RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000597259.1

HERC3-212, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 2

Gene HERC3, Length 313 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-212ENST00000597259 HIST2H2BEQ16778 126 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BHQ93079 126 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BNQ99877 126 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BMQ99879 126 aa2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa2.91□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 LINC00587B1AMM8 73 aa2.91□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 SYS1-DBNDD2H3BUS1 97 aa2.91□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 LINC01545Q5VT33 79 aa2.91□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 LINC00308Q8TCZ7 52 aa2.91□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 MAP1LC3CQ9BXW4 147 aa2.91□□□□□ -1.94
HERC3-212ENST00000597259 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP2.9□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 ATP6V1G1O75348 118 aa2.9□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 HSPB8Q9UJY1 196 aa2.9□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 A0A0U1RQV1 116 aa2.89□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 TIMM17BO60830 172 aa2.89□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 C3orf79P0CE67 100 aa2.89□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 LGALS3P17931 250 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP2.89□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 SPANXCQ9NY87 97 aa2.89□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 A0A0G2JQZ4 141 aa2.88□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP2.88□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 HERVK_113P61574 105 aa2.88□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 S100A7L2Q5SY68 101 aa2.88□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 SLC25A20O43772 301 aa2.87□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 MT1HP80294 61 aa2.87□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 PET117Q6UWS5 81 aa2.87□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa2.86□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 ZNF815PA8K554 130 aa2.86□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 C6orf99Q4VX62 202 aa2.86□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 PCP2Q8IVA1 136 aa2.86□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 MIEN1Q9BRT3 115 aa2.86□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 SPANXDQ9BXN6 97 aa2.86□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 A8MU10 97 aa2.85□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 JOSD1Q15040 202 aaPredicted RBP2.85□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.85□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 COX7BP24311 80 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 S100A12P80511 92 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 Q1RN00 199 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 PCOTHQ58A44 107 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 C1orf195Q5TG92 126 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 Q5XG85 94 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 HRCT1Q6UXD1 115 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 MUSTN1Q8IVN3 82 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 ATOH7Q8N100 152 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 OR13C6PQ8NH95 151 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa2.84□□□□□ -1.95
HERC3-212ENST00000597259 C9orf92A6NGG3 77 aa2.83□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 H7C2G1 150 aa2.83□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 KRTDAPP60985 99 aa2.83□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 CD164Q04900 197 aa2.83□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa2.82□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 LINC00518Q8N0U6 118 aa2.82□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 DEFB105AQ8NG35 78 aa2.82□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 SMIM11BQ8TCY0 68 aa2.82□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa2.81□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 A0A1B0GWB2 263 aa2.81□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 IFITM1P13164 125 aa2.81□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 HIST3H2BBQ8N257 126 aa2.81□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 PRO1933Q9H354 126 aa2.81□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa2.81□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 HINT1P49773 126 aaPredicted RBP2.8□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 RPL37P61927 97 aaKnown RBP2.8□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 TAL2Q16559 108 aa2.8□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 LCE1CQ5T751 118 aa2.8□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 LCE1BQ5T7P3 118 aa2.8□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZVH6 145 aa2.8□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 HIST1H2BLQ99880 126 aa2.8□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 LIMD2Q9BT23 127 aa2.8□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.8□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 CBY1Q9Y3M2 126 aa2.8□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 USH2AO75445 5202 aa2.79□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 A6NDN8 102 aa2.79□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 LINC00575Q6W349 94 aa2.79□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 SCGB1D4Q6XE38 83 aa2.79□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 SSPOA2VEC9 5147 aa2.78□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 A4D1N5 150 aa2.78□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 AKR1D1P51857 326 aa2.78□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 SLC25A34Q6PIV7 304 aa2.78□□□□□ -1.96
HERC3-212ENST00000597259 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa2.77□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 IGFL1Q6UW32 110 aa2.77□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 Q6ZQY7 126 aa2.77□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 C20orf202A1L168 122 aa2.76□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa2.75□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 hADV29S1A0JD25 119 aa2.75□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 C12orf57Q99622 126 aa2.75□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 COX8AP10176 69 aa2.74□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 OCIAD2Q56VL3 154 aa2.74□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 C2orf91Q6ZV80 131 aa2.74□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 COPS9Q8WXC6 57 aa2.74□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 CLEC2BQ92478 149 aa2.74□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 Q96NJ1 140 aa2.74□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP2.74□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 H3BUT2 72 aa2.73□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 DLEU1O43261 78 aa2.73□□□□□ -1.97
HERC3-212ENST00000597259 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 60 ms