RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498517.5

ARHGEF3-215, Transcript of Rho guanine nucleotide exchange factor 3, humanhuman

TSL 5

Gene ARHGEF3, Length 787 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF3-215ENST00000498517 RYR2Q92736 4967 aa3.6□□□□□ -1.83
ARHGEF3-215ENST00000498517 DPH3Q96FX2 82 aa3.59□□□□□ -1.83
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ARHGEF3-215ENST00000498517 HERC2O95714 4834 aa3.58□□□□□ -1.84
ARHGEF3-215ENST00000498517 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.58□□□□□ -1.84
ARHGEF3-215ENST00000498517 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa3.58□□□□□ -1.84
ARHGEF3-215ENST00000498517 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa3.58□□□□□ -1.84
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ARHGEF3-215ENST00000498517 TLX1NBP0CAT3 122 aa3.57□□□□□ -1.84
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ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa3.57□□□□□ -1.84
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ARHGEF3-215ENST00000498517 FAM236CP0DP71 79 aa3.49□□□□□ -1.85
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ARHGEF3-215ENST00000498517 H7BZZ5 65 aa3.46□□□□□ -1.86
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ARHGEF3-215ENST00000498517 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.46□□□□□ -1.86
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ARHGEF3-215ENST00000498517 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
ARHGEF3-215ENST00000498517 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
ARHGEF3-215ENST00000498517 SMIM29Q86T20 159 aa3.45□□□□□ -1.86
ARHGEF3-215ENST00000498517 PLAC8Q9NZF1 115 aa3.45□□□□□ -1.86
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ARHGEF3-215ENST00000498517 KRTAP10-1P60331 282 aa3.44□□□□□ -1.86
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