RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 BAALC-AS2P0C853 105 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-209ENST00000561136 HAMPP81172 84 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-209ENST00000561136 Q6ZR54 194 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM254Q8TBM7 123 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-209ENST00000561136 SNURFQ9Y675 71 aa3.53□□□□□ -1.84
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 GIG44P09565 113 aaPredicted RBP3.52□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1D-37A0A075B6S9 117 aa3.51□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa3.51□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV10A0A0B4J240 114 aa3.51□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 A8MU10 97 aa3.51□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 DNAL4O96015 105 aa3.51□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 LINC01547P58512 204 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.51□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 NDUFA4L2Q9NRX3 87 aa3.51□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa3.51□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 A0A087WVE0 104 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 A8MUU9 505 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 PLNP26678 52 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP10-12P60413 245 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 FAM74A4Q5TZK3 123 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 USMG5Q96IX5 58 aa3.5□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 HIGD1CA8MV81 97 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 IGKV3-20P01619 116 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 SMIM29Q86T20 159 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 PRR15LQ9BU68 103 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 ORMDL1Q9P0S3 153 aa3.49□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB1P60022 68 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 Q1RN00 199 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 Q5VSD8 79 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 LENEPQ9Y5L5 61 aa3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 K7EMI3 77 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 HTN3P15516 51 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 DEFB131AP59861 70 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 Q8TAT8 98 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGAP5-AS1Q96IT6 56 aa3.47□□□□□ -1.85
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1B0GUT8 65 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R17O96001 155 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-53P01767 116 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-30P01768 117 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 CSAG1Q6PB30 78 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 Q86TA4 180 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 C16orf74Q96GX8 76 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 RNF5Q99942 180 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 GFRA4Q9GZZ7 299 aa3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 RNF213Q63HN8 5207 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV6-6A0A0A6YYG2 114 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 A0A0J9YY99 117 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 H3BQ85 93 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 SPINK4O60575 86 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 P0C880 135 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 WT1-ASQ06250 92 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 SPAG11BQ08648 103 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 SPAG11AQ6PDA7 123 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 AMELXQ99217 191 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 Q9BRP9 147 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.45□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 LINC01546A6NGU7 62 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 PANO1I0J062 215 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 K7EIM0 57 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 NDUFB1O75438 58 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00483Q53H64 154 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 Q8N377 158 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 TMEM167AQ8TBQ9 72 aa3.44□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 A0A1W2PNM2 257 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 P0C879 139 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 KRTAP10-1P60331 282 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 NREPQ16612 68 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 KLK9Q2XQG4 91 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 C1orf137Q5JT78 98 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 DMAC1Q96GE9 116 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00167Q96N53 147 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 UBL5Q9BZL1 73 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 LINC00846Q9NV44 126 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 KLK9Q9UKQ9 250 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.43□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 A0A096LNJ9 63 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 NDUFA4O00483 81 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 CTSGP08311 255 aa3.42□□□□□ -1.86
TMOD3-209ENST00000561136 SPINK9Q5DT21 86 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 40 ms