -1.29
ZBED4-201ENST00000216268 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7□□□□□ -1.29
ZBED4-201ENST00000216268 LINC00304Q8N9R0 145 aa7□□□□□ -1.29
ZBED4-201ENST00000216268 SPRR1AP35321 89 aa7□□□□□ -1.29
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
ZBED4-201ENST00000216268 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
ZBED4-201ENST00000216268 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa6.95□□□□□ -1.3
ZBED4-201ENST00000216268 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.95□□□□□ -1.3
ZBED4-201ENST00000216268 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.95□□□□□ -1.3
ZBED4-201ENST00000216268 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.95□□□□□ -1.3
ZBED4-201ENST00000216268 TNP2Q05952 138 aa6.93□□□□□ -1.3
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.93□□□□□ -1.3
ZBED4-201ENST00000216268 CASC10Q5T4H9 136 aa6.93□□□□□ -1.3
ZBED4-201ENST00000216268 SPRR1BP22528 89 aa6.92□□□□□ -1.3
ZBED4-201ENST00000216268 K7EIL1 84 aa6.9□□□□□ -1.31
ZBED4-201ENST00000216268 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.87□□□□□ -1.31
ZBED4-201ENST00000216268 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.85□□□□□ -1.31
ZBED4-201ENST00000216268 PDZD2O15018 2839 aa6.85□□□□□ -1.31
ZBED4-201ENST00000216268 S4R3F8 94 aa6.83□□□□□ -1.32
ZBED4-201ENST00000216268 A0A087WTM6 91 aa6.82□□□□□ -1.32
ZBED4-201ENST00000216268 PANO1I0J062 215 aa6.82□□□□□ -1.32
ZBED4-201ENST00000216268 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
ZBED4-201ENST00000216268 A8MUU9 505 aa6.81□□□□□ -1.32
ZBED4-201ENST00000216268 VWFP04275 2813 aa6.8□□□□□ -1.32
ZBED4-201ENST00000216268 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
ZBED4-201ENST00000216268 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.76□□□□□ -1.33
ZBED4-201ENST00000216268 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.74□□□□□ -1.33
ZBED4-201ENST00000216268 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.73□□□□□ -1.33
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.73□□□□□ -1.33
ZBED4-201ENST00000216268 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.72□□□□□ -1.33
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.69□□□□□ -1.34
ZBED4-201ENST00000216268 PLAC4Q8WY50 150 aa6.67□□□□□ -1.34
ZBED4-201ENST00000216268 R4GN34 69 aa6.66□□□□□ -1.34
ZBED4-201ENST00000216268 WWC2-AS2Q96NR7 200 aa6.65□□□□□ -1.34
ZBED4-201ENST00000216268 TENM3Q9P273 2699 aa6.64□□□□□ -1.35
ZBED4-201ENST00000216268 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.63□□□□□ -1.35
ZBED4-201ENST00000216268 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.61□□□□□ -1.35
ZBED4-201ENST00000216268 Q6ZSA8 131 aa6.58□□□□□ -1.36
ZBED4-201ENST00000216268 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.58□□□□□ -1.36
ZBED4-201ENST00000216268 M0QZ58 72 aa6.57□□□□□ -1.36
ZBED4-201ENST00000216268 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
ZBED4-201ENST00000216268 TGP01266 2768 aa6.5□□□□□ -1.37
ZBED4-201ENST00000216268 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.49□□□□□ -1.37
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.49□□□□□ -1.37
ZBED4-201ENST00000216268 TENM2Q9NT68 2774 aa6.48□□□□□ -1.37
ZBED4-201ENST00000216268 J3QL48 77 aa6.46□□□□□ -1.37
ZBED4-201ENST00000216268 AKAP9Q99996 3911 aa6.46□□□□□ -1.38
ZBED4-201ENST00000216268 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.4□□□□□ -1.38
ZBED4-201ENST00000216268 P0C880 135 aa6.4□□□□□ -1.39
ZBED4-201ENST00000216268 H0YAA0 97 aa6.39□□□□□ -1.39
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.33□□□□□ -1.4
ZBED4-201ENST00000216268 PP632Q6XCG6 107 aa6.33□□□□□ -1.4
ZBED4-201ENST00000216268 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.28□□□□□ -1.4
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP10-2P60368 255 aa6.27□□□□□ -1.41
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.26□□□□□ -1.41
ZBED4-201ENST00000216268 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ZBED4-201ENST00000216268 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
ZBED4-201ENST00000216268 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
ZBED4-201ENST00000216268 TNP1P09430 55 aa6.21□□□□□ -1.42
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP10-1P60331 282 aa6.18□□□□□ -1.42
ZBED4-201ENST00000216268 COL7A1Q02388 2944 aa6.17□□□□□ -1.42
ZBED4-201ENST00000216268 M0R2T5 61 aa6.15□□□□□ -1.43
ZBED4-201ENST00000216268 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
ZBED4-201ENST00000216268 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP10-8P60410 259 aa6.1□□□□□ -1.43
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.1□□□□□ -1.43
ZBED4-201ENST00000216268 FBN3Q75N90 2809 aa6.04□□□□□ -1.44
ZBED4-201ENST00000216268 TPRXLQ17RH7 258 aa6□□□□□ -1.45
ZBED4-201ENST00000216268 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.96□□□□□ -1.45
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.96□□□□□ -1.45
ZBED4-201ENST00000216268 Q5VSD8 79 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED4-201ENST00000216268 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.94□□□□□ -1.46
ZBED4-201ENST00000216268 ANK2Q01484 3957 aa5.93□□□□□ -1.46
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.92□□□□□ -1.46
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP12-2P59991 146 aa5.85□□□□□ -1.47
ZBED4-201ENST00000216268 INE1O15225 51 aa5.82□□□□□ -1.48
ZBED4-201ENST00000216268 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP5.79□□□□□ -1.48
ZBED4-201ENST00000216268 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.79□□□□□ -1.48
ZBED4-201ENST00000216268 LYSTQ99698 3801 aa5.77□□□□□ -1.49
ZBED4-201ENST00000216268 DNHD1Q96M86 4753 aa5.76□□□□□ -1.49
ZBED4-201ENST00000216268 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.74□□□□□ -1.49
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.73□□□□□ -1.49
ZBED4-201ENST00000216268 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.73□□□□□ -1.49
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP12-1P59990 96 aa5.73□□□□□ -1.49
ZBED4-201ENST00000216268 CMYA5Q8N3K9 4069 aa5.71□□□□□ -1.49
ZBED4-201ENST00000216268 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.71□□□□□ -1.5
ZBED4-201ENST00000216268 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP5.68□□□□□ -1.5
ZBED4-201ENST00000216268 KMT2AQ03164 3969 aa5.67□□□□□ -1.5
ZBED4-201ENST00000216268 XP32Q5T750 250 aa5.66□□□□□ -1.5
ZBED4-201ENST00000216268 STARD9Q9P2P6 4700 aa5.62□□□□□ -1.51
ZBED4-201ENST00000216268 DNAH7Q8WXX0 4024 aa5.57□□□□□ -1.52
ZBED4-201ENST00000216268 DNAH1Q9P2D7 4330 aa5.56□□□□□ -1.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms