RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000549107.5

PTPRR-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRR, Length 862 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-208ENST00000549107 GAGE2AQ6NT46 116 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 CDIP1Q9H305 208 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 SCXQ7RTU7 201 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 ACYP1P07311 99 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 A0A1B0GVY2 172 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 CCKP06307 115 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 C1orf137Q5JT78 98 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 Q6ZQT0 140 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 DSCR8Q96T75 97 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRR-208ENST00000549107 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 C3orf22Q8N5N4 141 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 PDE6GP18545 87 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 HAMPP81172 84 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 SMIM29Q86T20 159 aa6.88□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 SPRR1BP22528 89 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 ZNF861PO60384 105 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 IGLV7-43P04211 117 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 XGP55808 180 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 F8WEM9 126 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00846Q9NV44 126 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRR-208ENST00000549107 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 SPRR4Q96PI1 79 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 SIGMAR1Q99720 223 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 HERC2O95714 4834 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 MT-ATP8P03928 68 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 PKHD1P08F94 4074 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 LRP1BQ9NZR2 4599 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00483Q53H64 154 aa6.81□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00643Q86TS7 51 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 RYR1P21817 5038 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 A0A1W2PNM2 257 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 IGFL1Q6UW32 110 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 Q8NBF4 154 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRR-208ENST00000549107 UBL5Q9BZL1 73 aa6.77□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 A0A0G2JQZ4 141 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 Q6JHZ5 121 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 Q6ZVQ6 151 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 A0A1B0GW54 56 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 ANAPC11Q9NYG5 84 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 LCE3BQ5TA77 95 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 C9orf153Q5TBE3 101 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 CRYGAP11844 174 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRR-208ENST00000549107 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 MOBPQ13875 183 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 NREPQ16612 68 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 Q6Q795 121 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 SCGB1A1P11684 91 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 IMUPQ9GZP8 106 aa6.69□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 A0A087WSZ3 146 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 CXCL6P80162 114 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 FAM229BQ4G0N7 80 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 SPINK6Q6UWN8 80 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa6.66□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRR-208ENST00000549107 A0A087X002 238 aa6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 BPY2O14599 106 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 A0A087WVE0 104 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 CDK2AP2O75956 126 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 FAT1Q14517 4588 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 CD164Q04900 197 aa6.59□□□□□ -1.35
PTPRR-208ENST00000549107 IGKV4-1P06312 121 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 PCP4P48539 62 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 Q8N9L7 120 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 FAM229AH3BQW9 127 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 DSCR10P59022 87 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 DEFB116Q30KQ4 102 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 HSPG2P98160 4391 aa6.57□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 TYMSOSQ8TAI1 123 aa6.55□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 K7EQZ3 153 aa6.54□□□□□ -1.36
PTPRR-208ENST00000549107 Q5VSD8 79 aa6.54□□□□□ -1.36
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