RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524555.3

SAA2-SAA4-201, Transcript of SAA2-SAA4 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene SAA2-SAA4, Length 743 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HSPG2P98160 4391 aa7.57□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPRR1BP22528 89 aa7.56□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DSCR8Q96T75 97 aa7.56□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.55□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.54□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 F8WEM9 126 aa7.54□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 XGP55808 180 aa7.54□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.54□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FAM240AA0A1B0GVK7 77 aa7.53□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ACYP1P07311 99 aa7.53□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 GAGE2AQ6NT46 116 aa7.53□□□□□ -1.2
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 Q5VSD8 79 aa7.52□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPRR4Q96PI1 79 aa7.52□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.51□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CCKP06307 115 aa7.51□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LINC00483Q53H64 154 aa7.51□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SMIM29Q86T20 159 aa7.51□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 A0A1B0GV72 72 aa7.5□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 Q6ZQT0 140 aa7.5□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.49□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FAM229AH3BQW9 127 aa7.49□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.49□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 C3orf22Q8N5N4 141 aa7.49□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 J3QL48 77 aa7.48□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 Q6JHZ5 121 aa7.48□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 A0A1B0GW54 56 aa7.47□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.47□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.45□□□□□ -1.22
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HERC1Q15751 4861 aa7.44□□□□□ -1.22
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.42□□□□□ -1.22
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 VPS25Q9BRG1 176 aa7.42□□□□□ -1.22
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 C9orf153Q5TBE3 101 aa7.41□□□□□ -1.22
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IGFL1Q6UW32 110 aa7.41□□□□□ -1.22
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 Q8NBF4 154 aa7.41□□□□□ -1.22
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.39□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 Q6Q795 121 aa7.39□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 UBL5Q9BZL1 73 aa7.39□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CDIP1Q9H305 208 aa7.39□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 A0A1W2PNM2 257 aa7.38□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CRYGAP11844 174 aa7.38□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.38□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LINC00846Q9NV44 126 aa7.38□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MOBPQ13875 183 aa7.36□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LINC00643Q86TS7 51 aa7.36□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.36□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.34□□□□□ -1.23
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.33□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SIGMAR1Q99720 223 aa7.33□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CD164Q04900 197 aa7.32□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NREPQ16612 68 aa7.32□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.32□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 Q6ZVQ6 151 aa7.31□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 A0A087X002 238 aa7.3□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 A0A0G2JQZ4 141 aa7.3□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.3□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 FAT1Q14517 4588 aa7.3□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 A0A087WSZ3 146 aa7.29□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.28□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.28□□□□□ -1.24
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 CXCL6P80162 114 aa7.27□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IMUPQ9GZP8 106 aa7.27□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 OXTP01178 125 aa7.26□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MT-ATP8P03928 68 aa7.26□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 MYCBP2O75592 4640 aa7.25□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.25□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 BPY2O14599 106 aa7.24□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa7.24□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.23□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.23□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.22□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 Q5XG85 94 aa7.22□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.22□□□□□ -1.25
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 J3KT08 172 aa7.21□□□□□ -1.26
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SPINK1P00995 79 aa7.21□□□□□ -1.26
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LIMD2Q9BT23 127 aa7.21□□□□□ -1.26
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.2□□□□□ -1.26
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.19□□□□□ -1.26
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.19□□□□□ -1.26
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 SCGB1A1P11684 91 aa7.17□□□□□ -1.26
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 NDUFB1O75438 58 aa7.14□□□□□ -1.27
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 Q96NJ1 140 aa7.14□□□□□ -1.27
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 A8MWP4 228 aa7.13□□□□□ -1.27
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 IGKV4-1P06312 121 aa7.13□□□□□ -1.27
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DSCR10P59022 87 aa7.13□□□□□ -1.27
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 KRTAP10-8P60410 259 aa7.12□□□□□ -1.27
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.12□□□□□ -1.27
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 UBR4Q5T4S7 5183 aa7.11□□□□□ -1.27
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 PRR15Q8IV56 129 aa7.1□□□□□ -1.27
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 K7EQZ3 153 aa7.09□□□□□ -1.27
SAA2-SAA4-201ENST00000524555 A0A087WVE0 104 aa7.08□□□□□ -1.28
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.3 ms