RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552253.1

PTPRB-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRB, Length 2,373 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-211ENST00000552253 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa3.71□□□□□ -1.82
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PTPRB-211ENST00000552253 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP3.71□□□□□ -1.82
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PTPRB-211ENST00000552253 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRB-211ENST00000552253 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa3.71□□□□□ -1.82
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PTPRB-211ENST00000552253 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRB-211ENST00000552253 Q6ZR54 194 aa3.54□□□□□ -1.84
PTPRB-211ENST00000552253 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRB-211ENST00000552253 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRB-211ENST00000552253 ANAPC11Q9NYG5 84 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRB-211ENST00000552253 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.53□□□□□ -1.84
PTPRB-211ENST00000552253 PRKDCP78527 4128 aaKnown RBP3.52□□□□□ -1.85
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