RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.18□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 PRYO14603 147 aa8.18□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.18□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa8.16□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 SIGMAR1Q99720 223 aa8.16□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.15□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 PRR4Q16378 134 aa8.15□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 MRPL55Q7Z7F7 128 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 C22orf24Q9Y442 160 aa8.15□□□□□ -1.1
SPNS3-202ENST00000572078 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.13□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.13□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.12□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.12□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZQY7 126 aa8.11□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 MUC17Q685J3 4493 aa8.1□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.1□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.09□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 GAGE2AQ6NT46 116 aa8.09□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 CDIP1Q9H305 208 aa8.09□□□□□ -1.11
SPNS3-202ENST00000572078 PDE6GP18545 87 aa8.08□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 SPRR1AP35321 89 aa8.08□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 UBE2BP63146 152 aa8.08□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 RBM3P98179 157 aaKnown RBP8.08□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZRX8 168 aa8.07□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.07□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 B5MCH6 92 aa8.06□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 A0A087X002 238 aa8.05□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 CCKP06307 115 aa8.05□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 SCGB1A1P11684 91 aa8.05□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 DSCR8Q96T75 97 aa8.05□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF861PO60384 105 aa8.04□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
SPNS3-202ENST00000572078 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.02□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 A0A0U1RQV1 116 aa8.02□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP8.02□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00643Q86TS7 51 aa8.02□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.01□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1B0GV72 72 aa7.99□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 MT-ATP8P03928 68 aa7.99□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa7.99□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 RETNLBQ9BQ08 111 aa7.98□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.98□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.97□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 Q6Q795 121 aa7.97□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZQT0 140 aa7.97□□□□□ -1.13
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SPNS3-202ENST00000572078 Q9BRP9 147 aa7.97□□□□□ -1.13
SPNS3-202ENST00000572078 IMUPQ9GZP8 106 aa7.96□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa7.95□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.95□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 PCP4P48539 62 aa7.95□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 Q8N377 158 aa7.95□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 UBL5Q9BZL1 73 aa7.95□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 F8WEM9 126 aa7.94□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 UBE2AP49459 152 aa7.94□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.94□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 BCE1O60756 84 aa7.93□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 CRYGAP11844 174 aa7.93□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 SMCR5Q8TEV8 140 aa7.93□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.92□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1B0GW54 56 aa7.92□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.92□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 Q6JHZ5 121 aa7.92□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.92□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00846Q9NV44 126 aa7.92□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP7.91□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 HIGD2AQ9BW72 106 aa7.91□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 PRLHP81277 87 aa7.9□□□□□ -1.14
SPNS3-202ENST00000572078 ERC2-IT1O76042 136 aa7.89□□□□□ -1.15
SPNS3-202ENST00000572078 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa7.89□□□□□ -1.15
SPNS3-202ENST00000572078 TPRXLQ17RH7 258 aa7.87□□□□□ -1.15
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.86□□□□□ -1.15
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
SPNS3-202ENST00000572078 SPRR1BP22528 89 aa7.85□□□□□ -1.15
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa7.84□□□□□ -1.15
SPNS3-202ENST00000572078 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.84□□□□□ -1.15
SPNS3-202ENST00000572078 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.82□□□□□ -1.16
SPNS3-202ENST00000572078 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.82□□□□□ -1.16
SPNS3-202ENST00000572078 SMIM29Q86T20 159 aa7.82□□□□□ -1.16
SPNS3-202ENST00000572078 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.82□□□□□ -1.16
SPNS3-202ENST00000572078 NREPQ16612 68 aa7.81□□□□□ -1.16
SPNS3-202ENST00000572078 Q6ZVQ6 151 aa7.81□□□□□ -1.16
SPNS3-202ENST00000572078 CXCL6P80162 114 aa7.8□□□□□ -1.16
SPNS3-202ENST00000572078 Q8NBF4 154 aa7.8□□□□□ -1.16
SPNS3-202ENST00000572078 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.79□□□□□ -1.16
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.79□□□□□ -1.16
SPNS3-202ENST00000572078 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.77□□□□□ -1.17
SPNS3-202ENST00000572078 SPRR4Q96PI1 79 aa7.77□□□□□ -1.17
SPNS3-202ENST00000572078 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.76□□□□□ -1.17
SPNS3-202ENST00000572078 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.76□□□□□ -1.17
SPNS3-202ENST00000572078 A0A1W2PNM2 257 aa7.76□□□□□ -1.17
SPNS3-202ENST00000572078 IGFL1Q6UW32 110 aa7.75□□□□□ -1.17
SPNS3-202ENST00000572078 ATOX1O00244 68 aa7.73□□□□□ -1.17
SPNS3-202ENST00000572078 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.73□□□□□ -1.17
SPNS3-202ENST00000572078 LINC00483Q53H64 154 aa7.73□□□□□ -1.17
SPNS3-202ENST00000572078 BPY2O14599 106 aa7.72□□□□□ -1.17
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