RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567987.5

INO80E-211, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene INO80E, Length 1,926 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-211ENST00000567987 LINC00846Q9NV44 126 aa11.58□□□□□ -0.55
INO80E-211ENST00000567987 LRP1BQ9NZR2 4599 aa11.58□□□□□ -0.56
INO80E-211ENST00000567987 SCGB1A1P11684 91 aa11.57□□□□□ -0.56
INO80E-211ENST00000567987 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
INO80E-211ENST00000567987 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
INO80E-211ENST00000567987 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa11.55□□□□□ -0.56
INO80E-211ENST00000567987 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa11.54□□□□□ -0.56
INO80E-211ENST00000567987 PDE6GP18545 87 aa11.54□□□□□ -0.56
INO80E-211ENST00000567987 LINC00643Q86TS7 51 aa11.53□□□□□ -0.56
INO80E-211ENST00000567987 ZNF861PO60384 105 aa11.5□□□□□ -0.57
INO80E-211ENST00000567987 IGLV7-43P04211 117 aa11.49□□□□□ -0.57
INO80E-211ENST00000567987 F8WEM9 126 aa11.47□□□□□ -0.57
INO80E-211ENST00000567987 UBL5Q9BZL1 73 aa11.47□□□□□ -0.57
INO80E-211ENST00000567987 SMIM29Q86T20 159 aa11.45□□□□□ -0.58
INO80E-211ENST00000567987 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa11.45□□□□□ -0.58
INO80E-211ENST00000567987 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa11.43□□□□□ -0.58
INO80E-211ENST00000567987 SPRR1BP22528 89 aa11.42□□□□□ -0.58
INO80E-211ENST00000567987 Q6JHZ5 121 aa11.42□□□□□ -0.58
INO80E-211ENST00000567987 APOBP04114 4563 aaKnown RBP11.41□□□□□ -0.58
INO80E-211ENST00000567987 SPRR4Q96PI1 79 aa11.41□□□□□ -0.58
INO80E-211ENST00000567987 Q6Q795 121 aa11.41□□□□□ -0.58
INO80E-211ENST00000567987 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa11.4□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP11.39□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 Q6ZVQ6 151 aa11.39□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 A0A0G2JQZ4 141 aa11.37□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 IMUPQ9GZP8 106 aa11.37□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 A0A1W2PNM2 257 aa11.36□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 LINC00483Q53H64 154 aa11.35□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 IGFL1Q6UW32 110 aa11.34□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 ANAPC11Q9NYG5 84 aa11.34□□□□□ -0.59
INO80E-211ENST00000567987 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa11.33□□□□□ -0.6
INO80E-211ENST00000567987 Q8NBF4 154 aa11.33□□□□□ -0.6
INO80E-211ENST00000567987 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP11.33□□□□□ -0.6
INO80E-211ENST00000567987 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa11.31□□□□□ -0.6
INO80E-211ENST00000567987 NREPQ16612 68 aa11.31□□□□□ -0.6
INO80E-211ENST00000567987 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa11.3□□□□□ -0.6
INO80E-211ENST00000567987 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa11.3□□□□□ -0.6
INO80E-211ENST00000567987 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP11.29□□□□□ -0.6
INO80E-211ENST00000567987 A0A087WVE0 104 aa11.29□□□□□ -0.6
INO80E-211ENST00000567987 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa11.29□□□□□ -0.6
INO80E-211ENST00000567987 FAT1Q14517 4588 aa11.26□□□□□ -0.61
INO80E-211ENST00000567987 C9orf153Q5TBE3 101 aa11.26□□□□□ -0.61
INO80E-211ENST00000567987 ANAPC13Q9BS18 74 aa11.26□□□□□ -0.61
INO80E-211ENST00000567987 A0A1B0GW54 56 aa11.25□□□□□ -0.61
INO80E-211ENST00000567987 CRYGAP11844 174 aa11.24□□□□□ -0.61
INO80E-211ENST00000567987 CXCL6P80162 114 aa11.23□□□□□ -0.61
INO80E-211ENST00000567987 CDK2AP2O75956 126 aa11.23□□□□□ -0.61
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP11.23□□□□□ -0.61
INO80E-211ENST00000567987 MOBPQ13875 183 aa11.21□□□□□ -0.61
INO80E-211ENST00000567987 SPINK6Q6UWN8 80 aa11.21□□□□□ -0.61
INO80E-211ENST00000567987 A0A087WSZ3 146 aa11.2□□□□□ -0.62
INO80E-211ENST00000567987 BPY2O14599 106 aa11.19□□□□□ -0.62
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa11.19□□□□□ -0.62
INO80E-211ENST00000567987 HSPG2P98160 4391 aa11.17□□□□□ -0.62
INO80E-211ENST00000567987 A0A087X002 238 aa11.17□□□□□ -0.62
INO80E-211ENST00000567987 Q8N9L7 120 aa11.17□□□□□ -0.62
INO80E-211ENST00000567987 FAM229AH3BQW9 127 aa11.15□□□□□ -0.62
INO80E-211ENST00000567987 FAM229BQ4G0N7 80 aa11.15□□□□□ -0.62
INO80E-211ENST00000567987 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
INO80E-211ENST00000567987 HRCT1Q6UXD1 115 aa11.13□□□□□ -0.63
INO80E-211ENST00000567987 RYR1P21817 5038 aa11.13□□□□□ -0.63
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa11.13□□□□□ -0.63
INO80E-211ENST00000567987 DEFB116Q30KQ4 102 aa11.11□□□□□ -0.63
INO80E-211ENST00000567987 ATOX1O00244 68 aa11.1□□□□□ -0.63
INO80E-211ENST00000567987 Q5VSD8 79 aa11.1□□□□□ -0.63
INO80E-211ENST00000567987 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa11.09□□□□□ -0.63
INO80E-211ENST00000567987 IGKV4-1P06312 121 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-211ENST00000567987 KIAA1109Q2LD37 5005 aa11.08□□□□□ -0.64
INO80E-211ENST00000567987 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa11.07□□□□□ -0.64
INO80E-211ENST00000567987 DSCR10P59022 87 aa11.04□□□□□ -0.64
INO80E-211ENST00000567987 CCDC179H3BU77 68 aa11.02□□□□□ -0.65
INO80E-211ENST00000567987 K7EQZ3 153 aa11.02□□□□□ -0.65
INO80E-211ENST00000567987 PRR26Q8N8Z3 221 aa11.02□□□□□ -0.65
INO80E-211ENST00000567987 TYMSOSQ8TAI1 123 aa11.01□□□□□ -0.65
INO80E-211ENST00000567987 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa10.99□□□□□ -0.65
INO80E-211ENST00000567987 CD164Q04900 197 aa10.98□□□□□ -0.65
INO80E-211ENST00000567987 Q8N1X5 172 aa10.98□□□□□ -0.65
INO80E-211ENST00000567987 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.97□□□□□ -0.65
INO80E-211ENST00000567987 SS18L2Q9UHA2 77 aa10.97□□□□□ -0.65
INO80E-211ENST00000567987 SERP2Q8N6R1 65 aa10.96□□□□□ -0.66
INO80E-211ENST00000567987 COX7CP15954 63 aa10.95□□□□□ -0.66
INO80E-211ENST00000567987 UQCRQO14949 82 aa10.93□□□□□ -0.66
INO80E-211ENST00000567987 BIRC6Q9NR09 4857 aa10.9□□□□□ -0.66
INO80E-211ENST00000567987 Q96NJ1 140 aa10.9□□□□□ -0.66
INO80E-211ENST00000567987 A8MWP4 228 aa10.9□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 J3KT08 172 aa10.89□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 C4orf48Q5BLP8 95 aa10.89□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 HCG22E2RYF7 251 aa10.88□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 SMIM20Q8N5G0 67 aa10.88□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 TRAV7A0A075B6U4 112 aa10.87□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 PRR15Q8IV56 129 aa10.87□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 LINC00304Q8N9R0 145 aa10.87□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 WFDC13Q8IUB5 93 aa10.86□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 SVIPQ8NHG7 77 aa10.86□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 NDUFB1O75438 58 aa10.85□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 SPINK1P00995 79 aa10.84□□□□□ -0.67
INO80E-211ENST00000567987 Q5XG85 94 aa10.82□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms