RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614977.4

CPEB1-210, Transcript of cytoplasmic polyadenylation element binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene CPEB1, Length 1,559 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1-210ENST00000614977 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.59□□□□□ -1.35
CPEB1-210ENST00000614977 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.59□□□□□ -1.35
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CPEB1-210ENST00000614977 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa6.58□□□□□ -1.36
CPEB1-210ENST00000614977 MYCBP2O75592 4640 aa6.57□□□□□ -1.36
CPEB1-210ENST00000614977 B5MCH6 92 aa6.57□□□□□ -1.36
CPEB1-210ENST00000614977 H0Y9J4 135 aa6.56□□□□□ -1.36
CPEB1-210ENST00000614977 Q6ZQY7 126 aa6.56□□□□□ -1.36
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CPEB1-210ENST00000614977 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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CPEB1-210ENST00000614977 ERC2-IT1O76042 136 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB1-210ENST00000614977 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.5□□□□□ -1.37
CPEB1-210ENST00000614977 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.49□□□□□ -1.37
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CPEB1-210ENST00000614977 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.48□□□□□ -1.37
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CPEB1-210ENST00000614977 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
CPEB1-210ENST00000614977 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa6.45□□□□□ -1.38
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CPEB1-210ENST00000614977 IMUPQ9GZP8 106 aa6.4□□□□□ -1.38
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CPEB1-210ENST00000614977 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.37□□□□□ -1.39
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CPEB1-210ENST00000614977 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.35□□□□□ -1.39
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CPEB1-210ENST00000614977 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.33□□□□□ -1.4
CPEB1-210ENST00000614977 Q8NBF4 154 aa6.32□□□□□ -1.4
CPEB1-210ENST00000614977 NREPQ16612 68 aa6.31□□□□□ -1.4
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CPEB1-210ENST00000614977 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.31□□□□□ -1.4
CPEB1-210ENST00000614977 LINC00304Q8N9R0 145 aa6.31□□□□□ -1.4
CPEB1-210ENST00000614977 Q6ZVQ6 151 aa6.3□□□□□ -1.4
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CPEB1-210ENST00000614977 HMCN2Q8NDA2 5059 aa6.26□□□□□ -1.41
CPEB1-210ENST00000614977 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
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CPEB1-210ENST00000614977 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.22□□□□□ -1.41
CPEB1-210ENST00000614977 ATOX1O00244 68 aa6.22□□□□□ -1.41
CPEB1-210ENST00000614977 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.21□□□□□ -1.42
CPEB1-210ENST00000614977 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
CPEB1-210ENST00000614977 CD164Q04900 197 aa6.2□□□□□ -1.42
CPEB1-210ENST00000614977 A0A087WSZ3 146 aa6.18□□□□□ -1.42
CPEB1-210ENST00000614977 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.18□□□□□ -1.42
CPEB1-210ENST00000614977 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.18□□□□□ -1.42
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