RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597297.1

PDE4C-210, Transcript of phosphodiesterase 4C, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4C, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4C-210ENST00000597297 PDE6GP18545 87 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 UBE2AP49459 152 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 HAMPP81172 84 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.29□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa7.28□□□□□ -1.24
PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 LINC00846Q9NV44 126 aa7.26□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 Q6ZSA8 131 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 LINC00643Q86TS7 51 aa7.25□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 SMIM29Q86T20 159 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 Q8N1X5 172 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa7.24□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 FAT1Q14517 4588 aa7.23□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 SPRR1BP22528 89 aa7.21□□□□□ -1.25
PDE4C-210ENST00000597297 F8WEM9 126 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 SCGB1A1P11684 91 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 C1orf137Q5JT78 98 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 SCXQ7RTU7 201 aa7.2□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 Q6JHZ5 121 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 Q6Q795 121 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 UBL5Q9BZL1 73 aa7.19□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 ZNF861PO60384 105 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 A0A1W2PNM2 257 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 Q5VSD8 79 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 Q6ZVQ6 151 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 SPRR4Q96PI1 79 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 IMUPQ9GZP8 106 aa7.16□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.15□□□□□ -1.26
PDE4C-210ENST00000597297 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 IGLV7-43P04211 117 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 Q8NBF4 154 aa7.15□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 ABCA13Q86UQ4 5058 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 A0A1B0GW54 56 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 FAM229AH3BQW9 127 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 PCP4P48539 62 aa7.14□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 LINC00483Q53H64 154 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 IGFL1Q6UW32 110 aa7.13□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 PCLOQ9Y6V0 5065 aa7.11□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 A0A0G2JQZ4 141 aa7.1□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 CRYGAP11844 174 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 NREPQ16612 68 aa7.09□□□□□ -1.27
PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
PDE4C-210ENST00000597297 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
PDE4C-210ENST00000597297 CXCL6P80162 114 aa7.08□□□□□ -1.28
PDE4C-210ENST00000597297 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.07□□□□□ -1.28
PDE4C-210ENST00000597297 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4C-210ENST00000597297 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.06□□□□□ -1.28
PDE4C-210ENST00000597297 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PDE4C-210ENST00000597297 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.06□□□□□ -1.28
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PDE4C-210ENST00000597297 A0A087WSZ3 146 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE4C-210ENST00000597297 BPY2O14599 106 aa7.03□□□□□ -1.28
PDE4C-210ENST00000597297 MOBPQ13875 183 aa7.02□□□□□ -1.29
PDE4C-210ENST00000597297 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.01□□□□□ -1.29
PDE4C-210ENST00000597297 MYCBP2O75592 4640 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4C-210ENST00000597297 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.99□□□□□ -1.29
PDE4C-210ENST00000597297 ATOX1O00244 68 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4C-210ENST00000597297 IGKV4-1P06312 121 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4C-210ENST00000597297 Q8N9L7 120 aa6.97□□□□□ -1.29
PDE4C-210ENST00000597297 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.96□□□□□ -1.29
PDE4C-210ENST00000597297 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.96□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 DSCR10P59022 87 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.95□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.94□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 A0A087X002 238 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.93□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.93□□□□□ -1.3
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PDE4C-210ENST00000597297 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PDE4C-210ENST00000597297 K7EQZ3 153 aa6.91□□□□□ -1.3
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PDE4C-210ENST00000597297 J3KT08 172 aa6.89□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 Q96NJ1 140 aa6.88□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 J3QL48 77 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 OXTP01178 125 aa6.87□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 A8MWP4 228 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 CCDC179H3BU77 68 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 COX7CP15954 63 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 SERP2Q8N6R1 65 aa6.86□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 UQCRQO14949 82 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 HERC1Q15751 4861 aa6.85□□□□□ -1.31
PDE4C-210ENST00000597297 HCG22E2RYF7 251 aa6.84□□□□□ -1.31
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