RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa7.43□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM229AH3BQW9 127 aa7.43□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMIM29Q86T20 159 aa7.43□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PLA2G1BP04054 148 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPINK6Q6UWN8 80 aa7.42□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 XGP55808 180 aa7.41□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PKD1P98161 4303 aa7.4□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV9-49A0A0B4J1Y8 123 aa7.4□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00643Q86TS7 51 aa7.4□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q8NBF4 154 aa7.4□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SIGMAR1Q99720 223 aa7.4□□□□□ -1.22
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAT2Q9NYQ8 4349 aa7.39□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDK2AP2O75956 126 aa7.39□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM229BQ4G0N7 80 aa7.39□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NREPQ16612 68 aa7.37□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa7.37□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGFL1Q6UW32 110 aa7.37□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00846Q9NV44 126 aa7.37□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAH11Q96DT5 4516 aa7.37□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CRYGAP11844 174 aa7.36□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa7.36□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CDIP1Q9H305 208 aa7.36□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RYR2Q92736 4967 aa7.36□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MOBPQ13875 183 aa7.35□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q6Q795 121 aa7.34□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.34□□□□□ -1.23
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1W2PNM2 257 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SS18L2Q9UHA2 77 aa7.33□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DNAH8Q96JB1 4490 aa7.32□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C4orf48Q5BLP8 95 aa7.31□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q6ZVQ6 151 aa7.31□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IMUPQ9GZP8 106 aa7.31□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CD164Q04900 197 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANAPC11Q9NYG5 84 aa7.3□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BPY2O14599 106 aa7.29□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CXCL6P80162 114 aa7.29□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A087WSZ3 146 aa7.28□□□□□ -1.24
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MT-ATP8P03928 68 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TYMSOSQ8TAI1 123 aa7.27□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.25□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 J3KT08 172 aa7.25□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q5VSD8 79 aa7.25□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HRCT1Q6UXD1 115 aa7.25□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A0G2JQZ4 141 aa7.24□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SCGB1A1P11684 91 aa7.24□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPAG11AQ6PDA7 123 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LIMD2Q9BT23 127 aa7.23□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PKHD1P08F94 4074 aa7.22□□□□□ -1.25
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A087X002 238 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NDUFB1O75438 58 aa7.21□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRP1BQ9NZR2 4599 aa7.2□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPINK1P00995 79 aa7.19□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.19□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q8N1X5 172 aa7.19□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRR26Q8N8Z3 221 aa7.17□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00304Q8N9R0 145 aa7.17□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.16□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV4-1P06312 121 aa7.15□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q5XG85 94 aa7.15□□□□□ -1.26
HOXC-AS2-201ENST00000513533 VPS13BQ7Z7G8 4022 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00472Q9H8W2 130 aa7.14□□□□□ -1.27
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A8MWP4 228 aa7.13□□□□□ -1.27
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RYR3Q15413 4870 aa7.12□□□□□ -1.27
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATOX1O00244 68 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.11□□□□□ -1.27
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.1□□□□□ -1.27
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DSCR10P59022 87 aa7.09□□□□□ -1.27
HOXC-AS2-201ENST00000513533 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A087WVE0 104 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRR15Q8IV56 129 aa7.08□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 K7EQZ3 153 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q8N9L7 120 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ANAPC13Q9BS18 74 aa7.07□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HCG22E2RYF7 251 aa7.06□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q96NJ1 140 aa7.05□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A1B0GVX0 72 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OXTP01178 125 aa7.04□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C8orf87E5RJ46 101 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1orf195Q5TG92 126 aa7.03□□□□□ -1.28
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CASC2Q6XLA1 102 aa7.02□□□□□ -1.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCP4P48539 62 aa7.01□□□□□ -1.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP10-8P60410 259 aa7.01□□□□□ -1.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 hDV103S1A0JD37 113 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.99□□□□□ -1.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00313P59037 77 aa6.98□□□□□ -1.29
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SERP2Q8N6R1 65 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.3 ms