RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 A0A1W2PPM0 123 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 Q8NDZ9 215 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 KCNQ1DNQ9H478 68 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 DNAH8Q96JB1 4490 aa4.54□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 INAFM2P0DMQ5 153 aa4.53□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 COX7BP24311 80 aa4.53□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP10-1P60331 282 aa4.53□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 ATXN8Q156A1 80 aa4.53□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 C6orf99Q4VX62 202 aa4.53□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.53□□□□□ -1.68
HERC3-210ENST00000512194 A0A1B0GX51 115 aa4.52□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 DNAL4O96015 105 aa4.52□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP4.52□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 RNF213Q63HN8 5207 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 H3BQ85 93 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 PANO1I0J062 215 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 UBE2AP49459 152 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZSA8 131 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 SPCS1Q9Y6A9 102 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 SCXQ7RTU7 201 aa4.5□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.5□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 hADV29S1A0JD25 119 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 K7EP34 96 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 BCE1O60756 84 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 TRACP01848 142 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 SPRR1AP35321 89 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP4.49□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa4.49□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 H0Y9J4 135 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 LST1O00453 97 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 OCIAD2Q56VL3 154 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 Q5VSD8 79 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 LINC00575Q6W349 94 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZRX8 168 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 CLEC2BQ92478 149 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa4.48□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 A0A1B0GV90 55 aa4.47□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 TCL1BO95988 128 aa4.47□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 C1orf137Q5JT78 98 aa4.47□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 PSORS1C2Q9UIG4 136 aa4.47□□□□□ -1.69
HERC3-210ENST00000512194 H3BMG7 143 aa4.46□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 DSCR10P59022 87 aa4.46□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 LCE1FQ5T754 118 aa4.46□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP4.46□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.46□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 C9JAW5 83 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 F8W1H4 67 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 HIGD2AQ9BW72 106 aa4.45□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP4.45□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 LRP2P98164 4655 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 ZNF861PO60384 105 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 BAALC-AS2P0C853 105 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP4.44□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 SMCR5Q8TEV8 140 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 PPDPFLQ8WWR9 84 aa4.44□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 H3BT86 120 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 IGLV7-43P04211 117 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 HAMPP81172 84 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 PRLHP81277 87 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 Q6ZQY7 126 aa4.43□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 CXCL6P80162 114 aa4.42□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.42□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 ANKRD29Q8N6D5 301 aa4.42□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 DEFB105AQ8NG35 78 aa4.42□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.41□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 F8WEM9 126 aa4.41□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 Q9BRP9 147 aa4.41□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa4.41□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 TNXBP22105 4242 aa4.41□□□□□ -1.7
HERC3-210ENST00000512194 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.4□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa4.39□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 SPINK6Q6UWN8 80 aa4.39□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa4.38□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 ERC2-IT1O76042 136 aa4.38□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 MTURNQ8N3F0 131 aa4.38□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.37□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 ST20-AS1Q8NBB2 130 aa4.37□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 LINC01600Q96MT4 127 aa4.37□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 SPRR4Q96PI1 79 aa4.37□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 PRO0461Q9UI25 63 aa4.37□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 J3QR89 54 aa4.36□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 PDE6GP18545 87 aa4.36□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 SPRR1BP22528 89 aa4.36□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 TEN1Q86WV5 123 aa4.36□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 DSCR8Q96T75 97 aa4.36□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa4.35□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 PRR4Q16378 134 aa4.35□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 ETDBQ3ZM63 59 aa4.35□□□□□ -1.71
HERC3-210ENST00000512194 LINC00483Q53H64 154 aa4.35□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms