RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 A6NN06 94 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 VPREB1P12018 145 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 DNAH10OSP0CZ25 163 aa6.5□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 TENM3Q9P273 2699 aa6.49□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 A6NED7 52 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.48□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00208Q96KT6 92 aa6.47□□□□□ -1.37
TRPS1-211ENST00000520276 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 LIMD2Q9BT23 127 aa6.46□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 A0A0G2JQZ4 141 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1W2PNN7 141 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 C1orf137Q5JT78 98 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFB1O75438 58 aa6.45□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.44□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 NDUFS5O43920 106 aa6.44□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 Q75L30 129 aa6.43□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa6.43□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 DNHD1Q96M86 4753 aa6.43□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 Q8NBF4 154 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 C8orf87E5RJ46 101 aa6.42□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 MOBPQ13875 183 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 KCNQ1DNQ9H478 68 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 MP68P56378 58 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 C7orf33Q8WU49 177 aa6.41□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 TNP2Q05952 138 aa6.4□□□□□ -1.38
TRPS1-211ENST00000520276 Q9BRP9 147 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 SPRR4Q96PI1 79 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 PRR34Q9NV39 138 aa6.39□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 H0Y9P7 68 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 SERTAD4-AS1Q5TG53 156 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 COA5Q86WW8 74 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 RPL37AP8A6NKH3 93 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.37□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 PRAC1Q96KF2 57 aa6.36□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.35□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087WTM6 91 aa6.35□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 A0A1B0GW54 56 aa6.35□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 SPINK7P58062 85 aa6.35□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 C9orf163Q8N9P6 203 aa6.34□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 NKAPP1Q8N9T2 125 aa6.34□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 TENM2Q9NT68 2774 aa6.34□□□□□ -1.39
TRPS1-211ENST00000520276 H3BS24 57 aa6.34□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZRX8 168 aa6.34□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 RTL8CO15255 209 aa6.33□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 C15orf56Q8N910 161 aa6.33□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZR54 194 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.32□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 FAM168BA1KXE4 195 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00313P59037 77 aa6.31□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 A0A087WSZ3 146 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 PCOTHQ58A44 107 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa6.3□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 CASC2Q6XLA1 102 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 ANK2Q01484 3957 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 IGFL1Q6UW32 110 aa6.29□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 CNBPP62633 177 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.27□□□□□ -1.41
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-211ENST00000520276 H3BPC8 53 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.25□□□□□ -1.41
TRPS1-211ENST00000520276 SPRR1AP35321 89 aa6.24□□□□□ -1.41
TRPS1-211ENST00000520276 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa6.22□□□□□ -1.41
TRPS1-211ENST00000520276 FAM229AH3BQW9 127 aa6.21□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 LINC01554Q52M75 96 aa6.21□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 HRES1P13985 223 aa6.2□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 COL7A1Q02388 2944 aa6.19□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 CHTF8P0CG12 524 aa6.19□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 A8MWP4 228 aa6.18□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 KRTAP10-2P60368 255 aa6.17□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 PRLHP81277 87 aa6.17□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 A0A096LNI7 61 aa6.17□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 DNAH9Q9NYC9 4486 aa6.17□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 H0Y9J4 135 aa6.16□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 PRR26Q8N8Z3 221 aa6.16□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.16□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.16□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 LINC00472Q9H8W2 130 aa6.15□□□□□ -1.42
TRPS1-211ENST00000520276 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP6.15□□□□□ -1.43
TRPS1-211ENST00000520276 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
TRPS1-211ENST00000520276 REG3GQ6UW15 175 aa6.14□□□□□ -1.43
TRPS1-211ENST00000520276 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa6.13□□□□□ -1.43
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