RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498534.5

CNOT4-211, Transcript of CCR4-NOT transcription complex subunit 4, humanhuman

TSL 2

Gene CNOT4, Length 481 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.43□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.43□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 TTTY13Q9BZ97 58 aa6.43□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 IGLV5-48A0A075B6I7 105 aa6.42□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 IFITM1P13164 125 aa6.42□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0G2JQZ4 141 aa6.41□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H2BKO60814 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H2BJP06899 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H2BOP23527 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H2BBP33778 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H2BDP58876 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H2BCP62807 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST2H2BEQ16778 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZVH6 145 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H2BHQ93079 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H2BNQ99877 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H2BMQ99879 126 aa6.4□□□□□ -1.38
CNOT4-211ENST00000498534 F8WEM9 126 aa6.38□□□□□ -1.39
CNOT4-211ENST00000498534 C3orf79P0CE67 100 aa6.38□□□□□ -1.39
CNOT4-211ENST00000498534 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa6.38□□□□□ -1.39
CNOT4-211ENST00000498534 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa6.37□□□□□ -1.39
CNOT4-211ENST00000498534 KRTDAPP60985 99 aa6.37□□□□□ -1.39
CNOT4-211ENST00000498534 VAMP3Q15836 100 aa6.37□□□□□ -1.39
CNOT4-211ENST00000498534 MUSTN1Q8IVN3 82 aa6.37□□□□□ -1.39
CNOT4-211ENST00000498534 C20orf202A1L168 122 aa6.36□□□□□ -1.39
CNOT4-211ENST00000498534 SMIM11BQ8TCY0 68 aa6.35□□□□□ -1.39
CNOT4-211ENST00000498534 PCP2Q8IVA1 136 aa6.34□□□□□ -1.39
CNOT4-211ENST00000498534 Q6JHZ5 121 aa6.33□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.33□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 Q6Q795 121 aa6.32□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 ATOH7Q8N100 152 aa6.31□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 hADV29S1A0JD25 119 aa6.3□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00575Q6W349 94 aa6.3□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.29□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.29□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 Q6ZQY7 126 aa6.29□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 CLEC2BQ92478 149 aa6.29□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa6.29□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 Q75L30 129 aa6.28□□□□□ -1.4
CNOT4-211ENST00000498534 IGFL1Q6UW32 110 aa6.27□□□□□ -1.41
CNOT4-211ENST00000498534 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.26□□□□□ -1.41
CNOT4-211ENST00000498534 LST1O00453 97 aa6.25□□□□□ -1.41
CNOT4-211ENST00000498534 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
CNOT4-211ENST00000498534 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.24□□□□□ -1.41
CNOT4-211ENST00000498534 Q96NJ1 140 aa6.24□□□□□ -1.41
CNOT4-211ENST00000498534 SCGB1D1O95968 90 aa6.23□□□□□ -1.41
CNOT4-211ENST00000498534 HSBP1L1C9JCN9 74 aa6.22□□□□□ -1.41
CNOT4-211ENST00000498534 CFC1P0CG37 223 aa6.21□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 BVES-AS1Q5T3Y7 98 aa6.21□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.2□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 SNCGO76070 127 aa6.2□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 SS18L2Q9UHA2 77 aa6.2□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 H3BUT2 72 aa6.19□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 C12orf57Q99622 126 aa6.19□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.17□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H4GQ99525 98 aa6.17□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 S100A2P29034 98 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 TEN1Q86WV5 123 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.16□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 A8MUU9 505 aa6.15□□□□□ -1.42
CNOT4-211ENST00000498534 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa6.14□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.14□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.12□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 H0YGX0 51 aa6.12□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 HIST1H2BLQ99880 126 aa6.12□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 A0A087WSZ3 146 aa6.11□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.11□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 RAB37Q96AX2 223 aa6.11□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 H3BMG7 143 aa6.1□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 USH2AO75445 5202 aa6.09□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.09□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 FAM236CP0DP71 79 aa6.09□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 DSCR10P59022 87 aa6.09□□□□□ -1.43
CNOT4-211ENST00000498534 FABP2P12104 132 aa6.08□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 LINC00313P59037 77 aa6.08□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 S100A6P06703 90 aa6.07□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 COX8AP10176 69 aa6.07□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 SIGMAR1Q99720 223 aa6.07□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 DLEU1O43261 78 aa6.06□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.06□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 FAM218AQ96MZ4 157 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 SSPOA2VEC9 5147 aa6.05□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 A0A0B4J2C4 111 aa6.04□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1B0GX51 115 aa6.04□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 IGKV4-1P06312 121 aa6.03□□□□□ -1.44
CNOT4-211ENST00000498534 A0A1W2PNM2 257 aa6.02□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.02□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 MT2AP02795 61 aa6.02□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.02□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 C14orf144Q96I85 54 aa6.01□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 HIGD1BQ9P298 99 aa6.01□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.01□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
CNOT4-211ENST00000498534 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6□□□□□ -1.45
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