RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515011.5

PDE4D-223, Transcript of phosphodiesterase 4D, human

TSL 1 (best)

Gene PDE4D, Length 2,175 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDE4D-223	ENST00000515011	DNAH17	Q9UFH2	4485 aa		14.15	□□□□□ -0.14
PDE4D-223	ENST00000515011	IGLV8-61	A0A075B6I0	122 aa		14.15	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	UQCRQ	O14949	82 aa		14.15	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	SPRR1B	P22528	89 aa		14.15	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	KRTAP13-1	Q8IUC0	172 aa		14.15	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		14.15	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	COX7C	P15954	63 aa		14.14	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	DNAH6	Q9C0G6	4158 aa		14.12	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	SERP2	Q8N6R1	65 aa		14.1	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	IGFL1	Q6UW32	110 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	HECTD4	Q9Y4D8	3996 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	CRYGA	P11844	174 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		14.09	□□□□□ -0.15
PDE4D-223	ENST00000515011	BPY2	O14599	106 aa		14.06	□□□□□ -0.16
PDE4D-223	ENST00000515011	C9orf153	Q5TBE3	101 aa		14.05	□□□□□ -0.16
PDE4D-223	ENST00000515011		A0A0G2JQZ4	141 aa		14.03	□□□□□ -0.16
PDE4D-223	ENST00000515011	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		14.03	□□□□□ -0.16
PDE4D-223	ENST00000515011	IGKV4-1	P06312	121 aa		14.02	□□□□□ -0.16
PDE4D-223	ENST00000515011		Q8N9L7	120 aa		14	□□□□□ -0.17
PDE4D-223	ENST00000515011	PSORS1C2	Q9UIG4	136 aa		13.99	□□□□□ -0.17
PDE4D-223	ENST00000515011	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		13.95	□□□□□ -0.18
PDE4D-223	ENST00000515011	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		13.93	□□□□□ -0.18
PDE4D-223	ENST00000515011	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		13.92	□□□□□ -0.18
PDE4D-223	ENST00000515011		A0A087WSZ3	146 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PDE4D-223	ENST00000515011	LINC00483	Q53H64	154 aa		13.91	□□□□□ -0.18
PDE4D-223	ENST00000515011	KRTAP10-2	P60368	255 aa		13.9	□□□□□ -0.18
PDE4D-223	ENST00000515011	DSCR10	P59022	87 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF706	Q9Y5V0	76 aa	Predicted RBP	13.89	□□□□□ -0.19
PDE4D-223	ENST00000515011	DNAH8	Q96JB1	4490 aa		13.89	□□□□□ -0.19
PDE4D-223	ENST00000515011	ZNF861P	O60384	105 aa		13.88	□□□□□ -0.19
PDE4D-223	ENST00000515011	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	13.87	□□□□□ -0.19
PDE4D-223	ENST00000515011	FRAS1	Q86XX4	4008 aa		13.87	□□□□□ -0.19
PDE4D-223	ENST00000515011	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		13.85	□□□□□ -0.19
PDE4D-223	ENST00000515011	DNAH11	Q96DT5	4516 aa		13.84	□□□□□ -0.19
PDE4D-223	ENST00000515011	DNAH5	Q8TE73	4624 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PDE4D-223	ENST00000515011		K7EQZ3	153 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PDE4D-223	ENST00000515011	FAM30A	Q9NZY2	134 aa		13.82	□□□□□ -0.2
PDE4D-223	ENST00000515011	IGLV9-49	A0A0B4J1Y8	123 aa		13.8	□□□□□ -0.2
PDE4D-223	ENST00000515011	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
PDE4D-223	ENST00000515011	CIRBP-AS1	Q8TBR5	109 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PDE4D-223	ENST00000515011	IGLV7-43	P04211	117 aa		13.79	□□□□□ -0.2
PDE4D-223	ENST00000515011	C20orf197	Q8N268	126 aa		13.78	□□□□□ -0.2
PDE4D-223	ENST00000515011		Q6ZSA8	131 aa		13.77	□□□□□ -0.21
PDE4D-223	ENST00000515011	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		13.76	□□□□□ -0.21
PDE4D-223	ENST00000515011	OCR1	Q9BZK8	76 aa		13.75	□□□□□ -0.21
PDE4D-223	ENST00000515011	KRTAP10-1	P60331	282 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PDE4D-223	ENST00000515011	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		13.74	□□□□□ -0.21
PDE4D-223	ENST00000515011	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PDE4D-223	ENST00000515011	KMT2C	Q8NEZ4	4911 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
PDE4D-223	ENST00000515011	FAT2	Q9NYQ8	4349 aa		13.73	□□□□□ -0.21
PDE4D-223	ENST00000515011	TMEM258	P61165	79 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PDE4D-223	ENST00000515011	KLKP1	Q107X0	134 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PDE4D-223	ENST00000515011	MOBP	Q13875	183 aa		13.7	□□□□□ -0.22
PDE4D-223	ENST00000515011	ANAPC11	Q9NYG5	84 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PDE4D-223	ENST00000515011	PKD1	P98161	4303 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PDE4D-223	ENST00000515011	HCG22	E2RYF7	251 aa		13.69	□□□□□ -0.22
PDE4D-223	ENST00000515011	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		13.67	□□□□□ -0.22
PDE4D-223	ENST00000515011		A8MWP4	228 aa		13.64	□□□□□ -0.23
PDE4D-223	ENST00000515011		J3KT08	172 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PDE4D-223	ENST00000515011	PRR15	Q8IV56	129 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PDE4D-223	ENST00000515011	SNURF	Q9Y675	71 aa		13.62	□□□□□ -0.23
PDE4D-223	ENST00000515011	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PDE4D-223	ENST00000515011	HRCT1	Q6UXD1	115 aa		13.61	□□□□□ -0.23
PDE4D-223	ENST00000515011		Q96NJ1	140 aa		13.6	□□□□□ -0.23
PDE4D-223	ENST00000515011		H7BZZ5	65 aa		13.59	□□□□□ -0.23
PDE4D-223	ENST00000515011	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PDE4D-223	ENST00000515011	LCE6A	A0A183	80 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PDE4D-223	ENST00000515011	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
PDE4D-223	ENST00000515011		A0A0U1RQV1	116 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PDE4D-223	ENST00000515011	NDUFC1	O43677	76 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PDE4D-223	ENST00000515011	CASC2	Q6XLA1	102 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	RYR3	Q15413	4870 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	NDUFB1	O75438	58 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	LRP1B	Q9NZR2	4599 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	SSBP3-AS1	Q7Z2R9	100 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	RYR2	Q92736	4967 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	CD164	Q04900	197 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	FAM236C	P0DP71	79 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PDE4D-223	ENST00000515011	RPS28	P62857	69 aa	Known RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PDE4D-223	ENST00000515011	C5orf47	Q569G3	176 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PDE4D-223	ENST00000515011	FAM229B	Q4G0N7	80 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PDE4D-223	ENST00000515011		A0A087X002	238 aa		13.41	□□□□□ -0.26
PDE4D-223	ENST00000515011	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		13.39	□□□□□ -0.27
PDE4D-223	ENST00000515011	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	13.39	□□□□□ -0.27
PDE4D-223	ENST00000515011		A0A1B0GVX0	72 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4D-223	ENST00000515011	hDV103S1	A0JD37	113 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4D-223	ENST00000515011	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		13.38	□□□□□ -0.27
PDE4D-223	ENST00000515011	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4D-223	ENST00000515011	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4D-223	ENST00000515011	CDK2AP2	O75956	126 aa		13.37	□□□□□ -0.27
PDE4D-223	ENST00000515011		A0A1B0GVY2	172 aa		13.35	□□□□□ -0.27
PDE4D-223	ENST00000515011	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	13.34	□□□□□ -0.27
PDE4D-223	ENST00000515011	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		13.33	□□□□□ -0.28
PDE4D-223	ENST00000515011	MP68	P56378	58 aa		13.31	□□□□□ -0.28
PDE4D-223	ENST00000515011	PKHD1	P08F94	4074 aa		13.3	□□□□□ -0.28
PDE4D-223	ENST00000515011	VPS13B	Q7Z7G8	4022 aa		13.3	□□□□□ -0.28

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