RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590301.1

NPC1-208, Transcript of NPC intracellular cholesterol transporter 1, human

TSL 2

Gene NPC1, Length 410 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NPC1-208	ENST00000590301	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	FAT4	Q6V0I7	4981 aa		4.25	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	IFITM1	P13164	125 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	KRTDAP	P60985	99 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	SCGB1D4	Q6XE38	83 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	ST20-AS1	Q8NBB2	130 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	LAMTOR3	Q9UHA4	124 aa		4.24	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	C6orf99	Q4VX62	202 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP4-11	Q9BYQ6	195 aa		4.23	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	CD164	Q04900	197 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	ATOH7	Q8N100	152 aa		4.22	□□□□□ -1.73
NPC1-208	ENST00000590301	TEX49	A0A1B0GTD5	131 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1B0GWB2	263 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	HSBP1L1	C9JCN9	74 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	LINC01547	P58512	204 aa	Predicted RBP	4.21	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	TAL2	Q16559	108 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	PCP2	Q8IVA1	136 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	MTURN	Q8N3F0	131 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	PRO1933	Q9H354	126 aa		4.21	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301		Q5XG85	94 aa		4.2	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	NHP2	Q9NX24	153 aa	Known RBP	4.2	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	TRAV13-2	A0A0B4J235	113 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301		A6NDN8	102 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301		H7C2G1	150 aa		4.19	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301		Q1RN00	199 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		4.18	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		4.17	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	VAMP3	Q15836	100 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	SMIM29	Q86T20	159 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP4-1	Q9BYQ7	146 aa		4.16	□□□□□ -1.74
NPC1-208	ENST00000590301	S100A2	P29034	98 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	SMIM11B	Q8TCY0	68 aa		4.15	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301		F8WEM9	126 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	TCL1B	O95988	128 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	S100A6	P06703	90 aa		4.14	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.13	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	PCOTH	Q58A44	107 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301		Q6JHZ5	121 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	LINC00575	Q6W349	94 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.12	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	hADV29S1	A0JD25	119 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	DLEU1	O43261	78 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	COX8A	P10176	69 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	PPDPFL	Q8WWR9	84 aa		4.11	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	BVES-AS1	Q5T3Y7	98 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	UNQ6493/PRO21345	Q6UXR8	122 aa	Predicted RBP	4.1	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301		Q6ZQY7	126 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	CLEC2B	Q92478	149 aa		4.1	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	CFC1B	P0CG36	223 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.09	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301	C2orf91	Q6ZV80	131 aa		4.09	□□□□□ -1.75
NPC1-208	ENST00000590301		A0A0G2JQZ4	141 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	SNCG	O76070	127 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	OCIAD2	Q56VL3	154 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	C14orf144	Q96I85	54 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	FAM218A	Q96MZ4	157 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	HIST1H4G	Q99525	98 aa		4.08	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP19-2	Q3LHN2	52 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	PYY3	Q5JQD4	70 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	HIGD1B	Q9P298	99 aa		4.07	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	SPATA45	Q537H7	98 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	IGFL1	Q6UW32	110 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	SNHG12	Q9BXW3	62 aa		4.06	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	CFC1	P0CG37	223 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	MT1H	P80294	61 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	C12orf57	Q99622	126 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.05	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301		H0YGX0	51 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	VAMP8	Q9BV40	100 aa		4.04	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301		A0A0B4J2C4	111 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	LST1	O00453	97 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP5-3	Q6L8H2	238 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301		Q6Q795	121 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301	RAB37	Q96AX2	223 aa		4.03	□□□□□ -1.76
NPC1-208	ENST00000590301		A0A1B0GX51	115 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	COX6B2	Q6YFQ2	88 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	PRAC1	Q96KF2	57 aa		4.02	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301		H3BUT2	72 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	FXYD2	P54710	66 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	TEN1	Q86WV5	123 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	CEND1	Q8N111	149 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	OBSCN-AS1	Q96MR7	158 aa		4.01	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301		M0R2T5	61 aa		4	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	NDUFV3	P56181	108 aa	Known RBP	4	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	FSIP2	Q5CZC0	6907 aa		3.99	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301		H3BQ85	93 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.98	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	KRTAP9-8	Q9BYQ0	159 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.98	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301		H3BMG7	143 aa		3.97	□□□□□ -1.77
NPC1-208	ENST00000590301	FABP2	P12104	132 aa		3.97	□□□□□ -1.77

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