RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617158.4

CSAG3-202, Transcript of CSAG family member 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CSAG3, Length 789 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG3-202ENST00000617158 OCIAD2Q56VL3 154 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG3-202ENST00000617158 ORMDL1Q9P0S3 153 aa12.38□□□□□ -0.43
CSAG3-202ENST00000617158 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP12.38□□□□□ -0.43
CSAG3-202ENST00000617158 C9JAW5 83 aa12.37□□□□□ -0.43
CSAG3-202ENST00000617158 MTURNQ8N3F0 131 aa12.36□□□□□ -0.43
CSAG3-202ENST00000617158 BAALC-AS2P0C853 105 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG3-202ENST00000617158 PRR26Q8N8Z3 221 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG3-202ENST00000617158 PPDPFLQ8WWR9 84 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG3-202ENST00000617158 PRO0461Q9UI25 63 aa12.35□□□□□ -0.43
CSAG3-202ENST00000617158 LINC01600Q96MT4 127 aa12.34□□□□□ -0.43
CSAG3-202ENST00000617158 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP12.33□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 CRYGAP11844 174 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 MYCBP2O75592 4640 aa12.3□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.29□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP10-8P60410 259 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa12.29□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 MT1HL1P0DM35 61 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 UBE2V1Q13404 147 aa12.28□□□□□ -0.44
CSAG3-202ENST00000617158 H3BQ85 93 aa12.27□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 H3BT86 120 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 MOBPQ13875 183 aa12.26□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa12.25□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 A0A0G2JQZ4 141 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 GHRHP01286 108 aa12.24□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.23□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 TNXBP22105 4242 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP12.22□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 OXTP01178 125 aa12.22□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 C9orf153Q5TBE3 101 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 TYMSOSQ8TAI1 123 aa12.21□□□□□ -0.45
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1B0GV72 72 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG3-202ENST00000617158 Q8NBF4 154 aa12.2□□□□□ -0.46
CSAG3-202ENST00000617158 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG3-202ENST00000617158 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa12.19□□□□□ -0.46
CSAG3-202ENST00000617158 PCLOQ9Y6V0 5065 aa12.17□□□□□ -0.46
CSAG3-202ENST00000617158 F8WEM9 126 aa12.17□□□□□ -0.46
CSAG3-202ENST00000617158 IGFL1Q6UW32 110 aa12.17□□□□□ -0.46
CSAG3-202ENST00000617158 F8W1H4 67 aa12.15□□□□□ -0.46
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa12.12□□□□□ -0.47
CSAG3-202ENST00000617158 RBM3P98179 157 aaKnown RBP12.11□□□□□ -0.47
CSAG3-202ENST00000617158 Q6JHZ5 121 aa12.11□□□□□ -0.47
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1W2PNM2 257 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG3-202ENST00000617158 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa12.09□□□□□ -0.47
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00304Q8N9R0 145 aa12.08□□□□□ -0.48
CSAG3-202ENST00000617158 C14orf132Q9NPU4 83 aa12.08□□□□□ -0.48
CSAG3-202ENST00000617158 ETDBQ3ZM63 59 aa12.06□□□□□ -0.48
CSAG3-202ENST00000617158 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa12.05□□□□□ -0.48
CSAG3-202ENST00000617158 HRCT1Q6UXD1 115 aa12.05□□□□□ -0.48
CSAG3-202ENST00000617158 TEN1Q86WV5 123 aa12.05□□□□□ -0.48
CSAG3-202ENST00000617158 Q6ZQT0 140 aa12.04□□□□□ -0.48
CSAG3-202ENST00000617158 DSCR8Q96T75 97 aa12.03□□□□□ -0.48
CSAG3-202ENST00000617158 CD164Q04900 197 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG3-202ENST00000617158 Q6Q795 121 aa12.02□□□□□ -0.49
CSAG3-202ENST00000617158 SPAG11AQ6PDA7 123 aa11.99□□□□□ -0.49
CSAG3-202ENST00000617158 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG3-202ENST00000617158 J3QL48 77 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG3-202ENST00000617158 CCKP06307 115 aa11.98□□□□□ -0.49
CSAG3-202ENST00000617158 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP11.98□□□□□ -0.49
CSAG3-202ENST00000617158 SPINK1P00995 79 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG3-202ENST00000617158 C4orf48Q5BLP8 95 aa11.96□□□□□ -0.49
CSAG3-202ENST00000617158 PDE6GP18545 87 aa11.94□□□□□ -0.5
CSAG3-202ENST00000617158 VPS25Q9BRG1 176 aa11.93□□□□□ -0.5
CSAG3-202ENST00000617158 RPS29P62273 56 aaKnown RBP11.92□□□□□ -0.5
CSAG3-202ENST00000617158 A0A087WSZ3 146 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG3-202ENST00000617158 Q5XG85 94 aa11.9□□□□□ -0.5
CSAG3-202ENST00000617158 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG3-202ENST00000617158 LIMD2Q9BT23 127 aa11.83□□□□□ -0.52
CSAG3-202ENST00000617158 C1orf195Q5TG92 126 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG3-202ENST00000617158 RETNLBQ9BQ08 111 aa11.82□□□□□ -0.52
CSAG3-202ENST00000617158 A0A1B0GW54 56 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG3-202ENST00000617158 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG3-202ENST00000617158 Q96NJ1 140 aa11.81□□□□□ -0.52
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00846Q9NV44 126 aa11.77□□□□□ -0.53
CSAG3-202ENST00000617158 LINC00472Q9H8W2 130 aa11.76□□□□□ -0.53
CSAG3-202ENST00000617158 SS18L2Q9UHA2 77 aa11.76□□□□□ -0.53
CSAG3-202ENST00000617158 HERC1Q15751 4861 aa11.75□□□□□ -0.53
CSAG3-202ENST00000617158 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.7□□□□□ -0.54
CSAG3-202ENST00000617158 Q6ZVQ6 151 aa11.69□□□□□ -0.54
CSAG3-202ENST00000617158 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa11.68□□□□□ -0.54
CSAG3-202ENST00000617158 NREPQ16612 68 aa11.67□□□□□ -0.54
CSAG3-202ENST00000617158 ACYP1P07311 99 aa11.64□□□□□ -0.55
CSAG3-202ENST00000617158 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
CSAG3-202ENST00000617158 PRR4Q16378 134 aa11.63□□□□□ -0.55
CSAG3-202ENST00000617158 IGKV4-1P06312 121 aa11.62□□□□□ -0.55
CSAG3-202ENST00000617158 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa11.61□□□□□ -0.55
CSAG3-202ENST00000617158 UBL5Q9BZL1 73 aa11.59□□□□□ -0.55
CSAG3-202ENST00000617158 DSCR10P59022 87 aa11.58□□□□□ -0.56
CSAG3-202ENST00000617158 HMCN2Q8NDA2 5059 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG3-202ENST00000617158 J3QR89 54 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG3-202ENST00000617158 SIGMAR1Q99720 223 aa11.57□□□□□ -0.56
CSAG3-202ENST00000617158 J3KT08 172 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG3-202ENST00000617158 CDIP1Q9H305 208 aa11.55□□□□□ -0.56
CSAG3-202ENST00000617158 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa11.54□□□□□ -0.56
CSAG3-202ENST00000617158 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG3-202ENST00000617158 BPY2O14599 106 aa11.53□□□□□ -0.56
CSAG3-202ENST00000617158 K7ERU9 68 aa11.52□□□□□ -0.57
CSAG3-202ENST00000617158 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa11.51□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.5 ms